More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0672 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  100 
 
 		 379 aa  771    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  99.19 
 
 		 372 aa  747    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  75.99 
 
 		 349 aa  563  1.0000000000000001e-159  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  70.54 
 
 		 366 aa  505  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  62.63 
 
 		 380 aa  464  9.999999999999999e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  58.36 
 
 		 344 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  57.92 
 
 		 342 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  56.96 
 
 		 384 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2392  cobalamin synthesis protein P47K  57.53 
 
 		 378 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2341  cobalamin synthesis protein P47K  57.26 
 
 		 378 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3717  cobalamin synthesis protein/P47K  60.22 
 
 		 379 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05171  G3E family GTPase  55.83 
 
 		 362 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.842312  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2644  cobalamin synthesis protein P47K  55.91 
 
 		 373 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0491  hypothetical protein  55.56 
 
 		 362 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0830931  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  55.91 
 
 		 362 aa  395  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0441  cobalamin synthesis protein, P47K  56.59 
 
 		 382 aa  390  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.319844  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  55.96 
 
 		 338 aa  388  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05541  G3E family GTPase  51.94 
 
 		 357 aa  362  5.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.427683  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  49.03 
 
 		 349 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0228  cobalamin synthesis protein/P47K  50 
 
 		 353 aa  330  3e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0891  cobalamin synthesis protein P47K  47.24 
 
 		 346 aa  329  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441497  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0865  cobalamin synthesis protein P47K  47.24 
 
 		 346 aa  328  7e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  41.6 
 
 		 327 aa  299  6e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05461  G3E family GTPase  60.38 
 
 		 383 aa  275  8e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412764  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  55.67 
 
 		 341 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  38.71 
 
 		 355 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  36.75 
 
 		 361 aa  219  6e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  37.01 
 
 		 350 aa  218  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  35.83 
 
 		 353 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  38.07 
 
 		 343 aa  211  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  38.54 
 
 		 360 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  34.46 
 
 		 335 aa  209  5e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  34.42 
 
 		 323 aa  209  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  34.23 
 
 		 320 aa  209  7e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  33.25 
 
 		 323 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  35.39 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  33.25 
 
 		 323 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  36.63 
 
 		 354 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  36.02 
 
 		 350 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  35.66 
 
 		 320 aa  206  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  35.26 
 
 		 360 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  34.14 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  36.44 
 
 		 349 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  34.2 
 
 		 323 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  37.85 
 
 		 367 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  35.48 
 
 		 358 aa  204  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  37.07 
 
 		 353 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  31.99 
 
 		 400 aa  203  4e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  39.2 
 
 		 374 aa  203  4e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  38.34 
 
 		 369 aa  203  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  36.12 
 
 		 355 aa  203  5e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3108  cobalamin synthesis protein, P47K  36.36 
 
 		 362 aa  202  8e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190819  normal  0.352092 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  35.62 
 
 		 329 aa  202  9e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3375  predicted protein  36.06 
 
 		 388 aa  201  9.999999999999999e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  36.41 
 
 		 364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  33.16 
 
 		 323 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  39.73 
 
 		 393 aa  199  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2949  cobalamin synthesis protein P47K  35.7 
 
 		 369 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.645626  hitchhiker  0.00151664 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  47.06 
 
 		 460 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  36.31 
 
 		 320 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  47.06 
 
 		 460 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  36.68 
 
 		 365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  35.48 
 
 		 363 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  35.58 
 
 		 375 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  47.52 
 
 		 457 aa  196  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  46.04 
 
 		 460 aa  193  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  31.05 
 
 		 323 aa  192  8e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  45.59 
 
 		 449 aa  192  9e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  45.77 
 
 		 452 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  33.69 
 
 		 337 aa  191  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  45.27 
 
 		 449 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  45.05 
 
 		 449 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4200  cobalamin synthesis protein P47K  33.69 
 
 		 336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000951795  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  33.87 
 
 		 326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2829  cobalamin synthesis protein P47K  30.99 
 
 		 406 aa  190  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.62152 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  44.71 
 
 		 347 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0473  cobalamin synthesis protein, P47K  31.29 
 
 		 400 aa  189  7e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0485  cobalamin synthesis protein P47K  31.29 
 
 		 400 aa  189  7e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1724  cobalamin synthesis protein P47K  46.6 
 
 		 493 aa  189  9e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651527 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  45.59 
 
 		 345 aa  189  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2203  putative regulatory protein (nitrile hydratase activator like)  30.52 
 
 		 401 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.514388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  45.37 
 
 		 328 aa  187  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  45.37 
 
 		 328 aa  187  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  46.23 
 
 		 364 aa  187  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2074  cobalamin synthesis protein P47K  33.16 
 
 		 349 aa  186  6e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0608  cobalamin synthesis protein P47K  31.06 
 
 		 408 aa  185  9e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.452974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4067  cobalamin synthesis protein, P47K  29.77 
 
 		 403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2707  cobalamin synthesis protein P47K  30.39 
 
 		 405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.217107 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1091  cobalamin synthesis protein P47K  32.11 
 
 		 406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  32.81 
 
 		 347 aa  183  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3246  cobalamin synthesis protein/P47K  31.24 
 
 		 437 aa  184  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499544 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2995  cobalamin synthesis protein P47K  33.65 
 
 		 410 aa  184  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1476  cobalamin synthesis protein P47K  30.52 
 
 		 408 aa  184  3e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.709417  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  31.38 
 
 		 417 aa  183  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1456  cobalamin synthesis protein P47K  35.54 
 
 		 384 aa  183  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1893  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.94 
 
 		 446 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0218  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.94 
 
 		 446 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3520  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.94 
 
 		 446 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0005  CobW/P47K family protein  31.94 
 
 		 446 aa  183  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0005  CobW/P47K family protein  31.94 
 
 		 446 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>