More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0120 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0164  peptidase M20D, amidohydrolase  81.75 
 
 
392 aa  643    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0120  peptidase M20D, amidohydrolase  100 
 
 
393 aa  777    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000983179 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01951  Zinc metallopeptidase M20/M25/M40 family protein  70.33 
 
 
398 aa  554  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17381  zinc metallopeptidase  66.93 
 
 
393 aa  522  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.467436  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20651  zinc metallopeptidase  61.27 
 
 
394 aa  508  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1190  peptidase M20D, amidohydrolase  61.27 
 
 
394 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1706  peptidase M20D, amidohydrolase  51.74 
 
 
394 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18021  zinc metallopeptidase  52.24 
 
 
386 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18231  zinc metallopeptidase  49.61 
 
 
394 aa  418  1e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.852941  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18051  zinc metallopeptidase  48.7 
 
 
392 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.309423  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1205  amidohydrolase  50.38 
 
 
398 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.811982  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1178  amidohydrolase  50.38 
 
 
398 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  51.04 
 
 
392 aa  394  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2091  amidohydrolase  52.62 
 
 
395 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150957 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1491  amidohydrolase  51.28 
 
 
396 aa  388  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3690  amidohydrolase  49.87 
 
 
400 aa  378  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  49.87 
 
 
395 aa  361  1e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1971  peptidase M20D, amidohydrolase  62.29 
 
 
252 aa  278  1e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  37.8 
 
 
405 aa  276  4e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  37.2 
 
 
390 aa  276  5e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2022  amidohydrolase  41.37 
 
 
396 aa  269  5.9999999999999995e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3955  amidohydrolase  41.18 
 
 
412 aa  268  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393946  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4094  peptidase M20D, amidohydrolase  40.84 
 
 
392 aa  264  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.665516  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  38.5 
 
 
403 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  44.39 
 
 
400 aa  263  4e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4199  amidohydrolase  40.1 
 
 
440 aa  263  4e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1741  amidohydrolase  41.13 
 
 
395 aa  262  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  37.56 
 
 
390 aa  261  1e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2564  peptidase M20D, amidohydrolase  40.53 
 
 
410 aa  261  2e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  38.24 
 
 
403 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  38.16 
 
 
405 aa  259  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0675  amidohydrolase  39.14 
 
 
420 aa  258  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.925294  normal  0.238039 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  39.38 
 
 
396 aa  256  3e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0776  amidohydrolase  42.06 
 
 
391 aa  256  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  38.24 
 
 
388 aa  256  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  41.83 
 
 
389 aa  256  5e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  36.26 
 
 
380 aa  255  8e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  37.7 
 
 
405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0634  amidohydrolase  38.69 
 
 
387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  39.3 
 
 
391 aa  253  5.000000000000001e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1268  Aminoacylase  40.74 
 
 
412 aa  252  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2175  peptidase M20D, amidohydrolase  41.27 
 
 
396 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.20985 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  40.96 
 
 
393 aa  251  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3950  amidohydrolase  42.45 
 
 
415 aa  251  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00661247 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  41.8 
 
 
395 aa  251  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  38.81 
 
 
403 aa  250  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  40.76 
 
 
396 aa  250  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  38.21 
 
 
408 aa  250  3e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  36.12 
 
 
381 aa  250  4e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  37.53 
 
 
394 aa  249  5e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3542  amidohydrolase  44.02 
 
 
406 aa  249  5e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0576858  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  34.46 
 
 
390 aa  249  6e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3705  thermostable carboxypeptidase 1  36.67 
 
 
381 aa  249  7e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  36.54 
 
 
381 aa  249  8e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3698  M20/M25/M40 family peptidase  35.14 
 
 
381 aa  249  8e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  40.54 
 
 
384 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  35.62 
 
 
394 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  32.56 
 
 
393 aa  248  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  39.27 
 
 
412 aa  247  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1188  amidohydrolase  39.28 
 
 
387 aa  247  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0208  peptidase M20D, amidohydrolase  37.43 
 
 
397 aa  247  3e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  36.34 
 
 
393 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0740  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  35.71 
 
 
391 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0340749  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.16 
 
 
401 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0613  amidohydrolase  35.61 
 
 
400 aa  246  4.9999999999999997e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  38.42 
 
 
379 aa  246  6e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  40.47 
 
 
396 aa  245  8e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  38.4 
 
 
387 aa  245  8e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  39.69 
 
 
388 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  39.84 
 
 
387 aa  245  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  39.47 
 
 
388 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  37.95 
 
 
389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0833  amidohydrolase  40.87 
 
 
480 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.728187  normal  0.0130422 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1532  aminoacylase  34.95 
 
 
389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  39.23 
 
 
387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  40.87 
 
 
395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1426  aminoacylase  34.41 
 
 
389 aa  244  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25770  amidohydrolase  41.13 
 
 
401 aa  243  3e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.336885  normal  0.797588 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  39.23 
 
 
387 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  39.39 
 
 
399 aa  243  3e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3771  thermostable carboxypeptidase 1  35.22 
 
 
381 aa  244  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.406616  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0004  amidohydrolase  39.37 
 
 
399 aa  243  3.9999999999999997e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4597  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  35.45 
 
 
391 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00088705  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0570  amidohydrolase  34.29 
 
 
392 aa  243  5e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1962  peptidase M20D, amidohydrolase  42.64 
 
 
396 aa  243  5e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.904473 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  39.1 
 
 
394 aa  243  5e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1544  thermostable carboxypeptidase 1  35.48 
 
 
381 aa  243  6e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.192988  normal  0.0195635 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  36.41 
 
 
400 aa  242  7e-63  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  39.36 
 
 
394 aa  242  7e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1263  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  34.68 
 
 
389 aa  242  9e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.804068  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  39.47 
 
 
390 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  38.5 
 
 
387 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  38.4 
 
 
387 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  38.5 
 
 
387 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0678  amidohydrolase  41.19 
 
 
394 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000231632  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3350  amidohydrolase  36.19 
 
 
388 aa  241  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028515  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  39.89 
 
 
396 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  37.81 
 
 
425 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  39.06 
 
 
388 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  42.55 
 
 
396 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>