More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0084 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0084  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 
275 aa  559  1e-158  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10371  dienelactone hydrolase  57.02 
 
 
246 aa  296  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16031  dienelactone hydrolase  43.03 
 
 
238 aa  227  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1497  dienelactone hydrolase  42.32 
 
 
238 aa  219  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.184657  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  39.44 
 
 
251 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  40.98 
 
 
244 aa  182  4.0000000000000006e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  36.4 
 
 
245 aa  172  5.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  36.07 
 
 
247 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  35.66 
 
 
247 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  42.36 
 
 
248 aa  169  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  38.15 
 
 
246 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  35.68 
 
 
248 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  32.26 
 
 
242 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  32.26 
 
 
242 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 
230 aa  99.4  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 
230 aa  99  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  32.85 
 
 
223 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  33.83 
 
 
230 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  31.19 
 
 
236 aa  96.7  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  32.86 
 
 
223 aa  95.9  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  32.34 
 
 
230 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  32.34 
 
 
230 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  32.2 
 
 
407 aa  94.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  32.34 
 
 
230 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  27.97 
 
 
232 aa  94  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0260  carboxymethylenebutenolidase  33.17 
 
 
229 aa  92.8  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785902 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0255  Carboxymethylenebutenolidase  33.17 
 
 
229 aa  92.8  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1220  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 
229 aa  92  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  35.33 
 
 
408 aa  92.4  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  31.22 
 
 
407 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  33 
 
 
230 aa  91.3  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  33.17 
 
 
227 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  31.84 
 
 
232 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  32.18 
 
 
410 aa  90.5  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  31.31 
 
 
236 aa  89  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0900  carboxymethylenebutenolidase  31.6 
 
 
221 aa  89  8e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  32 
 
 
232 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  34.52 
 
 
229 aa  87.4  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  32.67 
 
 
229 aa  87.8  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1576  dienelactone hydrolase  32.52 
 
 
247 aa  87  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0275  Carboxymethylenebutenolidase  32.67 
 
 
220 aa  86.7  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  31.34 
 
 
230 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  31.34 
 
 
230 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  31.34 
 
 
230 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  31.34 
 
 
230 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  31.34 
 
 
230 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  31.34 
 
 
230 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  31.34 
 
 
230 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5324  carboxymethylenebutenolidase  30.77 
 
 
298 aa  85.9  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3316  carboxymethylenebutenolidase  31.22 
 
 
297 aa  85.9  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0813595  normal  0.0640539 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  31.22 
 
 
297 aa  85.9  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  30.85 
 
 
230 aa  85.5  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0373  carboxymethylenebutenolidase  35.29 
 
 
230 aa  85.1  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  33.85 
 
 
222 aa  83.6  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1279  Carboxymethylenebutenolidase  30.05 
 
 
245 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5577  carboxymethylenebutenolidase  31 
 
 
237 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  32.43 
 
 
413 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  32.21 
 
 
420 aa  82.4  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0181  twin-arginine translocation pathway signal  29.13 
 
 
291 aa  82.4  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972702  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1445  carboxymethylenebutenolidase  32.51 
 
 
246 aa  82  0.000000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.80402  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3810  carboxymethylenebutenolidase  33.85 
 
 
230 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.994218  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0188  carboxymethylenebutenolidase  34.16 
 
 
229 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.188287  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  27.78 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  30.57 
 
 
413 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5771  carboxymethylenebutenolidase  30.5 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0092  carboxymethylenebutenolidase  29.88 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019242 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  25.24 
 
 
277 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  33.87 
 
 
433 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  33.51 
 
 
409 aa  77.8  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2851  carboxymethylenebutenolidase  31.36 
 
 
232 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0128923 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1943  carboxymethylenebutenolidase  26.79 
 
 
302 aa  77  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0524201  normal  0.0241824 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0139  carboxymethylenebutenolidase  31.77 
 
 
232 aa  77  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2433  Carboxymethylenebutenolidase  27.05 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  26.92 
 
 
251 aa  75.9  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0536  carboxymethylenebutenolidase  32.21 
 
 
239 aa  75.9  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  32.8 
 
 
409 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  27.88 
 
 
275 aa  75.5  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0392  carboxymethylenebutenolidase  27.67 
 
 
250 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0185  dienelactone hydrolase  28.04 
 
 
246 aa  75.1  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  29.95 
 
 
268 aa  74.7  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  28.44 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2040  Carboxymethylenebutenolidase  26.57 
 
 
292 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143956  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2602  carboxymethylenebutenolidase  29.05 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1546  dienelactone hydrolase  29.67 
 
 
245 aa  74.7  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.770426  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1793  carboxymethylenebutenolidase  30.41 
 
 
411 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.383832 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  28.64 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  28.64 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  28.64 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  28.64 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  32.26 
 
 
409 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  26.7 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  27.88 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  27.88 
 
 
269 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  27.88 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  27.88 
 
 
271 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  27.88 
 
 
271 aa  72.4  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  30.65 
 
 
415 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  31.18 
 
 
415 aa  72  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.103513 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  27.88 
 
 
271 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  27.88 
 
 
271 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>