51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4494 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4494  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  481  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3792  hypothetical protein  33.63 
 
 		 231 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0522  hypothetical protein  33.48 
 
 		 231 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0552  hypothetical protein  32.74 
 
 		 231 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0547  hypothetical protein  32.74 
 
 		 231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2453  hypothetical protein  31.82 
 
 		 231 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4822  hypothetical protein  28.51 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.75667 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1558  hypothetical protein  30.67 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0437869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1174  hypothetical protein  29.49 
 
 		 237 aa  95.5  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.58275  normal  0.922982 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0480  hypothetical protein  27.19 
 
 		 230 aa  92  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0007  hypothetical protein  26.94 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00581263  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1991  hypothetical protein  28.89 
 
 		 232 aa  90.9  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04711  conserved hypothetical protein  29.58 
 
 		 269 aa  90.1  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2922  hypothetical protein  26.91 
 
 		 247 aa  88.6  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.625248  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4153  hypothetical protein  34.72 
 
 		 243 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.386846  normal  0.411315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4521  hypothetical protein  34.48 
 
 		 244 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1897  hypothetical protein  28.57 
 
 		 245 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.850537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1815  hypothetical protein  26.41 
 
 		 245 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.668291  normal  0.837266 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2269  hypothetical protein  25.33 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6868  hypothetical protein  28.32 
 
 		 239 aa  86.3  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5898  hypothetical protein  27.63 
 
 		 239 aa  85.9  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1107  hypothetical protein  28.7 
 
 		 249 aa  85.5  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4635  hypothetical protein  32.89 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.863479  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  27.03 
 
 		 544 aa  84.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4909  hypothetical protein  33.99 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.983683  normal  0.108673 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2549  hypothetical protein  24.45 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1551  hypothetical protein  23.38 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44673  predicted protein  22.18 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.173616  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44556  predicted protein  29.7 
 
 		 484 aa  71.6  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44864  predicted protein  27.33 
 
 		 492 aa  68.2  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3059  hypothetical protein  25.14 
 
 		 415 aa  62.4  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.788767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_3566  predicted protein  26.75 
 
 		 342 aa  58.9  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0529465  normal  0.0506785 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4908  hypothetical protein  25.32 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30636  predicted protein  25.97 
 
 		 483 aa  56.6  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0819532  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0074  hypothetical protein  26.25 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0072  hypothetical protein  26.25 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_9586  predicted protein  38.57 
 
 		 70 aa  53.9  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0024  hypothetical protein  26.32 
 
 		 396 aa  54.3  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.750506 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37092  predicted protein  26.01 
 
 		 389 aa  52.8  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.307269  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18359  predicted protein  23.16 
 
 		 439 aa  52.4  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.523729  normal  0.0221416 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0221  hypothetical protein  23.84 
 
 		 400 aa  52.8  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00105596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4748  hypothetical protein  23.67 
 
 		 393 aa  52  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2384  hypothetical protein  24.54 
 
 		 400 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18771  hypothetical protein  26.04 
 
 		 407 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.445832 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4530  hypothetical protein  23.53 
 
 		 397 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.355101 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2362  hypothetical protein  21.93 
 
 		 239 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1338  hypothetical protein  27.32 
 
 		 392 aa  45.8  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.265714  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06301  hypothetical protein  27.62 
 
 		 390 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.949662  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0040  hypothetical protein  27.04 
 
 		 392 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1119  hypothetical protein  25.44 
 
 		 398 aa  43.1  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0692981  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06601  hypothetical protein  26.52 
 
 		 390 aa  42  0.009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>