More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4849 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4849  ABC transporter related  100 
 
 		 239 aa  494  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  61.43 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  57.47 
 
 		 228 aa  276  3e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  56.09 
 
 		 260 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  55.51 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  55.7 
 
 		 230 aa  272  4.0000000000000004e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  58.3 
 
 		 248 aa  270  1e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  57.47 
 
 		 236 aa  268  4e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  58.08 
 
 		 242 aa  268  5e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  55.56 
 
 		 233 aa  267  1e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  56.89 
 
 		 238 aa  267  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  53.81 
 
 		 236 aa  265  5e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  58.8 
 
 		 228 aa  264  8e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  53.12 
 
 		 227 aa  264  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  57.14 
 
 		 238 aa  264  1e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  59.72 
 
 		 228 aa  264  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  57.52 
 
 		 230 aa  263  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1167  ABC transporter related  54.94 
 
 		 235 aa  261  4.999999999999999e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  53.57 
 
 		 228 aa  261  8.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1635  ABC transporter related  54.67 
 
 		 229 aa  260  1e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  53.12 
 
 		 226 aa  260  2e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  55.16 
 
 		 238 aa  259  3e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  54.46 
 
 		 247 aa  258  4e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  57.66 
 
 		 255 aa  258  5.0000000000000005e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  55.75 
 
 		 246 aa  258  5.0000000000000005e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  54.3 
 
 		 224 aa  258  7e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  54.3 
 
 		 224 aa  258  7e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  54.3 
 
 		 224 aa  258  7e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  54.75 
 
 		 224 aa  258  8e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  53.85 
 
 		 224 aa  257  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  58.6 
 
 		 244 aa  257  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  53.85 
 
 		 224 aa  257  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  53.85 
 
 		 224 aa  256  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  55.36 
 
 		 232 aa  256  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  53.85 
 
 		 224 aa  256  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  53.39 
 
 		 228 aa  254  6e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  53.28 
 
 		 233 aa  254  6e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  56.11 
 
 		 242 aa  254  7e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  53.39 
 
 		 224 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  55.41 
 
 		 239 aa  253  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  53.39 
 
 		 224 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  53.85 
 
 		 228 aa  253  1.0000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  53.12 
 
 		 291 aa  253  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  53.85 
 
 		 237 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  53.39 
 
 		 224 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  59.26 
 
 		 228 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  53.95 
 
 		 253 aa  253  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0211  ABC transporter related  54.98 
 
 		 256 aa  252  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  56.11 
 
 		 237 aa  252  4.0000000000000004e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  56.44 
 
 		 253 aa  250  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  53.85 
 
 		 225 aa  250  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0222  ABC transporter related  53.74 
 
 		 247 aa  251  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256244  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  52.73 
 
 		 224 aa  249  3e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  52.94 
 
 		 229 aa  249  3e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  56 
 
 		 253 aa  248  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  54.71 
 
 		 229 aa  248  5e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1767  ATPase  52.75 
 
 		 248 aa  248  8e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132988  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0199  ABC transporter related  54.39 
 
 		 291 aa  248  9e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.500002  normal  0.26855 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  51.08 
 
 		 239 aa  246  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  50.87 
 
 		 230 aa  246  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4308  ABC transporter related  54.78 
 
 		 241 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4155  ABC transporter, ATPase subunit  54.78 
 
 		 241 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  52.94 
 
 		 225 aa  246  3e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4286  ABC transporter-related protein  54.78 
 
 		 241 aa  245  4e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  51.49 
 
 		 241 aa  243  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  51.57 
 
 		 226 aa  243  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  52.31 
 
 		 228 aa  242  3e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  52.49 
 
 		 226 aa  242  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  52.49 
 
 		 226 aa  242  3e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  54.3 
 
 		 241 aa  242  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3270  ABC transporter-like protein  53.95 
 
 		 248 aa  242  3e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.180128 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  54.17 
 
 		 248 aa  242  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  54.02 
 
 		 248 aa  242  5e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  54.17 
 
 		 248 aa  242  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  53.24 
 
 		 252 aa  241  6e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  53.85 
 
 		 241 aa  241  6e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  52.49 
 
 		 226 aa  241  6e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  52.49 
 
 		 226 aa  241  7e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  52.49 
 
 		 226 aa  241  7e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  52.49 
 
 		 226 aa  241  7e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  52.49 
 
 		 226 aa  241  7e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  52.49 
 
 		 226 aa  241  7e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  53.02 
 
 		 236 aa  241  7e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  52.49 
 
 		 226 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  52.7 
 
 		 233 aa  240  1e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  52.49 
 
 		 226 aa  240  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  52.49 
 
 		 226 aa  241  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  52.49 
 
 		 226 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  54.59 
 
 		 228 aa  239  2e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  52.4 
 
 		 235 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  51.3 
 
 		 240 aa  238  4e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  51.53 
 
 		 230 aa  239  4e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0595  ATPase  51.83 
 
 		 228 aa  238  5e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0833962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  52.49 
 
 		 244 aa  238  5e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1083  ABC transporter related  53.33 
 
 		 240 aa  238  6.999999999999999e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4296  ABC transporter related  54.63 
 
 		 242 aa  238  9e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0438871  normal  0.557698 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  53.78 
 
 		 247 aa  237  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  53.1 
 
 		 277 aa  237  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8875  ABC transporter-related protein  51.95 
 
 		 243 aa  236  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0534003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  56.6 
 
 		 236 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>