More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0118 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0118  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 
348 aa  683    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0162  Holliday junction DNA helicase RuvB  86.49 
 
 
347 aa  587  1e-166  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01931  Holliday junction DNA helicase RuvB  78.39 
 
 
398 aa  500  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1192  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.56 
 
 
356 aa  435  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20671  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.56 
 
 
356 aa  435  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2503  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.57 
 
 
370 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.54699  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0835  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.48 
 
 
375 aa  419  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0909626  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17401  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.67 
 
 
348 aa  415  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1892  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.73 
 
 
371 aa  409  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.912644  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1008  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.05 
 
 
366 aa  404  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000228051  hitchhiker  0.00140746 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3579  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.53 
 
 
360 aa  398  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2534  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.53 
 
 
360 aa  398  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.113994 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1365  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.27 
 
 
386 aa  396  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191372  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1554  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.77 
 
 
366 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0582053 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.41 
 
 
336 aa  366  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3998  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.86 
 
 
348 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0531  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.49 
 
 
348 aa  362  5.0000000000000005e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.899114  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2776  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.29 
 
 
334 aa  362  5.0000000000000005e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115584  normal  0.033156 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.1 
 
 
337 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.6 
 
 
334 aa  361  8e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2030  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.6 
 
 
334 aa  361  8e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959876  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1217  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.86 
 
 
348 aa  361  9e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743844  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2234  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.62 
 
 
353 aa  361  9e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1246  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.86 
 
 
348 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2420  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.6 
 
 
334 aa  361  1e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00322281  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1796  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  54.57 
 
 
341 aa  360  3e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000827733 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.32 
 
 
338 aa  359  4e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.78 
 
 
338 aa  359  4e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.76 
 
 
345 aa  358  5e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1820  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.29 
 
 
336 aa  358  6e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0486722  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1410  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.79 
 
 
353 aa  358  6e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.585511  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51780  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.29 
 
 
352 aa  358  7e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000261912 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2104  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.29 
 
 
334 aa  357  9.999999999999999e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4201  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.55 
 
 
348 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.564106  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.43 
 
 
333 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.17 
 
 
342 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1272  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.25 
 
 
350 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197391  normal  0.338771 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3124  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.82 
 
 
346 aa  355  5.999999999999999e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3625  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.4 
 
 
348 aa  355  6.999999999999999e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.528643  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4541  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.79 
 
 
352 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1063  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.77 
 
 
343 aa  354  1e-96  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.37 
 
 
337 aa  354  1e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.14 
 
 
337 aa  354  1e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4407  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.29 
 
 
353 aa  353  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2034  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.14 
 
 
338 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0438556  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.21 
 
 
338 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.17 
 
 
336 aa  352  5e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0944  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.45 
 
 
343 aa  352  5.9999999999999994e-96  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.12 
 
 
338 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.56 
 
 
338 aa  351  8.999999999999999e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.82 
 
 
334 aa  351  1e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0956  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.55 
 
 
336 aa  350  1e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00553774  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.52 
 
 
345 aa  350  1e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.62 
 
 
334 aa  350  1e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01831  Holliday junction DNA helicase B  54.55 
 
 
336 aa  350  2e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1780  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.55 
 
 
336 aa  350  2e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115623  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1953  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.55 
 
 
336 aa  350  2e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.128474  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01819  hypothetical protein  54.55 
 
 
336 aa  350  2e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2596  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.55 
 
 
336 aa  350  2e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0158351  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1772  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.55 
 
 
336 aa  350  2e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0145511  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2090  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.55 
 
 
336 aa  350  2e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000376613  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.2 
 
 
336 aa  350  3e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1326  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.55 
 
 
336 aa  350  3e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0442858  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2254  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.35 
 
 
336 aa  349  4e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.442395  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2777  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.82 
 
 
351 aa  349  5e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.928098  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.81 
 
 
336 aa  348  7e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2362  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.29 
 
 
337 aa  348  9e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00859369  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.35 
 
 
334 aa  348  9e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0270  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.17 
 
 
335 aa  348  9e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.49 
 
 
336 aa  347  1e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2944  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.72 
 
 
335 aa  347  1e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000368947  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1957  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.05 
 
 
334 aa  347  1e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0904224  normal  0.777155 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0418  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.31 
 
 
351 aa  347  2e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1756  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.31 
 
 
351 aa  347  2e-94  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2108  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.03 
 
 
336 aa  346  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252002  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0062  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.17 
 
 
340 aa  346  3e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003922  holliday junction DNA helicase RuvB  53.4 
 
 
355 aa  346  3e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000262975  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0063  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.17 
 
 
340 aa  346  3e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.389593  normal  0.914826 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2053  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.03 
 
 
336 aa  346  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0123486  normal  0.169016 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0140  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.63 
 
 
348 aa  346  3e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2048  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.03 
 
 
336 aa  346  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.91 
 
 
344 aa  347  3e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.27 
 
 
351 aa  347  3e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1354  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.03 
 
 
336 aa  346  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00473129 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1230  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.03 
 
 
336 aa  346  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0225142  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.11 
 
 
344 aa  345  4e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2180  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.96 
 
 
336 aa  346  4e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.729966  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1116  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.21 
 
 
338 aa  346  4e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.848994  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0561  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.05 
 
 
348 aa  345  5e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.389647  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2322  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.59 
 
 
321 aa  345  5e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.674048  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1436  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.77 
 
 
334 aa  345  5e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000380468  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.37 
 
 
345 aa  345  5e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.05 
 
 
334 aa  345  6e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2076  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.74 
 
 
334 aa  345  6e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000131363  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1902  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.74 
 
 
334 aa  345  7e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000022467  hitchhiker  0.0000432146 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.74 
 
 
334 aa  344  1e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  0.0000000744022 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  54.6 
 
 
541 aa  344  1e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.66 
 
 
358 aa  343  2e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0528  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.18 
 
 
338 aa  344  2e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.74 
 
 
334 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>