More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0187 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0187  UDP-galactose 4-epimerase  100 
 
 		 344 aa  707    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.611091  decreased coverage  0.00729822 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0215  UDP-glucose 4-epimerase  80.94 
 
 		 344 aa  577  1.0000000000000001e-163  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25441  UDP-glucose-4-epimerase  58.36 
 
 		 348 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8826 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3246  UDP-glucose 4-epimerase  56.6 
 
 		 338 aa  389  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42345  predicted protein  53.06 
 
 		 352 aa  378  1e-104  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.252628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2932  UDP-glucose 4-epimerase  54.01 
 
 		 337 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000357428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0776  UDP-glucose 4-epimerase  56.34 
 
 		 345 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0260  UDP-glucose 4-epimerase  54.34 
 
 		 353 aa  373  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.115261  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0227  UDP-glucose 4-epimerase  49.15 
 
 		 351 aa  368  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0501438  normal  0.38802 
 
 
-
 
NC_004310  BR1066  UDP-glucose 4-epimerase  54.6 
 
 		 335 aa  369  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0920176  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1236  UDP-galactose 4-epimerase  55.03 
 
 		 334 aa  371  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1774  UDP-galactose 4-epimerase  55.62 
 
 		 336 aa  371  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03064  UDP-glucose 4-epimerase  53.24 
 
 		 340 aa  370  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3002  UDP-glucose 4-epimerase  51.34 
 
 		 337 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12831  UDP-glucose-4-epimerase  53.14 
 
 		 355 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.225757  normal  0.0431014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2676  UDP-galactose 4-epimerase  53.37 
 
 		 337 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0763555  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1030  UDP-glucose 4-epimerase  54.44 
 
 		 335 aa  370  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1410  UDP-glucose 4-epimerase  54.44 
 
 		 339 aa  368  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.935662  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5588  UDP-glucose 4-epimerase  50.74 
 
 		 338 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3965  UDP-glucose 4-epimerase  51.18 
 
 		 339 aa  365  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5574  UDP-glucose 4-epimerase  50.45 
 
 		 338 aa  365  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739221  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0713  UDP-glucose 4-epimerase  54.6 
 
 		 339 aa  367  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1384  UDP-glucose 4-epimerase  52.8 
 
 		 337 aa  365  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  53.08 
 
 		 337 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5636  UDP-glucose 4-epimerase  50.45 
 
 		 338 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2149  UDP-glucose 4-epimerase  53.71 
 
 		 335 aa  366  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1563  UDP-glucose 4-epimerase  53.55 
 
 		 337 aa  364  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  52.8 
 
 		 337 aa  367  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2224  UDP-glucose 4-epimerase  53.25 
 
 		 336 aa  365  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00168227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000160  UDP-glucose 4-epimerase  50.59 
 
 		 338 aa  364  1e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0154193  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1446  UDP-glucose 4-epimerase  52.07 
 
 		 339 aa  364  1e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000042923  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5388  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 336 aa  364  1e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1664  UDP-glucose 4-epimerase  53.08 
 
 		 337 aa  364  2e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2911  UDP-glucose 4-epimerase  54.87 
 
 		 342 aa  364  2e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1793  UDP-glucose 4-epimerase  51.92 
 
 		 341 aa  363  2e-99  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1713  UDP-glucose 4-epimerase  52.23 
 
 		 338 aa  363  3e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0170656  normal  0.546572 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4061  UDP-glucose 4-epimerase  51.63 
 
 		 337 aa  363  3e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5373  UDP-glucose 4-epimerase  50.15 
 
 		 338 aa  362  4e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  hitchhiker  0.00471599 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0916  UDP-glucose 4-epimerase  52.23 
 
 		 340 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1914  UDP-galactose 4-epimerase  54.82 
 
 		 335 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.810767  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05793  UDP-glucose 4-epimerase  49.7 
 
 		 338 aa  361  9e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3247  UDP-glucose 4-epimerase  53.39 
 
 		 338 aa  361  9e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2501  UDP-glucose 4-epimerase  52.23 
 
 		 340 aa  361  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5244  UDP-glucose 4-epimerase  49.55 
 
 		 338 aa  361  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1892  UDP-galactose 4-epimerase  53.41 
 
 		 377 aa  360  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3310  UDP-glucose 4-epimerase  53.87 
 
 		 340 aa  360  1e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138688  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5568  UDP-glucose 4-epimerase  49.85 
 
 		 337 aa  361  1e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1804  UDP-glucose 4-epimerase  53.25 
 
 		 337 aa  360  2e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3705  UDP-galactose 4-epimerase  51.93 
 
 		 340 aa  360  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2644  UDP-glucose 4-epimerase  50.44 
 
 		 336 aa  360  2e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14241  UDP-glucose 4-epimerase  46.31 
 
 		 352 aa  359  3e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.353629  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5381  UDP-glucose 4-epimerase  49.55 
 
 		 338 aa  359  4e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0410  UDP-glucose 4-epimerase  51.63 
 
