94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0420 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0420  phycocyanin, alpha subunit  100 
 
 		 162 aa  333  3.9999999999999995e-91  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161812  decreased coverage  0.00995001 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1909  phycocyanin, alpha subunit  93.21 
 
 		 162 aa  317  5e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0160  phycocyanin, alpha subunit  81.48 
 
 		 162 aa  282  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148087 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1696  phycocyanin, alpha subunit  79.01 
 
 		 162 aa  264  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0555284 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5048  phycocyanin, alpha subunit  74.07 
 
 		 162 aa  263  1e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2931  phycocyanin, alpha subunit  74.07 
 
 		 163 aa  259  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3075  phycocyanin, alpha subunit  80.25 
 
 		 162 aa  257  6e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3045  phycocyanin, alpha subunit  80.25 
 
 		 162 aa  257  6e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2872  phycocyanin, alpha subunit  72.67 
 
 		 163 aa  252  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0590768  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3488  phycocyanin subunit alpha  70.37 
 
 		 162 aa  244  4e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1053  phycocyanin, alpha subunit  75.16 
 
 		 163 aa  241  3e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607744  normal  0.0358189 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1048  phycocyanin, alpha subunit  75.16 
 
 		 163 aa  241  3e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.348249 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0296  phycocyanin  61.73 
 
 		 162 aa  216  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2926  phycobilisome protein  60.49 
 
 		 162 aa  207  5e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.700296 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1672  phycoerythrin class III alpha chain CpeA  42.42 
 
 		 155 aa  121  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.339524  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03861  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  42.42 
 
 		 155 aa  121  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.235935  normal  0.0388736 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0434  C-phycoerythrin class II alpha chain  39.39 
 
 		 165 aa  119  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5732  Phycobilisome protein  42.17 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0427  C-phycoerythrin class I alpha chain  42.51 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0528706 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03331  hypothetical protein  38.79 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4515  Phycobilisome protein  42.17 
 
 		 164 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.915449 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0983  phycobilisome protein  39.76 
 
 		 162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1902  C-phycoerythrin class I alpha chain  41.92 
 
 		 164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0996  phycobilisome protein  39.76 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.388342 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1894  C-phycoerythrin class II alpha chain  39.39 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22371  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  36.75 
 
 		 155 aa  99  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2786  Phycobilisome protein  30.82 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3315  Phycobilisome protein  30.82 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.613477  normal  0.164166 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2621  phycobilisome protein  31.45 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000016384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2634  Phycobilisome protein  29.56 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.515637 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2432  phycocyanin  31.87 
 
 		 161 aa  77  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4994  Phycobilisome protein  29.56 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0479  allophycocyanin alpha chain  29.56 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3650  phycobilisome protein  26.25 
 
 		 161 aa  72  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0327  allophycocyanin alpha chain  27.5 
 
 		 161 aa  72  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.858451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3741  Phycobilisome protein  27.61 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2197  allophycocyanin alpha chain  28.3 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.210931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1034  Phycobilisome protein  26.88 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347027  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1838  allophycocyanin, beta subunit  29.71 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3835  allophycocyanin, beta subunit  33.33 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4995  allophycocyanin, beta subunit  28.92 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2930  phycocyanin, beta subunit  33.33 
 
 		 173 aa  64.7  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3314  allophycocyanin, beta subunit  28.66 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1226  Phycobilisome protein  26.25 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3635  phycobilisome protein  27.16 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1256  Phycobilisome protein  26.25 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000277966 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2635  allophycocyanin, beta subunit  28.92 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.872532 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0240  hypothetical protein  26.09 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2787  allophycocyanin, beta subunit  28.66 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2925  phycobilisome protein  31.62 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.743765 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0326  allophycocyanin, beta subunit  28.92 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1052  phycocyanin, beta subunit  29.32 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0614393 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2433  allophycocyanin subunit beta  28.31 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1047  phycocyanin, beta subunit  29.32 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264942 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3649  allophycocyanin, beta subunit  29.09 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1969  Phycobilisome protein  25 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2198  allophycocyanin, beta subunit  28.66 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0421  phycocyanin, beta subunit  30.77 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.444551  normal  0.0102401 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4519  Phycobilisome protein  33.33 
 
 		 194 aa  60.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0478  allophycocyanin subunit beta  28.66 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2622  allophycocyanin subunit beta  29.01 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000519152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1133  allophycocyanin alpha-B chain  24.84 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.562521  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1908  phycocyanin, beta subunit  29.91 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0807  allophycocyanin, beta subunit  25.15 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0836  allophycocyanin, beta subunit  25.15 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5726  Phycobilisome protein  34.38 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3655  phycocyanin  26.54 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.792917  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3714  allophycocyanin subunit beta  26.28 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3074  phycocyanin, beta subunit  30.51 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3046  phycocyanin, beta subunit  30.51 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3489  phycocyanin subunit beta  30.97 
 
 		 173 aa  57.4  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.132274  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0297  phycocyanin  27.35 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1697  phycocyanin, beta subunit  30.51 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0569102 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0146  allophycocyanin subunit beta  31.62 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0161  phycocyanin, beta subunit  29.06 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0157143 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2158  allophycocyanin, beta subunit  31.62 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117543 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1341  allophycocyanin alpha-B chain  24.2 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.445808 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4799  phycobilisome protein  27.56 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0384087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5049  phycocyanin, beta subunit  29.66 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2871  phycocyanin, beta subunit  27.93 
 
 		 173 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.001828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0997  phycobilisome protein  27.73 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1206  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  23.08 
 
 		 174 aa  48.1  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.74383 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3240  phycobilisome protein  28.57 
 
 		 192 aa  48.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03321  phycobilisome protein  27.42 
 
 		 182 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.992978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0435  C-phycoerythrin class II beta chain  25.97 
 
 		 193 aa  46.6  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.630208 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1264  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  23.08 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22381  phycobilisome protein (phycoerythrin beta-subunit)  26.09 
 
 		 181 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0984  phycobilisome protein  27.35 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2202  allophycocyanin, beta subunit  23.49 
 
 		 169 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000292042 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1893  C-phycoerythrin class II beta chain  24.86 
 
 		 178 aa  43.9  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4516  Phycobilisome protein  26.43 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.667174  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0802  allophycocyanin alpha chain-like  31.18 
 
 		 195 aa  42.4  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.764861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4811  Phycobilisome protein  22.22 
 
 		 306 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1903  C-phycoerythrin class I beta chain  26.27 
 
 		 184 aa  40.4  0.009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>