More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0184 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0184  polyA polymerase  100 
 
 
403 aa  787    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.648939  normal  0.0507556 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0212  polyA polymerase  59.41 
 
 
404 aa  475  1e-133  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.809405  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25491  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  54.64 
 
 
415 aa  351  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03291  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  42.43 
 
 
421 aa  333  4e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.418266  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03821  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  36.54 
 
 
418 aa  280  4e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.150415  normal  0.362341 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1668  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  35.89 
 
 
418 aa  276  5e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03361  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  30.34 
 
 
415 aa  249  8e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0600629  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03261  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  28.93 
 
 
415 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03271  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  28.93 
 
 
415 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.163609  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0305  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  28.93 
 
 
415 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.535708  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.69 
 
 
903 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  33.33 
 
 
909 aa  157  4e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.87 
 
 
903 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3792  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.26 
 
 
903 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  40.74 
 
 
904 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  30.9 
 
 
907 aa  146  7.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  31.91 
 
 
909 aa  139  8.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2260  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.33 
 
 
422 aa  139  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.029615  unclonable  0.0000000423985 
 
 
-
 
NC_002936  DET0409  polyA polymerase family protein  30.71 
 
 
418 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1346  cyclic nucleotide-binding protein  33.64 
 
 
902 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.761753 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1450  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.27 
 
 
450 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1774  polyA polymerase family protein  32.27 
 
 
450 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.69358  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1564  polynucleotide adenylyltransferase region  41.34 
 
 
388 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  41.55 
 
 
873 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2755  CBS domain-containing protein  27.23 
 
 
896 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.1635  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1363  polynucleotide adenylyltransferase region  46.07 
 
 
383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2615  polynucleotide adenylyltransferase region  42.22 
 
 
404 aa  127  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0405883  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1458  Polynucleotide adenylyltransferase region  35.51 
 
 
892 aa  126  7e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  27.85 
 
 
885 aa  125  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1481  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.06 
 
 
847 aa  124  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000006237  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  27.59 
 
 
877 aa  123  6e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1425  CBS domain-containing protein  37.16 
 
 
859 aa  123  6e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  35.16 
 
 
883 aa  122  9e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  32.09 
 
 
867 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  27.1 
 
 
865 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1433  polynucleotide adenylyltransferase region  29.22 
 
 
904 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.743333  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  29.47 
 
 
888 aa  119  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  36.95 
 
 
875 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  36.14 
 
 
845 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2294  CBS domain containing protein  36.95 
 
 
875 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  35.32 
 
 
863 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0642  polynucleotide adenylyltransferase region  32.85 
 
 
374 aa  116  5e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000899541  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  35.19 
 
 
863 aa  117  5e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  37.75 
 
 
907 aa  117  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1972  CBS  29.51 
 
 
898 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.03578  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2246  CBS domain-containing protein  30.89 
 
 
875 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1578  PolyA polymerase family protein  29.22 
 
 
880 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.507141  normal  0.242793 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1297  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  38.46 
 
 
888 aa  114  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.795106  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1441  Polynucleotide adenylyltransferase region  29.46 
 
 
821 aa  114  3e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000556215  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0388  polynucleotide adenylyltransferase region  34.98 
 
 
416 aa  114  3e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1654  CBS domain containing protein  36.45 
 
 
890 aa  113  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.873652 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2030  Polynucleotide adenylyltransferase region  38.1 
 
 
854 aa  113  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.609547  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0878  CBS domain containing protein  36.3 
 
 
880 aa  113  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1581  polyA polymerase family protein  36.27 
 
 
880 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.48144  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1184  Polynucleotide adenylyltransferase region  28.27 
 
 
905 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_352  polyA polymerase, tRNA nucleotidyltransferase  28.75 
 
 
418 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3306  polynucleotide adenylyltransferase region  33.03 
 
 
881 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102582  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  29.63 
 
 
877 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  39.09 
 
 
880 aa  109  8.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2466  polynucleotide adenylyltransferase region  37.41 
 
 
872 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.779181  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0551  polynucleotide adenylyltransferase region  34.1 
 
 
377 aa  103  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2847  polynucleotide adenylyltransferase region  41.67 
 
 
874 aa  100  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0358  CBS domain containing protein  28.44 
 
 
1077 aa  99  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0457131 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06110  tRNA nucleotidyltransferase  24.82 
 
 
477 aa  98.2  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5957  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.67 
 
 
483 aa  97.8  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2058  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  26.74 
 
 
469 aa  97.8  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4531  metal dependent phosphohydrolase  36.32 
 
 
502 aa  96.7  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1306  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.99 
 
 
489 aa  95.9  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23340  tRNA adenylyltransferase  39.71 
 
 
483 aa  95.1  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1151  polyA polymerase family protein  36.87 
 
 
475 aa  94  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.71029 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0023  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  38.34 
 
 
462 aa  93.6  6e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4574  HDIG domain-containing protein  40.11 
 
 
485 aa  93.6  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4906  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.43 
 
 
495 aa  92.8  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5092  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  39.55 
 
 
485 aa  92  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000588683 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3525  Polynucleotide adenylyltransferase region  40.49 
 
 
448 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.224253  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1756  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.04 
 
 
473 aa  91.3  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0722  HDIG  34.58 
 
 
476 aa  90.9  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.314731  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7079  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  41.21 
 
 
502 aa  90.5  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0854  Polynucleotide adenylyltransferase region  34.78 
 
 
468 aa  89.7  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00520307 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9036  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  40.66 
 
 
491 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2857  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.57 
 
 
484 aa  88.6  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.858546  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1109  metal dependent phosphohydrolase  34.22 
 
 
470 aa  89  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.875974  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37890  tRNA adenylyltransferase  36.15 
 
 
488 aa  87.4  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2415  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.14 
 
 
471 aa  86.7  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2544  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  38.34 
 
 
561 aa  86.7  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7321  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.02 
 
 
508 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4157  metal dependent phosphohydrolase  37.1 
 
 
496 aa  85.9  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3120  polynucleotide adenylyltransferase region  37.84 
 
 
450 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3102  metal-dependent phosphohydrolase  38.92 
 
 
552 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4207  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  38.86 
 
 
483 aa  84.7  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2535  tRNA adenylyltransferase (tRNA nucleotidyl transferase)  35.71 
 
 
479 aa  85.1  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39600  tRNA adenylyltransferase  36.99 
 
 
523 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9369  hypothetical protein  39.02 
 
 
479 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3924  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.21 
 
 
502 aa  84  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1970  Polynucleotide adenylyltransferase region  36.21 
 
 
420 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4849  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.62 
 
 
499 aa  84  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1525  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
475 aa  83.6  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0039  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase family protein  23.79 
 
 
390 aa  83.2  0.000000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.607631  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1997  Polynucleotide adenylyltransferase region  36.21 
 
 
420 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.600969  normal  0.0824458 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1064  polynucleotide adenylyltransferase region  32.94 
 
 
423 aa  82.4  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191372  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>