More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4694 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_4694  30S ribosomal protein S7  100 
 
 
156 aa  318  2e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127766  unclonable  3.19623e-08 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4321  30S ribosomal protein S7  98.08 
 
 
156 aa  314  4e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00151135  unclonable  9.75416e-11 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3763  30S ribosomal protein S7  96.15 
 
 
156 aa  307  3e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  6.73821e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0180  30S ribosomal protein S7  95.51 
 
 
156 aa  306  6e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  5.36383e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0144  30S ribosomal protein S7  95.51 
 
 
156 aa  305  1e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  1.70326e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0209  30S ribosomal protein S7  94.87 
 
 
156 aa  305  1e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  2.77948e-07  unclonable  8.38241e-06 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0192  30S ribosomal protein S7  95.51 
 
 
156 aa  305  1e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0139894  n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4466  30S ribosomal protein S7  95.51 
 
 
156 aa  305  1e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0196  30S ribosomal protein S7  95.51 
 
 
156 aa  305  1e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00224175  hitchhiker  0.00012084 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4060  30S ribosomal protein S7  95.51 
 
 
156 aa  305  1e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00273725  hitchhiker  1.07053e-06 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0154  30S ribosomal protein S7  94.87 
 
 
156 aa  305  2e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00529705  decreased coverage  3.85897e-05 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0166  30S ribosomal protein S7  95.51 
 
 
156 aa  304  3e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  2.61088e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0190  30S ribosomal protein S7  93.59 
 
 
156 aa  300  7e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0202713  decreased coverage  0.000349844 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0195  30S ribosomal protein S7  93.59 
 
 
156 aa  300  7e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0296111  hitchhiker  5.62021e-06 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0227  30S ribosomal protein S7  93.59 
 
 
156 aa  300  7e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0195  30S ribosomal protein S7  92.95 
 
 
156 aa  299  1e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0242327  hitchhiker  2.00344e-07 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00056  30S ribosomal protein S7  85.26 
 
 
156 aa  280  6e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2772  30S ribosomal protein S7  84.62 
 
 
156 aa  280  8e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.43156e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002298  SSU ribosomal protein S7p (S5e)  85.26 
 
 
156 aa  279  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  1.49814e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0311  30S ribosomal protein S7  83.33 
 
 
156 aa  275  1e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00398327  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0601  30S ribosomal protein S7  83.33 
 
 
156 aa  272  1e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00129105  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0399  30S ribosomal protein S7  81.41 
 
 
156 aa  270  4e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  5.0235e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3829  30S ribosomal protein S7  81.41 
 
 
156 aa  270  8e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  5.24662e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4766  30S ribosomal protein S7  81.41 
 
 
156 aa  267  4e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.256339  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0372  ribosomal protein S7  80.77 
 
 
179 aa  266  5e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.81403e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00699  30S ribosomal protein S7  81.41 
 
 
156 aa  266  5e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000258418  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4008  30S ribosomal protein S7  80.77 
 
 
156 aa  266  6e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  1.90048e-06  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03192  30S ribosomal protein S7  80.77 
 
 
156 aa  266  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  2.37344e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3644  30S ribosomal protein S7  80.77 
 
 
156 aa  266  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.82494e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3643  30S ribosomal protein S7  80.77 
 
 
156 aa  266  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  2.28448e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3715  30S ribosomal protein S7  80.77 
 
 
156 aa  266  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.21434e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3622  30S ribosomal protein S7  80.77 
 
 
156 aa  266  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  8.5728e-09  hitchhiker  0.000566126 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0372  30S ribosomal protein S7  80.77 
 
 
156 aa  266  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  1.27849e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4650  30S ribosomal protein S7  80.77 
 
 
156 aa  266  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  3.26428e-09  normal  0.0163007 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4550  30S ribosomal protein S7  80.13 
 
 
156 aa  266  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  1.47875e-10  normal  0.0998132 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3810  30S ribosomal protein S7  80.77 
 
 
156 aa  266  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.03043e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3537  30S ribosomal protein S7  80.77 
 
 
156 aa  266  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.2775e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3815  30S ribosomal protein S7  80.77 
 
 
156 aa  266  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00401885  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3717  30S ribosomal protein S7  80.13 
 
 
156 aa  265  3e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000788892  normal  0.0799538 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3752  30S ribosomal protein S7  80.13 
 
 
156 aa  265  3e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00237003  normal  0.0489847 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3920  30S ribosomal protein S7  79.49 
 
 
156 aa  263  5e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  4.6544e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0276  30S ribosomal protein S7  79.49 
 
 
156 aa  263  5e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  2.11572e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3677  30S ribosomal protein S7  79.49 
 
 
156 aa  263  5e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.2423e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3758  30S ribosomal protein S7  79.49 
 
 
156 aa  263  8e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  6.81403e-09  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0317  30S ribosomal protein S7  79.49 
 
 
156 aa  263  9e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  1.14768e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3439  30S ribosomal protein S7  80.13 
 
 
156 aa  259  7e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000192356  decreased coverage  2.49886e-05 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1646  30S ribosomal protein S7  78.85 
 
