More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0078 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  43.26 
 
 
871 aa  641    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18541  DNA mismatch repair protein MutS  47.3 
 
 
913 aa  921    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  41.18 
 
 
896 aa  636    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3368  DNA mismatch repair protein MutS  50.52 
 
 
888 aa  847    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.583963  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1519  DNA mismatch repair protein MutS  52.23 
 
 
854 aa  822    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00861946  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00881  DNA mismatch repair protein MutS  73.67 
 
 
927 aa  1264    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0543692 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1243  DNA mismatch repair protein MutS  54.43 
 
 
926 aa  1038    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.32952  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  53.73 
 
 
854 aa  845    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  42.18 
 
 
870 aa  638    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21131  DNA mismatch repair protein MutS  54.79 
 
 
926 aa  1045    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0652427  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0081  DNA mismatch repair protein MutS  77.27 
 
 
905 aa  1345    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294772  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0078  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 
903 aa  1815    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.167909  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  43.74 
 
 
872 aa  655    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1737  DNA mismatch repair protein MutS  46.96 
 
 
913 aa  922    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0169322  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  54.05 
 
 
882 aa  843    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18351  DNA mismatch repair protein MutS  49.03 
 
 
914 aa  908    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  40.98 
 
 
870 aa  657    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  40.88 
 
 
873 aa  654    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17711  DNA mismatch repair protein MutS  61.71 
 
 
908 aa  1057    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2734  DNA mismatch repair protein MutS  50.17 
 
 
888 aa  847    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3815  DNA mismatch repair protein MutS  53.14 
 
 
907 aa  822    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.548974 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  42.35 
 
 
932 aa  679    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2515  DNA mismatch repair protein MutS  51.67 
 
 
885 aa  833    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18351  DNA mismatch repair protein MutS  47.18 
 
 
913 aa  918    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  48.62 
 
 
901 aa  815    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  41.95 
 
 
872 aa  633  1e-180  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  43.14 
 
 
889 aa  630  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  43.38 
 
 
872 aa  624  1e-177  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  41.51 
 
 
868 aa  621  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  37.97 
 
 
910 aa  615  1e-175  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  42.09 
 
 
897 aa  615  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  44.54 
 
 
882 aa  613  9.999999999999999e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  40.88 
 
 
869 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  37.97 
 
 
910 aa  614  9.999999999999999e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  41.24 
 
 
891 aa  610  1e-173  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  43.69 
 
 
850 aa  609  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  43.56 
 
 
823 aa  609  1e-173  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  39.25 
 
 
869 aa  605  9.999999999999999e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  43.72 
 
 
863 aa  605  9.999999999999999e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  41.86 
 
 
870 aa  606  9.999999999999999e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  37.38 
 
 
853 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  36.31 
 
 
867 aa  600  1e-170  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  41.1 
 
 
859 aa  599  1e-170  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  40.78 
 
 
900 aa  598  1e-169  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  36.62 
 
 
868 aa  597  1e-169  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  40.51 
 
 
871 aa  594  1e-168  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  42.82 
 
 
880 aa  593  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  40.71 
 
 
859 aa  593  1e-168  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  38.01 
 
 
863 aa  592  1e-168  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  38.45 
 
 
895 aa  593  1e-168  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  38.3 
 
 
890 aa  590  1e-167  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  38.18 
 
 
890 aa  589  1e-167  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  38.05 
 
 
892 aa  590  1e-167  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  39.93 
 
 
857 aa  592  1e-167  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  41.68 
 
 
868 aa  591  1e-167  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  38.18 
 
 
892 aa  587  1e-166  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  38.18 
 
 
892 aa  587  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  40.39 
 
 
872 aa  588  1e-166  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  38.18 
 
 
892 aa  587  1e-166  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  38.18 
 
 
890 aa  587  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  38.18 
 
 
894 aa  586  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  38.18 
 
 
892 aa  587  1e-166  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  41.06 
 
 
874 aa  586  1e-166  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  38.69 
 
 
860 aa  587  1e-166  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  38.18 
 
 
892 aa  587  1e-166  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  41.96 
 
 
863 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  35.57 
 
 
868 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  42.11 
 
 
878 aa  584  1.0000000000000001e-165  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  41.26 
 
 
851 aa  582  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  38.84 
 
 
863 aa  580  1e-164  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  43.23 
 
 
896 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0008  DNA mismatch repair protein MutS  35.45 
 
 
848 aa  576  1.0000000000000001e-163  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  38.43 
 
 
887 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2247  DNA mismatch repair protein MutS  43.95 
 
 
882 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136567  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1576  DNA mismatch repair protein MutS  40.3 
 
 
854 aa  576  1.0000000000000001e-163  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  36.36 
 
 
873 aa  573  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  44.16 
 
 
898 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  38.04 
 
 
881 aa  572  1.0000000000000001e-162  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  40.35 
 
 
854 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  39.24 
 
 
858 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  39.55 
 
 
887 aa  575  1.0000000000000001e-162  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  38.61 
 
 
857 aa  573  1.0000000000000001e-162  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  40.22 
 
 
853 aa  572  1e-161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  39.52 
 
 
859 aa  569  1e-161  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  39.32 
 
 
871 aa  569  1e-161  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  45.19 
 
 
882 aa  572  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  42.23 
 
 
865 aa  569  1e-161  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  39.53 
 
 
903 aa  570  1e-161  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  40.24 
 
 
882 aa  570  1e-161  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  40.59 
 
 
852 aa  572  1e-161  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2157  DNA mismatch repair protein MutS  44.02 
 
 
882 aa  571  1e-161  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.404203  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  41.78 
 
 
855 aa  571  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  40.1 
 
 
854 aa  570  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  40.1 
 
 
854 aa  567  1e-160  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3059  DNA mismatch repair protein MutS  40.1 
 
 
855 aa  568  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.725135 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3218  DNA mismatch repair protein MutS  40.22 
 
 
855 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.864156  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  36.07 
 
 
872 aa  567  1e-160  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2107  DNA mismatch repair protein MutS  45.48 
 
 
882 aa  567  1e-160  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0317076 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  39.12 
 
 
853 aa  566  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3030  DNA mismatch repair protein MutS  40.1 
 
 
855 aa  568  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>