More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4894 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4894  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 714 aa  1465    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142345  normal  0.811526 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4236  TonB-dependent siderophore receptor  82.77 
 
 		 710 aa  1212    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000695536  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4959  TonB-dependent receptor  53.38 
 
 		 706 aa  761    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4743  TonB-dependent receptor, putative  73.97 
 
 		 690 aa  1046    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3953  TonB-dependent siderophore receptor  70.62 
 
 		 701 aa  1053    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000731032  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4504  TonB-dependent siderophore receptor  72.03 
 
 		 703 aa  1088    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000141313  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4127  TonB-dependent siderophore receptor  72.03 
 
 		 702 aa  1073    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00050238  normal  0.542591 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4307  TonB-dependent siderophore receptor  71.87 
 
 		 706 aa  1070    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000234699  hitchhiker  0.000000000225287 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4363  TonB-dependent siderophore receptor  71.87 
 
 		 706 aa  1069    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000323777  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4483  TonB-dependent siderophore receptor  83.1 
 
 		 712 aa  1203    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000188322  hitchhiker  0.0000171512 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3922  TonB-dependent siderophore receptor  72.27 
 
 		 709 aa  1075    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000715438  normal  0.0397715 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4014  TonB-dependent siderophore receptor  72.13 
 
 		 709 aa  1072    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00017833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4042  TonB-dependent siderophore receptor  71.73 
 
 		 697 aa  1064    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.296308  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3641  TonB-dependent receptor, putative  61.81 
 
 		 697 aa  926    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000783326  normal  0.0764781 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3841  TonB-dependent siderophore receptor  81.59 
 
 		 712 aa  1191    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000249714  hitchhiker  0.000312087 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4362  TonB-dependent siderophore receptor  70.89 
 
 		 706 aa  1061    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000023504  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06761  hypothetical protein  44.35 
 
 		 690 aa  575  1.0000000000000001e-162  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000849  putative ferrichrome-iron receptor  43.08 
 
 		 699 aa  555  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.744816  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0110  TonB dependent receptor  40.95 
 
 		 693 aa  531  1e-149  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1814  putative putative ferrichrome-iron receptor  38.13 
 
 		 693 aa  458  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  30.86 
 
 		 710 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  29.44 
 
 		 770 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  30.43 
 
 		 710 aa  240  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  27.86 
 
 		 708 aa  218  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  26.58 
 
 		 706 aa  219  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  26.58 
 
 		 706 aa  219  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  27.2 
 
 		 708 aa  213  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  28.86 
 
 		 721 aa  210  9e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  28.11 
 
 		 860 aa  210  9e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  28.38 
 
 		 850 aa  209  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  28.89 
 
 		 749 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  27.07 
 
 		 743 aa  209  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  28.44 
 
 		 738 aa  208  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  26.57 
 
 		 726 aa  207  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1443  TonB-dependent siderophore receptor  27.65 
 
 		 743 aa  207  7e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281605  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  28.47 
 
 		 742 aa  207  7e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  28.05 
 
 		 737 aa  206  8e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  27.31 
 
 		 703 aa  206  9e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  28.83 
 
 		 742 aa  206  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  26.88 
 
 		 726 aa  204  5e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  28.46 
 
 		 748 aa  204  5e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  28.46 
 
 		 748 aa  204  5e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  28.64 
 
 		 779 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3848  TonB-dependent siderophore receptor  28.8 
 
 		 743 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 707 aa  201  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  28.94 
 
 		 729 aa  201  5e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4689  TonB-dependent siderophore receptor  28.51 
 
 		 743 aa  201  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141202  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  28.51 
 
 		 743 aa  201  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  26.22 
 
 		 719 aa  200  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3769  TonB-dependent siderophore receptor  28.45 
 
 		 724 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.503702  normal  0.128914 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3576  TonB-dependent siderophore receptor  27.94 
 
 		 743 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0391438 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  28.2 
 
 		 740 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  27.78 
 
 		 743 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1610  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.28 
 
 		 724 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317263  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  27 
 
 		 710 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  27.49 
 
 		 726 aa  198  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1424  TonB-dependent siderophore receptor  28.66 
 
 		 710 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550485 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  27.82 
 
 		 751 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  27.39 
 
 		 791 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.44 
 
 		 711 aa  197  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  27.07 
 
 		 711 aa  197  7e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  25.78 
 
 		 709 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  28.48 
 
 		 710 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2436  TonB-dependent siderophore receptor  28.04 
 
 		 743 aa  196  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02662  putative TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 693 aa  196  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.196813  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  27.08 
 
 		 815 aa  196  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  26.18 
 
 		 708 aa  196  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  27.31 
 
 		 791 aa  195  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  26.98 
 
 		 864 aa  194  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  27.96 
 
 		 713 aa  193  8e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  26.75 
 
 		 715 aa  193  9e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1460  TonB-dependent siderophore receptor  28.42 
 
 		 712 aa  193  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0192209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  26.91 
 
 		 694 aa  192  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  27.96 
 
 		 713 aa  192  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  26.49 
 
 		 796 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  30.09 
 
 		 708 aa  192  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  27.19 
 
 		 796 aa  191  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  26.36 
 
 		 747 aa  191  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  27.29 
 
 		 837 aa  191  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  26.49 
 
 		 796 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  26.52 
 
 		 710 aa  189  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  29.17 
 
 		 738 aa  189  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06299  hypothetical protein  26.54 
 
 		 715 aa  187  5e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  28.43 
 
 		 862 aa  187  5e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3225  TonB-dependent siderophore receptor  27.46 
 
 		 715 aa  187  7e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.251172  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  26.34 
 
 		 796 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1629  TonB-dependent siderophore receptor  24.8 
 
 		 712 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385709 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  27.95 
 
 		 817 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  27.35 
 
 		 689 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.53 
 
 		 706 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 709 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  25.33 
 
 		 757 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 734 aa  185  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47140  putative TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 732 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  26.48 
 
 		 701 aa  184  6e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  28.43 
 
 		 778 aa  183  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  26.51 
 
 		 714 aa  183  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  26.44 
 
 		 705 aa  183  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1175  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 749 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  28.12 
 
 		 724 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>