239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4857 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_4857  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
143 aa  299  1e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4456  thioesterase superfamily protein  75 
 
 
144 aa  234  3e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0074  thioesterase superfamily protein  73.57 
 
 
141 aa  230  6e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4183  thioesterase superfamily protein  72.34 
 
 
142 aa  229  7.000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0084  thioesterase superfamily protein  68.09 
 
 
154 aa  213  7e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0066  thioesterase superfamily protein  69.29 
 
 
146 aa  212  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0081  thioesterase superfamily protein  67.38 
 
 
154 aa  212  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0080  thioesterase superfamily protein  69.29 
 
 
150 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0086  thioesterase superfamily protein  69.29 
 
 
150 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0083  thioesterase superfamily protein  69.29 
 
 
142 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0080  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  67.38 
 
 
142 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0085  thioesterase superfamily protein  67.38 
 
 
154 aa  209  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3968  thioesterase superfamily protein  66.43 
 
 
140 aa  208  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4269  thioesterase superfamily protein  65.96 
 
 
150 aa  206  9e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3772  thioesterase superfamily protein  63.31 
 
 
142 aa  194  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.478707  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1527  hypothetical protein  61.72 
 
 
149 aa  173  6e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0073  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  59.23 
 
 
144 aa  170  5e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001138  predicted thioesterase  53.85 
 
 
150 aa  167  5e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06649  thioesterase  51.05 
 
 
150 aa  164  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  41.41 
 
 
146 aa  131  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  36.15 
 
 
139 aa  108  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0092  hypothetical protein  38.41 
 
 
161 aa  105  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2261  thioesterase superfamily protein  43.64 
 
 
161 aa  99.8  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0101  thioesterase superfamily protein  34.56 
 
 
161 aa  97.1  8e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  39.5 
 
 
156 aa  94  6e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  39.5 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1523  thioesterase superfamily protein  38.98 
 
 
134 aa  84.3  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  32.48 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  26.52 
 
 
137 aa  80.5  0.000000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04590  conserved hypothetical protein  32.33 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  33.6 
 
 
149 aa  78.6  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3287  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 
140 aa  72  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3983  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.813194  normal  0.0353277 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 
136 aa  72  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  30.97 
 
 
130 aa  69.7  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7358  thioesterase superfamily protein  32.03 
 
 
167 aa  70.1  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1898  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.292723 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3014  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.80515  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4309  thioesterase superfamily protein  32.46 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.515868  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1441  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  30.97 
 
 
130 aa  67.8  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  28.99 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2677  thioesterase superfamily protein  31.9 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2356  hypothetical protein  43.84 
 
 
134 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  29.01 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  29.01 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  28.24 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  28.24 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  28.24 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  42.65 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  28 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  28.89 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  30.36 
 
 
134 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
135 aa  64.3  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  28.89 
 
 
131 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  26.77 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.25 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4250  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.25 
 
 
148 aa  62  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  39.39 
 
 
133 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4751  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.25 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0612  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.01 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1786  thioesterase superfamily protein  32.98 
 
 
213 aa  62  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4627  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.25 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4642  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  30.25 
 
 
148 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4262  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.25 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1863  thioesterase  26.09 
 
 
147 aa  62  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102626  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4643  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.25 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  25.38 
 
 
136 aa  61.6  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03599  conserved hypothetical protein  32.61 
 
 
294 aa  61.2  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4343  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 
147 aa  61.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1693  thioesterase family protein  28.89 
 
 
159 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1114  thioesterase family protein  29.46 
 
 
143 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0224064  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1871  thioesterase family protein  29.46 
 
 
143 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1556  thioesterase family protein  29.46 
 
 
143 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000380649  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0217  thioesterase family protein  29.46 
 
 
143 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0748592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1717  thioesterase family protein  29.46 
 
 
143 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0944  thioesterase family protein  29.46 
 
 
143 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  25.6 
 
 
132 aa  60.5  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  24.19 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4623  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.25 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.69926  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3160  thioesterase superfamily protein  25.68 
 
 
180 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3214  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2065  thioesterase superfamily protein  28.12 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110405 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1151  thioesterase superfamily protein  38.1 
 
 
133 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.758431  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  24.62 
 
 
153 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  24.24 
 
 
155 aa  54.7  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07490  predicted thioesterase  33.7 
 
 
155 aa  54.7  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.736623 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  23.62 
 
 
148 aa  54.7  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1590  thioesterase superfamily protein  39.06 
 
 
135 aa  53.9  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.359349  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  23.85 
 
 
153 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  25.78 
 
 
143 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0496  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
132 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0513  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
132 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116803  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0503  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
132 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.159838 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0494  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
132 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0557  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
132 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638936  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1423  thioesterase family protein  27.19 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000396165  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2301  thioesterase superfamily protein  29.57 
 
 
149 aa  53.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>