 
156 aa  253  1e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  7.14502e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0493  30S ribosomal protein S7  70.51 
 
 
156 aa  239  9e-63  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4280  30S ribosomal protein S7  73.25 
 
 
157 aa  238  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  7.00691e-05  unclonable  2.87747e-12 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2328  30S ribosomal protein S7  73.72 
 
 
156 aa  235  1e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  1.57389e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06200  30S ribosomal protein S7  72.44 
 
 
156 aa  235  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  71.15 
 
 
156 aa  233  6e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  2.87313e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0480  30S ribosomal protein S7  71.79 
 
 
156 aa  232  1e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.037317  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2328  30S ribosomal protein S7  71.15 
 
 
155 aa  232  1e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  1.86286e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0454  30S ribosomal protein S7  69.87 
 
 
156 aa  232  1e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0483  30S ribosomal protein S7  71.79 
 
 
156 aa  232  1e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0139239  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0450  30S ribosomal protein S7  71.79 
 
 
156 aa  232  1e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0295757  unclonable  3.15052e-07 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3913  30S ribosomal protein S7  71.79 
 
 
156 aa  232  1e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240756  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4753  30S ribosomal protein S7  71.79 
 
 
156 aa  232  1e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00430296  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  71.15 
 
 
156 aa  230  4e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  4.91637e-05  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0622  ribosomal protein S7  69.87 
 
 
156 aa  228  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0341393  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0417  30S ribosomal protein S7  69.87 
 
 
156 aa  228  3e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00230825  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4552  30S ribosomal protein S7  69.87 
 
 
156 aa  228  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.881982  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1862  30S ribosomal protein S7  71.34 
 
 
157 aa  228  3e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  3.2235e-09  normal  0.176384 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5083  30S ribosomal protein S7  70.7 
 
 
157 aa  227  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000594669  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08810  30S ribosomal protein S7  69.87 
 
 
156 aa  227  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.517353  normal  0.0114228 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0833  30S ribosomal protein S7  69.87 
 
 
156 aa  227  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.628851  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0862  30S ribosomal protein S7  67.31 
 
 
155 aa  226  9e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2173  ribosomal protein S7  69.23 
 
 
155 aa  225  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.147945  normal  0.690329 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2186  30S ribosomal protein S7  69.43 
 
 
157 aa  224  3e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  9.75548e-07  decreased coverage  0.00846065 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1896  30S ribosomal protein S7  69.43 
 
 
157 aa  224  4e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  1.18466e-08  normal  0.346156 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0697  30S ribosomal protein S7  68.59 
 
 
156 aa  221  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.92672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3342  30S ribosomal protein S7  67.31 
 
 
156 aa  219  1e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00383081  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0319  ribosomal protein S7  68.15 
 
 
156 aa  218  3e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  2.98761e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0493  30S ribosomal protein S7  66.67 
 
 
156 aa  217  6e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00259026  hitchhiker  4.89129e-08 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0323  30S ribosomal protein S7  66.67 
 
 
156 aa  217  6e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.111049  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1908  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 
156 aa  216  8e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.049372 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1930  30S ribosomal protein S7  65.38 
 
 
156 aa  216  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2015  30S ribosomal protein S7  65.38 
 
 
156 aa  216  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0275  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 
156 aa  215  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  2.13948e-11  unclonable  9.69286e-08 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1949  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 
156 aa  214  3e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.740845  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0291  30S ribosomal protein S7  66.24 
 
 
157 aa  214  4e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  1.26021e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2376  30S ribosomal protein S7  67.59 
 
 
156 aa  213  6e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.000622465  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0401  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 
156 aa  213  1e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  1.62716e-05  normal  0.0793455 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3447  30S ribosomal protein S7  67.31 
 
 
156 aa  212  2e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0304282  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1552  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 
156 aa  212  2e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00138461  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0763  30S ribosomal protein S7  66.03 
 
 
156 aa  212  2e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.438706  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0365  30S ribosomal protein S7  64.37 
 
 
175 aa  212  2e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0390  30S ribosomal protein S7  64.37 
 
 
175 aa  212  2e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0315  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 
156 aa  212  2e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.99875e-22  hitchhiker  0.000536681 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0046  30S ribosomal protein S7  65.38 
 
 
156 aa  210  5e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  2.96735e-12  hitchhiker  6.48919e-23 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0752  30S ribosomal protein S7  62.42 
 
 
157 aa  210  7e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.637103  normal  0.155777 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0269  30S ribosomal protein S7  64.97 
 
 
157 aa  209  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  2.99452e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0274  30S ribosomal protein S7  64.97 
 
 
157 aa  209  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.165501  hitchhiker  1.62454e-06 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2193  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
155 aa  209  1e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.486436  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3862  30S ribosomal protein S7  65.38 
 
 
156 aa  208  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0049  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 
156 aa  209  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  5.74292e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2103  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 
155 aa  207  3e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0252  30S ribosomal protein S7  65.61 
 
 
157 aa  207  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  2.13878e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  207  4e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.600626 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>