More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0119 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0119  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  493  9.999999999999999e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000942476 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0163  TPR repeat-containing protein  81.64 
 
 
256 aa  399  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01941  Tfp pilus assembly protein PilF  70 
 
 
270 aa  307  9e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20661  hypothetical protein  58.53 
 
 
262 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1191  TPR repeat-containing protein  59.13 
 
 
262 aa  295  4e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18061  hypothetical protein  53.01 
 
 
262 aa  274  9e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1707  TPR repeat-containing protein  51.81 
 
 
262 aa  267  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18031  hypothetical protein  52 
 
 
262 aa  266  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18241  hypothetical protein  55.22 
 
 
262 aa  263  2e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.219981  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17391  Tfp pilus assembly protein PilF  52.21 
 
 
270 aa  261  6e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1972  TPR repeat-containing protein  46.56 
 
 
255 aa  204  9e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  42.38 
 
 
269 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1009  TPR repeat-containing protein  44.25 
 
 
269 aa  202  6e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000052453  hitchhiker  0.00393725 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1891  TPR repeat-containing protein  42.86 
 
 
266 aa  201  9e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1009  TPR repeat-containing protein  42.62 
 
 
273 aa  198  7e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0715627  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  43.36 
 
 
270 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  43.36 
 
 
270 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.19 
 
 
406 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.19 
 
 
406 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  32.16 
 
 
706 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  33.52 
 
 
582 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  32.09 
 
 
706 aa  86.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  28.71 
 
 
462 aa  85.5  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36370  predicted protein  38.2 
 
 
213 aa  84.7  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.08989  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  28.93 
 
 
306 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  31.55 
 
 
685 aa  82.8  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
404 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  33.16 
 
 
581 aa  79.7  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  32.43 
 
 
539 aa  79.3  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  33.78 
 
 
280 aa  78.2  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  31.05 
 
 
334 aa  77.8  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  28.34 
 
 
1421 aa  77.4  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 
878 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  30.81 
 
 
361 aa  75.9  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.8 
 
 
308 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 
331 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  32.26 
 
 
233 aa  73.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  29.28 
 
 
547 aa  72.8  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 
391 aa  72.4  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  32.68 
 
 
626 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  32.68 
 
 
614 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 
614 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 
718 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.18 
 
 
542 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 
636 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  32.2 
 
 
626 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
371 aa  69.3  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 
428 aa  69.7  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.24 
 
 
738 aa  69.3  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  33.86 
 
 
611 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  32.2 
 
 
614 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  32.2 
 
 
614 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 
614 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  29.9 
 
 
725 aa  68.9  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.45 
 
 
249 aa  68.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  31.28 
 
 
681 aa  68.6  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  33.78 
 
 
280 aa  68.6  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
635 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
635 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 
612 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.45 
 
 
249 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  31.6 
 
 
626 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00751  hypothetical protein  30.71 
 
 
205 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.499954 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 
637 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 
446 aa  67  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.64 
 
 
632 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 
612 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 
649 aa  67  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 
639 aa  67  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  28.16 
 
 
362 aa  66.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.17 
 
 
988 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.63 
 
 
373 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.25 
 
 
784 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39123  predicted protein  33.11 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.288314 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  29.28 
 
 
306 aa  66.2  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 
392 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.87 
 
 
1056 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  31.84 
 
 
615 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.61 
 
 
237 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
515 aa  64.7  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 
602 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 
617 aa  63.9  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 
605 aa  63.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  32.97 
 
 
637 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  27.62 
 
 
875 aa  63.9  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  26.37 
 
 
816 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30 
 
 
818 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  27.44 
 
 
349 aa  63.5  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  34.23 
 
 
608 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4974  TPR repeat-containing protein  32.11 
 
 
422 aa  62.8  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.07 
 
 
1022 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 
601 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.79 
 
 
810 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1162  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 
205 aa  62.4  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.771224 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35856  predicted protein  31.87 
 
 
344 aa  62  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142385  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.01 
 
 
1056 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0505  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.65 
 
 
139 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.6696 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  30.24 
 
 
620 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1837  TPR repeat-containing protein  25.25 
 
 
344 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>