77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4858 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4858  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4457  hypothetical protein  65.82 
 
 		 85 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.919934 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0079  hypothetical protein  57.89 
 
 		 88 aa  100  9e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3774  acetyltransferase-like  56.79 
 
 		 108 aa  99.8  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.463282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0084  hypothetical protein  55.7 
 
 		 87 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0065  hypothetical protein  54.43 
 
 		 88 aa  98.6  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0083  hypothetical protein  53.16 
 
 		 87 aa  98.2  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0079  hypothetical protein  53.16 
 
 		 87 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0080  hypothetical protein  54.43 
 
 		 87 aa  97.8  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0085  hypothetical protein  53.16 
 
 		 88 aa  97.8  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0082  hypothetical protein  53.16 
 
 		 87 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4184  hypothetical protein  57.14 
 
 		 82 aa  95.9  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3969  hypothetical protein  51.28 
 
 		 85 aa  87.4  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0071  hypothetical protein  53.95 
 
 		 79 aa  85.9  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3817  hypothetical protein  37.97 
 
 		 99 aa  64.3  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.4231  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2946  hypothetical protein  35 
 
 		 100 aa  62.8  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2072  hypothetical protein  35.44 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000410313  normal  0.04757 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2274  hypothetical protein  35.44 
 
 		 95 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000000180646  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2206  hypothetical protein  34.62 
 
 		 90 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.788583 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0141  hypothetical protein  27.5 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2765  hypothetical protein  31.25 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2768  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1764  hypothetical protein  32.91 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000155918  hitchhiker  0.000000000000406701 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4010  hypothetical protein  32.91 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000057579  normal  0.556915 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0210  acetyltransferase  38.27 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3447  hypothetical protein  32.91 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000030181  hitchhiker  0.000684662 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2553  acetyltransferase-like protein  32.91 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000305824  hitchhiker  0.000000000000131346 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1924  hypothetical protein  32.91 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000705286  hitchhiker  0.00000000000000488804 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2664  hypothetical protein  32.47 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0595784 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2323  hypothetical protein  32.91 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000526442  hitchhiker  0.0000374352 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3163  hypothetical protein  35.29 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.919705  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0921  hypothetical protein  34.88 
 
 		 117 aa  53.5  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.513329  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3559  hypothetical protein  31.65 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2243  acetyltransferase-like protein  28.21 
 
 		 93 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41930  hypothetical protein  31.65 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2724  hypothetical protein  33.82 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0839227  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0132  hypothetical protein  26.58 
 
 		 97 aa  51.2  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2713  hypothetical protein  28.4 
 
 		 95 aa  51.6  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1808  acetyltransferase  29.87 
 
 		 93 aa  50.4  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5465  hypothetical protein  30.99 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1807  acetyltransferase-like  31.25 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1960  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0681  hypothetical protein  32.5 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.126872 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1003  hypothetical protein  32.91 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709962  normal  0.531715 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1868  hypothetical protein  33.77 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.551038  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0713  acetyltransferase  38.18 
 
 		 90 aa  47.8  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0818284  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3475  acetyltransferase  34.67 
 
 		 111 aa  47.4  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4391  hypothetical protein  28.4 
 
 		 90 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.946399  normal  0.0400185 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2008  hypothetical protein  34.25 
 
 		 110 aa  47  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.370861 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1014  hypothetical protein  31.4 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.411227 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1761  acetyltransferase  28.57 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0128615  normal  0.0715534 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3553  hypothetical protein  32.47 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23120  hypothetical protein  29.11 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000670372  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2596  hypothetical protein  33.33 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2544  acetyltransferase-like protein  33.33 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0495517  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4721  hypothetical protein  34.78 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.534046  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1594  hypothetical protein  29.87 
 
 		 97 aa  45.1  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0106902  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3098  hypothetical protein  29.33 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207624  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3100  hypothetical protein  32.1 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386761  normal  0.125352 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2928  acetyltransferase-like protein  36.73 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.408165 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1504  hypothetical protein  29.63 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2082  acetyltransferase  38.1 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0804  hypothetical protein  28.57 
 
 		 92 aa  43.9  0.0009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1537  hypothetical protein  29.87 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3739  acetyltransferase-like protein  32.93 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1740  hypothetical protein  28.57 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3266  hypothetical protein  29.63 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.709169  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09658  Acetyltransferase  26.32 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00670  hypothetical protein  28.4 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.83104  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0652  hypothetical protein  28.57 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2917  GCN5-related N-acetyltransferase  29.87 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3806  hypothetical protein  29.23 
 
 		 93 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191308  normal  0.244144 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0163  GCN5-related N-acetyltransferase  28.77 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0061  hypothetical protein  28.95 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.372722 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5880  hypothetical protein  26.76 
 
 		 91 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.630682 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1574  hypothetical protein  25.97 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0562  hypothetical protein  32.84 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>