More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4827 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0119  peptidase M6, immune inhibitor A  57.42 
 
 
936 aa  1024    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00164276  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0047  peptidase M6, immune inhibitor A  56.56 
 
 
945 aa  1050    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  58.06 
 
 
938 aa  1038    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0130  protease, putative  57.03 
 
 
935 aa  1011    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4230  peptidase M6, immune inhibitor A  56.31 
 
 
871 aa  873    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.187448  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0094  peptidase M6, immune inhibitor A  56.01 
 
 
865 aa  907    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  58.22 
 
 
869 aa  934    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0828059  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4432  peptidase M6, immune inhibitor A  65.18 
 
 
951 aa  1209    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00957911  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0128  M6 family metalloprotease domain protein  56.93 
 
 
865 aa  902    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4827  M6 family metalloprotease  100 
 
 
965 aa  1960    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  57.2 
 
 
936 aa  1019    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337002  decreased coverage  0.00000000228409 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0124  peptidase M6, immune inhibitor A  57.36 
 
 
856 aa  924    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000205942  unclonable  0.000000000253026 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3744  peptidase M6, immune inhibitor A  62.93 
 
 
951 aa  1135    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000497616  decreased coverage  0.0000986058 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0129  M6 family metalloprotease  55.88 
 
 
871 aa  868    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4149  peptidase M6 immune inhibitor A  54.85 
 
 
938 aa  954    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0124  peptidase M6 immune inhibitor A  56.24 
 
 
867 aa  890    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1004  protease  38.61 
 
 
918 aa  578  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000922392  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2642  M6 family metalloprotease domain protein  35.91 
 
 
751 aa  396  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1437  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  33.74 
 
 
795 aa  366  1e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0880  peptidase M6 immune inhibitor A  34.28 
 
 
812 aa  365  2e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000627944  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4009  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  33.42 
 
 
795 aa  365  2e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000486649  decreased coverage  2.1693499999999997e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1197  immune inhibitor A metalloprotease  34.07 
 
 
795 aa  365  3e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.989973  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1175  immune inhibitor A  34.07 
 
 
795 aa  365  3e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1373  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  34.07 
 
 
795 aa  365  3e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000139862 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1295  immune inhibitor a metalloprotease  34.07 
 
 
795 aa  365  3e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00741002  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1396  immune inhibitor A metalloprotease  33.66 
 
 
796 aa  362  1e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00116744  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3001  immune inhibitor A  33.89 
 
 
795 aa  363  1e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.018121  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2240  immune inhibitor A  33.89 
 
 
795 aa  362  1e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00227044  hitchhiker  0.00000656343 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1177  immune inhibitor A  33.58 
 
 
796 aa  361  4e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3037  proteinase  33.77 
 
 
794 aa  360  6e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000211319  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1005  peptidase M6 immune inhibitor A  34.89 
 
 
795 aa  360  7e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1335  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  33.21 
 
 
796 aa  359  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00051672  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3035  immune inhibitor A  33.64 
 
 
794 aa  358  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000174925  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1199  peptidase M6 immune inhibitor A  34.24 
 
 
795 aa  351  5e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0164626  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0585  peptidase M6 immune inhibitor A  32.71 
 
 
796 aa  349  1e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0800  immune inhibitor A metalloprotease  31.99 
 
 
799 aa  348  4e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000400442  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0703  immune inhibitor A metalloprotease  31.9 
 
 
799 aa  346  1e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000682941  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4635  immune inhibitor A metalloprotease  31.77 
 
 
799 aa  344  5e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000450227  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0740  immune inhibitor A metalloprotease  31.74 
 
 
799 aa  343  7e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000142513  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0638  immune inhibitor A metalloprotease  31.74 
 
 
799 aa  342  2e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.160109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0672  immune inhibitor a metalloprotease  31.74 
 
 
799 aa  342  2e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000318006  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0581  immune inhibitor A, metalloprotease  31.61 
 
