More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0023 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  100 
 
 
225 aa  456  1e-127  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0019  heat shock protein GrpE  74.66 
 
 
224 aa  328  3e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  67.56 
 
 
237 aa  291  6e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  69.39 
 
 
247 aa  273  1e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1343  heat shock protein GrpE  71.75 
 
 
259 aa  269  3e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00151  heat shock protein GrpE  67.69 
 
 
259 aa  268  6e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.948871 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00151  heat shock protein GrpE  64.95 
 
 
239 aa  253  1e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0016  heat shock protein GrpE  65.8 
 
 
239 aa  253  1e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00151  heat shock protein GrpE  65.46 
 
 
239 aa  253  2e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00526535  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00151  heat shock protein GrpE  68.89 
 
 
239 aa  238  4e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  50.51 
 
 
223 aa  182  3e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2072  heat shock protein GrpE  57.24 
 
 
207 aa  176  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  52.94 
 
 
248 aa  173  2e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  52.94 
 
 
242 aa  171  6e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  43.78 
 
 
246 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  41.51 
 
 
261 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  41.51 
 
 
261 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  48.75 
 
 
286 aa  151  9e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  35.59 
 
 
274 aa  123  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  36.08 
 
 
225 aa  117  2e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  39.52 
 
 
213 aa  115  7e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  37.11 
 
 
213 aa  114  1e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.30249e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  38.97 
 
 
208 aa  112  4e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  40.88 
 
 
224 aa  111  9e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  7.37606e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  37.11 
 
 
226 aa  111  1e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  39.64 
 
 
204 aa  110  1e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  1.98101e-09  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  31.84 
 
 
225 aa  110  2e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  38.71 
 
 
231 aa  110  2e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  35.75 
 
 
190 aa  110  2e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  34.48 
 
 
188 aa  108  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  34.48 
 
 
188 aa  108  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  34.48 
 
 
188 aa  108  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.14529e-07  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  34.48 
 
 
188 aa  108  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  34.48 
 
 
188 aa  108  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  34.48 
 
 
188 aa  108  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  34.48 
 
 
188 aa  108  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  34.29 
 
 
192 aa  108  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.07397e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  34.43 
 
 
217 aa  108  6e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  34.48 
 
 
188 aa  108  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  38.22 
 
 
194 aa  108  7e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  33.33 
 
 
197 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  40.46 
 
 
198 aa  106  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  39.69 
 
 
192 aa  105  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  35.39 
 
 
221 aa  104  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  32.54 
 
 
208 aa  104  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  32.54 
 
 
208 aa  104  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4391  GrpE protein  33.85 
 
 
204 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1997  GrpE protein  37.22 
 
 
208 aa  101  8e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244965  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  36.88 
 
 
206 aa  101  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  32.98 
 
 
192 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  33.81 
 
 
191 aa  100  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3461  GrpE protein  34.64 
 
 
204 aa  99.4  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.704807  normal  0.0101104 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  30.89 
 
 
210 aa  98.2  8e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  37.89 
 
 
203 aa  98.2  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  3.69534e-09  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  34.19 
 
 
172 aa  97.8  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  35 
 
 
206 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  8.27789e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  35 
 
 
206 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  7.67299e-10  decreased coverage  7.11999e-08 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2695  GrpE protein  36.84 
 
 
202 aa  97.4  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.620591 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  35 
 
 
206 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.63417e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  39.85 
 
 
178 aa  96.7  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  36.65 
 
 
206 aa  96.7  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  1.25429e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  35 
 
 
206 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  7.98826e-07  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  35.76 
 
 
201 aa  96.7  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  1.03997e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  32.34 
 
 
282 aa  95.9  4e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0129  GrpE protein  36.42 
 
 
183 aa  95.9  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628751  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  35.37 
 
 
260 aa  95.9  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  34.19 
 
 
172 aa  95.5  5e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  7.49846e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  37.27 
 
 
206 aa  95.5  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  7.75754e-08  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  36.65 
 
 
203 aa  95.1  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  4.98857e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  33.16 
 
 
208 aa  94.4  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1583  GrpE protein  34.09 
 
 
206 aa  94.4  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.852741  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  36.3 
 
 
198 aa  93.6  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  35.98 
 
 
201 aa  94  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  9.57049e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  33.53 
 
 
181 aa  93.6  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  36.5 
 
 
210 aa  93.2  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  36.84 
 
 
174 aa  92.4  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  31.43 
 
 
209 aa  92.8  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  29.55 
 
 
210 aa  92.4  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  33.73 
 
 
181 aa  92  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  36.69 
 
 
198 aa  92  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1579  GrpE protein  33.13 
 
 
184 aa  92  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.524247  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  31.49 
 
 
200 aa  92  7e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.63848e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  33.33 
 
 
207 aa  90.9  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0732  GrpE protein  32.24 
 
 
178 aa  90.5  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.149267  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1520  GrpE protein  30.89 
 
 
206 aa  90.5  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0812159  normal  0.974035 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  34.08 
 
 
189 aa  90.1  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  33.13 
 
 
210 aa  89.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4974  GrpE protein  30.77 
 
 
211 aa  89.4  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161859  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  33.1 
 
 
209 aa  89.4  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  37.78 
 
 
200 aa  89.4  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  4.5112e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1062  GrpE protein  35.33 
 
 
169 aa  88.6  7e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0506342  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  34.84 
 
 
204 aa  87.4  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2350  GrpE protein  34.48 
 
 
185 aa  88.2  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  31.43 
 
 
209 aa  87.4  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  4.35816e-05  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  32.89 
 
 
243 aa  87.8  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0002  GrpE protein  30.54 
 
 
206 aa  87  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.531723  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3071  GrpE protein  31.82 
 
 
238 aa  87.4  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.215635  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0082  GrpE protein  32.22 
 
 
222 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  32.11 
 
 
211 aa  86.7  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  31.67 
 
 
189 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>