More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4879 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4879  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 401 aa  807    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4472  C-terminal processing peptidase  76.69 
 
 		 401 aa  629  1e-179  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0890612  hitchhiker  0.000000524725 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3808  carboxyl-terminal protease  65.66 
 
 		 401 aa  549  1e-155  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4219  carboxyl-terminal protease  64.09 
 
 		 401 aa  528  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0041  carboxyl-terminal protease  60.55 
 
 		 401 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0045  carboxyl-terminal protease  60.55 
 
 		 401 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000144504 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0045  carboxyl-terminal protease  60.05 
 
 		 401 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000223993 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4334  carboxyl-terminal protease  60.05 
 
 		 401 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  63.07 
 
 		 401 aa  497  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0041  C-terminal processing peptidase-3  62.06 
 
 		 401 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.660161  hitchhiker  0.00325128 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0049  C-terminal processing peptidase-3  62.06 
 
 		 401 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000124234 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0047  carboxyl-terminal protease, putative  61.56 
 
 		 402 aa  489  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3700  carboxyl-terminal protease  57.14 
 
 		 401 aa  474  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0058  C-terminal processing peptidase  60.15 
 
 		 398 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.871061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0038  carboxyl-terminal protease  59.8 
 
 		 402 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  41 
 
 		 426 aa  278  9e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  39.15 
 
 		 446 aa  277  2e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  39.27 
 
 		 428 aa  275  8e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  36.62 
 
 		 441 aa  266  5e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  40.88 
 
 		 433 aa  264  2e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  39.4 
 
 		 440 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  40.27 
 
 		 443 aa  262  6e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  39.4 
 
 		 440 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  37.85 
 
 		 432 aa  262  8e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  42.15 
 
 		 410 aa  262  8.999999999999999e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  38.21 
 
 		 452 aa  259  4e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  40.37 
 
 		 462 aa  257  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  39.18 
 
 		 440 aa  256  5e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  37.7 
 
 		 440 aa  256  6e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  38.19 
 
 		 438 aa  255  9e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  38.72 
 
 		 443 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  37.19 
 
 		 434 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  37.31 
 
 		 415 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  38.78 
 
 		 436 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  38.78 
 
 		 436 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  36.93 
 
 		 439 aa  254  3e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  36.41 
 
 		 428 aa  253  3e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  36.86 
 
 		 458 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  36.86 
 
 		 457 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  38.06 
 
 		 455 aa  253  6e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  36.34 
 
 		 456 aa  252  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0539  carboxyl-terminal protease  38.35 
 
 		 444 aa  252  8.000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  37.37 
 
 		 452 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  37.37 
 
 		 423 aa  252  9.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  40.9 
 
 		 443 aa  252  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0618  carboxyl-terminal protease  38.64 
 
 		 444 aa  251  1e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.982226  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  36.34 
 
 		 445 aa  252  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  36.07 
 
 		 438 aa  251  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  38.89 
 
 		 439 aa  250  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  34.45 
 
 		 477 aa  250  4e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  40.24 
 
 		 422 aa  249  4e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  38.82 
 
 		 445 aa  249  5e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  36.66 
 
 		 451 aa  249  5e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  38.76 
 
 		 462 aa  249  6e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  36.14 
 
 		 447 aa  249  7e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  39.5 
 
 		 429 aa  249  8e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  37.06 
 
 		 440 aa  248  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  40.06 
 
 		 453 aa  248  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  37.06 
 
 		 440 aa  248  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  37.77 
 
 		 440 aa  248  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  37.26 
 
 		 463 aa  248  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  37.85 
 
 		 439 aa  247  2e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  39.19 
 
 		 445 aa  248  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  38.51 
 
 		 437 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  36.91 
 
 		 439 aa  247  3e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  38.04 
 
 		 440 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1420  carboxyl-terminal protease  37.78 
 
 		 444 aa  246  4.9999999999999997e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.14041  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  38.41 
 
 		 438 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  36.68 
 
 		 440 aa  246  6.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  38.97 
 
 		 439 aa  245  9e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  38.11 
 
 		 438 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  38.11 
 
 		 438 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  37.53 
 
 		 445 aa  245  9.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  35.11 
 
 		 483 aa  244  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  36.24 
 
 		 440 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0352  putative carboxy-terminal processing protease transmembrane protein  35.73 
 
 		 549 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77017  normal  0.100187 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  35 
 
 		 444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  37.68 
 
 		 451 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  36.36 
 
 		 435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  36.81 
 
 		 468 aa  244  3e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0704  carboxyl-terminal protease  38.46 
 
 		 437 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  37.26 
 
 		 448 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  37.26 
 
 		 448 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  40 
 
 		 441 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  35.82 
 
 		 515 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  37.23 
 
 		 444 aa  243  5e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0848  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  37.61 
 
 		 419 aa  243  5e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0053756  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  38.42 
 
 		 461 aa  243  5e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0669  C-terminal processing peptidase-3  38.2 
 
 		 437 aa  242  7e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  36.67 
 
 		 444 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0703  carboxyl-terminal protease  38.15 
 
 		 437 aa  242  9e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  36.08 
 
 		 515 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  38.3 
 
 		 463 aa  241  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  36.08 
 
 		 515 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  36.08 
 
 		 515 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  36.08 
 
 		 530 aa  242  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  34.3 
 
 		 468 aa  241  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  35.92 
 
 		 550 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  38.08 
 
 		 455 aa  241  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  36.86 
 
 		 521 aa  241  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>