 		 340 aa  358  5e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0889  UDP-glucose 4-epimerase  51.63 
 
 		 340 aa  358  5e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.334492  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1433  UDP-glucose 4-epimerase  51.62 
 
 		 337 aa  358  6e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0122713  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0859  UDP-glucose 4-epimerase  51.34 
 
 		 340 aa  358  8e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4007  UDP-glucose 4-epimerase  52.52 
 
 		 337 aa  358  8e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.006628  normal  0.348015 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0779  UDP-glucose 4-epimerase  51.63 
 
 		 340 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002660  UDP-glucose 4-epimerase  52.8 
 
 		 339 aa  358  9.999999999999999e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0714  UDP-glucose 4-epimerase  50.59 
 
 		 338 aa  358  9.999999999999999e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.168591  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0768  UDP-glucose 4-epimerase  51.63 
 
 		 340 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3986  UDP-galactose 4-epimerase  51.63 
 
 		 340 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.205233 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03331  UDP-glucose 4-epimerase  51.92 
 
 		 336 aa  357  1.9999999999999998e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5547  UDP-glucose 4-epimerase  53.17 
 
 		 336 aa  357  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0737  UDP-glucose 4-epimerase  54.38 
 
 		 339 aa  356  2.9999999999999997e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46785  UDP-glucose 4-epimerase  51.02 
 
 		 358 aa  356  3.9999999999999996e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5437  UDP-glucose 4-epimerase  48.54 
 
 		 342 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1327  UDP-glucose 4-epimerase  50.59 
 
 		 341 aa  355  5e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0367  UDP-glucose 4-epimerase  49.26 
 
 		 337 aa  355  5.999999999999999e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0019063  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00238  UDP-glucose 4-epimerase  51.62 
 
 		 338 aa  355  6.999999999999999e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0593  UDP-glucose 4-epimerase  52.35 
 
 		 339 aa  354  8.999999999999999e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1059  UDP-glucose 4-epimerase  52.35 
 
 		 336 aa  354  1e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0878912 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1477  UDP-glucose 4-epimerase  51.03 
 
 		 337 aa  354  1e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000121809  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1482  UDP-glucose 4-epimerase  51.03 
 
 		 337 aa  353  2e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000762592  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4083  UDP-glucose 4-epimerase  50.74 
 
 		 337 aa  353  2e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2007  UDP-galactose 4-epimerase  52.57 
 
 		 334 aa  353  2e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.5887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0116  UDP-glucose 4-epimerase  50.15 
 
 		 366 aa  353  2e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1513  UDP-glucose 4-epimerase  51.03 
 
 		 337 aa  353  2e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282439  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2271  UDP-glucose 4-epimerase  51.63 
 
 		 340 aa  353  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.967584  normal  0.133855 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3676  UDP-glucose 4-epimerase  51.91 
 
 		 339 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2870  UDP-glucose 4-epimerase  50.44 
 
 		 337 aa  352  4e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00371745  hitchhiker  0.000000287874 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1101  UDP-glucose 4-epimerase protein  51.75 
 
 		 341 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.139946  normal  0.0944899 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1044  UDP-galactose 4-epimerase  53.41 
 
 		 338 aa  352  5.9999999999999994e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4235  UDP-glucose 4-epimerase  50.58 
 
 		 341 aa  351  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4345  UDP-glucose 4-epimerase  50.58 
 
 		 341 aa  351  1e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697217  normal  0.478622 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5595  UDP-galactose 4-epimerase  51.61 
 
 		 339 aa  350  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455346  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3834  UDP-galactose 4-epimerase  52.49 
 
 		 342 aa  350  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0107  UDP-galactose 4-epimerase  49.85 
 
 		 343 aa  350  3e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0221  UDP-galactose 4-epimerase  47.56 
 
 		 347 aa  350  3e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.000600389  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2971  UDP-glucose 4-epimerase  53.27 
 
 		 336 aa  350  3e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.86287  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5304  UDP-glucose 4-epimerase  47.93 
 
 		 338 aa  349  4e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5700  UDP-glucose 4-epimerase  47.93 
 
 		 338 aa  349  4e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1485  UDP-glucose 4-epimerase  51.93 
 
 		 340 aa  349  5e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08531  UDP-glucose 4-epimerase  48.13 
 
 		 348 aa  349  5e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.264639  hitchhiker  0.00180619 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0024  UDP-glucose 4-epimerase  51.51 
 
 		 332 aa  348  6e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5131  UDP-glucose 4-epimerase  47.93 
 
 		 338 aa  348  8e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0518622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5545  UDP-glucose 4-epimerase  47.93 
 
 		 338 aa  348  8e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0306452 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2810  UDP-galactose 4-epimerase  52.07 
 
 		 337 aa  348  8e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0626054  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3124  UDP-glucose 4-epimerase  51.63 
 
 		 340 aa  348  9e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3087  UDP-glucose 4-epimerase  51.63 
 
 		 340 aa  348  9e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>