29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4747 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_4747  methionine sulfoxide reductase A  100 
 
 
301 aa  614  1e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  normal  0.0101893 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0087  methionine sulfoxide reductase A  44.97 
 
 
299 aa  268  8e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000549703  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0553  hypothetical protein, putative phage gene  43.69 
 
 
294 aa  256  2e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.070631  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5903  methionine sulfoxide reductase A  42.72 
 
 
311 aa  231  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.964047  normal  0.547889 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1829  methionine sulfoxide reductase A  40.88 
 
 
306 aa  216  4e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.349811  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0619  hypothetical protein  37.97 
 
 
318 aa  202  5e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3168  hypothetical protein  40.75 
 
 
294 aa  202  8e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2394  hypothetical protein  39.33 
 
 
291 aa  195  8e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  5.39888e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1152  hypothetical protein  40.21 
 
 
334 aa  187  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.363384  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0232  hypothetical protein  40 
 
 
313 aa  185  6e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.227271  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2410  hypothetical protein  38.13 
 
 
300 aa  179  6e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0486  hypothetical protein  35.23 
 
 
281 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013307 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0802  hypothetical protein  36.55 
 
 
279 aa  163  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  2.0853e-13  hitchhiker  0.00290712 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1217  hypothetical protein  34.97 
 
 
299 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2225  hypothetical protein  32.3 
 
 
298 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0918911  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1942  hypothetical protein  34.47 
 
 
308 aa  146  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.350781  normal  0.226641 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3728  hypothetical protein  33.55 
 
 
324 aa  129  9e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.926929  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3159  methionine sulfoxide reductase A  30.88 
 
 
306 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.414524  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0622  hypothetical protein  29.54 
 
 
271 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3849  hypothetical protein  47 
 
 
102 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3776  hypothetical protein  47 
 
 
102 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0123  excinuclease ABC subunit C  32.12 
 
 
296 aa  92.8  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1485  hypothetical protein  28.83 
 
 
275 aa  92.8  7e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1177  hypothetical protein  23.67 
 
 
284 aa  87.8  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.027744  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03110  hypothetical protein  24.58 
 
 
277 aa  73.9  3e-12  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0440905  hitchhiker  1.2887e-20 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1147  hypothetical protein  24.63 
 
 
320 aa  54.7  2e-06  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2683  PfkB  23.98 
 
 
305 aa  47.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  5.99884e-05  normal  0.453356 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3080  hypothetical protein  33.33 
 
 
157 aa  46.2  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.779637  normal  0.178207 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0503  hypothetical protein  26.32 
 
 
277 aa  43.5  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>