More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0026 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0026  GTPase EngC  100 
 
 		 304 aa  606  9.999999999999999e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0022  GTPase EngC  76.53 
 
 		 300 aa  442  1e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00231  GTPase  62.37 
 
 		 321 aa  348  7e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00181  GTPases  47.44 
 
 		 312 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.712591  normal  0.906931 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1346  GTPase EngC  47.44 
 
 		 312 aa  296  4e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.497247  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00191  GTPase  48.45 
 
 		 313 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.193331  normal  0.0640635 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3189  ribosome-associated GTPase  48.04 
 
 		 376 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2930  ribosome-associated GTPase  48.37 
 
 		 405 aa  282  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0558  ribosome-associated GTPase  49 
 
 		 380 aa  278  9e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.752261 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2076  ribosome-associated GTPase  51.41 
 
 		 350 aa  270  2e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.822356 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1753  ribosome-associated GTPase  46.06 
 
 		 374 aa  269  5e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1982  ribosome small subunit-dependent GTPase A  49.32 
 
 		 370 aa  268  1e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0381  ribosome-associated GTPase  49.32 
 
 		 370 aa  263  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4690  ribosome-associated GTPase  51.2 
 
 		 364 aa  261  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00181  GTPases  37.5 
 
 		 305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.655275  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00181  GTPase  38.37 
 
 		 305 aa  219  6e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0019  GTPase EngC  36.46 
 
 		 305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0464209  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00181  GTPase  35.56 
 
 		 305 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16978  predicted protein  41.01 
 
 		 352 aa  182  8.000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2303  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.13 
 
 		 294 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.304027  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1715  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.15 
 
 		 292 aa  168  8e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1013  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.82 
 
 		 295 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1117  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.69 
 
 		 293 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1587  ribosome small subunit-dependent GTPase A  43.39 
 
 		 293 aa  165  8e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3684  ribosome-associated GTPase  40.42 
 
 		 293 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1310  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.84 
 
 		 292 aa  159  4e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.972269  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3903  ribosome-associated GTPase  36.52 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905748  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3620  ribosome-associated GTPase  36.52 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0108869  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3909  ribosome-associated GTPase  36.52 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812808  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3712  ribosome-associated GTPase  36.52 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0352319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3602  ribosome-associated GTPase  36.52 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000137277  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3999  ribosome-associated GTPase  36.52 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.164627  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3960  ribosome-associated GTPase  40 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.673313  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1283  ribosome-associated GTPase  40 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350933  hitchhiker  0.000819324 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3875  ribosome-associated GTPase  36.52 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01425e-25 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1326  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.58 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1990  ribosome-associated GTPase  35.07 
 
 		 287 aa  156  4e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0913  GTPase EngC  40.6 
 
 		 290 aa  156  5.0000000000000005e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000815657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1708  ribosome-associated GTPase  35.07 
 
 		 287 aa  155  6e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1697  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.76 
 
 		 302 aa  154  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1068  ribosome-associated GTPase  37.07 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2513  ribosome-associated GTPase  38.49 
 
 		 293 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00240237  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1958  ribosome-associated GTPase  40.61 
 
 		 293 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.73 
 
 		 319 aa  149  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1748  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.66 
 
 		 293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000167014  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1224  GTPase EngC  37.28 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1536  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.07 
 
 		 305 aa  147  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0575  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.06 
 
 		 294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5830  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.99 
 
 		 308 aa  146  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.700319 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09970  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.27 
 
 		 282 aa  146  5e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3843  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.6 
 
 		 296 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.338646  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1510  GTPase  36.14 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.116173  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1777  ribosome-associated GTPase  34.69 
 
 		 290 aa  143  4e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.82 
 
 		 306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0668  ribosome small subunit-dependent GTPase A  29.76 
 
 		 290 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000332058  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1770  ribosome-associated GTPase  31.56 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2198  ribosome-associated GTPase  30.77 
 
 		 307 aa  140  3e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2485  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.33 
 
 		 291 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0513  ribosome-associated GTPase  31.44 
 
 		 325 aa  139  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.93 
 
 		 319 aa  138  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1046  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.93 
 
 		 290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0232344  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2044  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30 
 
 		 293 aa  135  8e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2475  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.2 
 
 		 296 aa  135  8e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.818864  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0549  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.74 
 
 		 375 aa  135  9e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.938885  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  35.25 
 
 		 352 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  37.39 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2354  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.44 
 
 		 300 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1280  hypothetical protein  35.44 
 
 		 291 aa  134  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.390036  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2914  putative ATP/GTP-binding protein  35.29 
 
 		 304 aa  133  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.589504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1305  hypothetical protein  35.44 
 
 		 291 aa  134  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.276493  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1341  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.83 
 
 		 288 aa  132  7.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.85094  normal  0.38449 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1505  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32 
 
 		 288 aa  132  9e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1168  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.78 
 
 		 296 aa  131  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310528  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0429  ribosome-associated GTPase  32.58 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0789  ribosome-associated GTPase  34.81 
 
 		 352 aa  130  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106685  hitchhiker  0.00135027 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0537  hypothetical protein  39.19 
 
 		 299 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3198  ribosome-associated GTPase  33.06 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1269  ribosome-associated GTPase  38.11 
 
 		 340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07390  ribosome-associated GTPase  31.03 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1907  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.83 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000047717  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  33.6 
 
 		 354 aa  127  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0355  ribosome-associated GTPase  32.62 
 
 		 312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1204  ribosome small subunit-dependent GTPase A  26.4 
 
 		 293 aa  126  5e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0765  GTPase  33.45 
 
 		 297 aa  126  6e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0138143  hitchhiker  0.000000123539 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2677  putative GTPase  32.55 
 
 		 343 aa  125  9e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3318  ribosome-associated GTPase  32.8 
 
 		 353 aa  125  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00153777  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3004  ribosome-associated GTPase  36.61 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.587446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3288  ribosome-associated GTPase  33.92 
 
 		 354 aa  124  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0787  hypothetical protein  31.91 
 
 		 291 aa  124  3e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0261  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.29 
 
 		 300 aa  123  3e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2727  ribosome-associated GTPase  30.08 
 
 		 307 aa  122  8e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.853912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  34.32 
 
 		 354 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  34.32 
 
 		 354 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  34.32 
 
 		 354 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  34.32 
 
 		 340 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  33.45 
 
 		 354 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0983  GTPase EngC  34.58 
 
 		 320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2576  ribosome-associated GTPase  35.61 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.880964 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0794  GTPase EngC  32.86 
 
 		 358 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.375434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0811  ribosome-associated GTPase  35.13 
 
 		 315 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485939  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>