More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0401 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1928  cell division protein  84.71 
 
 		 412 aa  698    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229986  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0401  cell division protein  100 
 
 		 412 aa  805    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.908892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22691  cell division membrane protein  75.59 
 
 		 427 aa  594  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.260767 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17001  cell division membrane protein  67.09 
 
 		 426 aa  518  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.746049 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1152  cell division membrane protein  56.48 
 
 		 424 aa  440  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  51.12 
 
 		 423 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20261  cell division membrane protein  56.48 
 
 		 424 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.36733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17871  cell division membrane protein  51.61 
 
 		 422 aa  425  1e-118  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17711  cell division membrane protein  52.45 
 
 		 422 aa  415  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1672  rod shape determining protein  52.2 
 
 		 422 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.111343  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  51.62 
 
 		 421 aa  400  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  51.41 
 
 		 417 aa  387  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4584  cell cycle protein  45.76 
 
 		 438 aa  366  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  48.71 
 
 		 417 aa  362  5.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  48.71 
 
 		 417 aa  362  5.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  48.86 
 
 		 419 aa  359  5e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2623  rod shape-determining protein RodA  46.25 
 
 		 437 aa  352  5e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  48.03 
 
 		 426 aa  347  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  38.42 
 
 		 380 aa  223  6e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  35.05 
 
 		 366 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  38.44 
 
 		 365 aa  220  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  36.54 
 
 		 378 aa  217  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  36.56 
 
 		 372 aa  212  9e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  39.29 
 
 		 387 aa  212  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  35.54 
 
 		 366 aa  209  6e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  36.03 
 
 		 366 aa  208  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  36.65 
 
 		 379 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  34.89 
 
 		 371 aa  208  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  35.03 
 
 		 378 aa  207  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  36.65 
 
 		 379 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  32.82 
 
 		 379 aa  207  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  36.52 
 
 		 377 aa  207  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  33.53 
 
 		 369 aa  206  6e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  38.44 
 
 		 390 aa  204  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  37.28 
 
 		 368 aa  203  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  33.52 
 
 		 376 aa  203  4e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  33.85 
 
 		 366 aa  202  9e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  32.04 
 
 		 374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  34.57 
 
 		 366 aa  200  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  38.34 
 
 		 412 aa  200  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0079  putative rod shape-determining transmembrane protein  36.36 
 
 		 385 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2957  rod shape-determining protein RodA  36.6 
 
 		 390 aa  200  5e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.539996  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3647  rod shape-determining protein RodA  36.6 
 
 		 390 aa  200  5e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06110  rod shape-determining protein RodA  37.61 
 
 		 404 aa  199  7.999999999999999e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000223269 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3400  rod shape-determining protein RodA  35.64 
 
 		 384 aa  199  7.999999999999999e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293133  normal  0.487857 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3371  rod shape-determining protein RodA  34.2 
 
 		 384 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  36.34 
 
 		 382 aa  198  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14200  cell division membrane protein  35.11 
 
 		 405 aa  197  3e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  32.84 
 
 		 366 aa  197  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  35.48 
 
 		 372 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0351  rod shape-determining protein RodA  35.01 
 
 		 407 aa  196  7e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000405805  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  34.06 
 
 		 365 aa  196  9e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0500  rod shape-determining protein RodA  34.55 
 
 		 384 aa  195  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107532 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1486  rod shape-determining protein RodA  35.25 
 
 		 389 aa  195  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2218  rod shape-determining protein RodA  36.97 
 
 		 373 aa  194  2e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.466784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  32.83 
 
 		 371 aa  194  2e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  33.93 
 
 		 379 aa  194  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  34.47 
 
 		 369 aa  194  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  36.23 
 
 		 384 aa  194  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  36.83 
 
 		 373 aa  194  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0846  rod shape-determining protein RodA  36.25 
 
 		 386 aa  194  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0813507 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  38.92 
 
 		 388 aa  193  4e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  34.26 
 
 		 368 aa  192  8e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0420  cell cycle protein  35.85 
 
 		 408 aa  192  8e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000126174  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  34.26 
 
 		 368 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  34.26 
 
 		 368 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1106  cell cycle protein  30.85 
 
 		 371 aa  192  1e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.860681  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  34.26 
 
 		 368 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  33.97 
 
 		 371 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0474  rod shape-determining protein RodA  33.06 
 
 		 378 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268193  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1091  rod shape-determining protein RodA  36.6 
 
 		 384 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  35.98 
 
 		 363 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  35.19 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1009  rod shape-determining protein RodA  34.2 
 
 		 376 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  35.48 
 
 		 368 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0322  rod shape-determining protein RodA  37.75 
 
 		 382 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  34.26 
 
 		 367 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  34.26 
 
 		 367 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0631  rod shape-determining protein RodA  39.53 
 
 		 418 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  35.89 
 
 		 370 aa  190  4e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  35.48 
 
 		 368 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1730  rod shape-determining protein RodA  33.92 
 
 		 407 aa  189  7e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0257403  decreased coverage  0.00417518 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  34.91 
 
 		 373 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1919  rod shape-determining protein RodA  38.37 
 
 		 360 aa  189  8e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.403487  hitchhiker  0.000000909205 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  37.98 
 
 		 370 aa  189  9e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  33.98 
 
 		 367 aa  189  9e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2186  Sfr protein  40.53 
 
 		 407 aa  188  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117598  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  35.19 
 
 		 368 aa  189  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  34.91 
 
 		 373 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2188  rod shape-determining protein RodA  36.61 
 
 		 371 aa  189  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0470446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  35.19 
 
 		 368 aa  188  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4402  putative rod shape-determining protein, rodA  36.89 
 
 		 382 aa  188  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0941  rod shape-determining protein RodA  37.66 
 
 		 384 aa  188  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  32.34 
 
 		 366 aa  187  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  37.98 
 
 		 370 aa  187  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2500  rod shape-determining protein RodA  37.25 
 
 		 382 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3130  rod shape-determining protein RodA  37.25 
 
 		 382 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.416509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3114  rod shape-determining protein RodA  37.25 
 
 		 382 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376248  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  33.92 
 
 		 368 aa  187  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3022  cell wall shape-determining protein  36.01 
 
 		 370 aa  187  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00135301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>