 
799 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0728  immune inhibitor A metalloprotease  31.62 
 
 
799 aa  340  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.74275e-60 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0582  immune inhibitor A, metalloprotease  31.5 
 
 
799 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.286356  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3107  immune inhibitor A  33.29 
 
 
795 aa  336  1e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.628659  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0333  M6 family metalloprotease domain protein  31.02 
 
 
763 aa  224  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.596223  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1277  peptidase M6, immune inhibitor A  29.58 
 
 
781 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.733002  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0344  M6 family metalloprotease domain protein  30.61 
 
 
763 aa  219  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1564  M6 family metalloprotease domain protein  28.38 
 
 
770 aa  219  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0322  peptidase M6, immune inhibitor A  30.37 
 
 
764 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117868  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2142  M6 family metalloprotease domain-containing protein  30.81 
 
 
927 aa  218  4e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.395329  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0799  M6 family metalloprotease domain-containing protein  28.06 
 
 
744 aa  208  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.252815  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  29.77 
 
 
1045 aa  198  3e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0829  peptidase M6, immune inhibitor A  30.13 
 
 
746 aa  197  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6351  hypothetical protein  27 
 
 
924 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4435  peptidase M6 immune inhibitor A  28.63 
 
 
806 aa  190  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.431227  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2724  peptidase M6 immune inhibitor A  28.44 
 
 
771 aa  189  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0015  peptidase M6, immune inhibitor A  27.6 
 
 
760 aa  184  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5286  M6 family metalloprotease domain protein  26.6 
 
 
768 aa  167  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.826763  normal  0.474282 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4803  M6 family metalloprotease domain-containing protein  26.47 
 
 
747 aa  160  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2257  M6 family metalloprotease domain protein  26.62 
 
 
811 aa  149  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0974167  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3939  peptidase M6, immune inhibitor A  26.73 
 
 
825 aa  137  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530479  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  39.26 
 
 
918 aa  111  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  39.15 
 
 
910 aa  96.3  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  45.14 
 
 
1150 aa  95.5  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  38.55 
 
 
1027 aa  93.6  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  45.26 
 
 
1565 aa  92.8  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  44.72 
 
 
1732 aa  90.5  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  44.58 
 
 
528 aa  88.6  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2374  M6 family metalloprotease domain protein  31.75 
 
 
566 aa  87.4  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239302  hitchhiker  0.000554149 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  36.96 
 
 
930 aa  85.9  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  43.05 
 
 
3295 aa  84.7  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  38.56 
 
 
658 aa  84  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  36.65 
 
 
675 aa  84  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  37.36 
 
 
752 aa  84  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  40 
 
 
1236 aa  84  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  33.73 
 
 
2176 aa  84  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  39.13 
 
 
713 aa  83.2  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  38.27 
 
 
581 aa  82.8  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  41.07 
 
 
1667 aa  82  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  32.35 
 
 
3197 aa  82  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  37.58 
 
 
551 aa  82  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  42.36 
 
 
2554 aa  82  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  37.11 
 
 
669 aa  81.6  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  34.44 
 
 
792 aa  80.9  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  41.6 
 
 
1842 aa  80.9  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  34.55 
 
 
1862 aa  80.9  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0698  cell surface protein  35.16 
 
 
586 aa  80.1  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  39.87 
 
 
735 aa  79.7  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  37.89 
 
 
679 aa  80.5  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  39.29 
 
 
786 aa  80.1  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  38.36 
 
 
1916 aa  80.1  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2144  peptidase M6, immune inhibitor A  28.4 
 
 
513 aa  79.7  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0726754  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  35.96 
 
 
861 aa  79.7  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  37.18 
 
 
859 aa  79.7  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  32.98 
 
 
1667 aa  79  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  33.14 
 
 
816 aa  78.6  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  35.11 
 
 
1969 aa  78.6  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  41.5 
 
 
2066 aa  78.6  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  41.14 
 
 
1120 aa  78.2  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>