More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4393 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4393  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 323 aa  655    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0150137  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4089  HlyD family secretion protein  85.09 
 
 		 324 aa  546  1e-154  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3463  secretion protein HlyD family protein  85.09 
 
 		 324 aa  545  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0488  secretion protein HlyD family protein  85.09 
 
 		 324 aa  545  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3639  secretion protein HlyD family protein  84.78 
 
 		 324 aa  543  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0583  secretion protein HlyD family protein  83.18 
 
 		 324 aa  535  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0506  secretion protein HlyD family protein  81.93 
 
 		 324 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0531  secretion protein HlyD family protein  81.62 
 
 		 324 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3813  secretion protein HlyD family protein  81.31 
 
 		 324 aa  524  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.103325  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0527  secretion protein HlyD family protein  81.62 
 
 		 324 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0568004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3729  secretion protein HlyD family protein  76.32 
 
 		 329 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3745  secretion protein HlyD family protein  81.37 
 
 		 323 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0412  secretion protein HlyD family protein  78.33 
 
 		 323 aa  487  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.604128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0567  secretion protein HlyD family protein  79.88 
 
 		 323 aa  483  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.142155 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0478  HlyD family secretion protein  73.21 
 
 		 322 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.161841 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003317  membrane-fusion protein  60.63 
 
 		 326 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1212  hypothetical protein  59.87 
 
 		 324 aa  369  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000214097  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0618  putative secretion protein, HlyD family  57.05 
 
 		 326 aa  360  2e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02435  hypothetical protein  60.63 
 
 		 326 aa  343  2.9999999999999997e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1840  hypothetical protein  54.49 
 
 		 332 aa  334  9e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.137202  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0477  hypothetical protein  53.55 
 
 		 332 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0396  secretion protein HlyD family protein  53.23 
 
 		 330 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1039  secretion protein HlyD  39.81 
 
 		 427 aa  236  5.0000000000000005e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1026  secretion protein HlyD family protein  38.82 
 
 		 326 aa  231  2e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4571  secretion protein HlyD family protein  45.85 
 
 		 349 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.707913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0653  secretion protein HlyD family protein  39.88 
 
 		 357 aa  226  3e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0093  HlyD family secretion protein  40.44 
 
 		 331 aa  221  9.999999999999999e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0320304 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0604  secretion protein HlyD family protein  41.19 
 
 		 326 aa  218  1e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1173  secretion protein HlyD family protein  43.2 
 
 		 337 aa  207  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1189  secretion protein HlyD  36.77 
 
 		 323 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.315896  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2682  secretion protein HlyD family protein  36.99 
 
 		 323 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430212  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2777  secretion protein HlyD family protein  36.77 
 
 		 323 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.991626  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4808  secretion protein HlyD family protein  35.64 
 
 		 330 aa  169  6e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20080  hypothetical protein  32.18 
 
 		 323 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1728  hypothetical protein  32.4 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0534587  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0499  secretion protein HlyD family protein  33.74 
 
 		 323 aa  161  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2703  secretion protein HlyD family protein  33.54 
 
 		 367 aa  157  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1925  secretion protein HlyD family protein  29.22 
 
 		 328 aa  143  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0178624 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  30.95 
 
 		 353 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0179  secretion protein HlyD  28.4 
 
 		 334 aa  116  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.235811  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2701  secretion protein HlyD family protein  28.71 
 
 		 333 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2328  secretion protein HlyD  26.84 
 
 		 398 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  29.51 
 
 		 335 aa  97.8  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  26.38 
 
 		 328 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  26.99 
 
 		 335 aa  87  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.63 
 
 		 462 aa  86.3  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0317  secretion protein HlyD family protein  27.14 
 
 		 354 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  28.4 
 
 		 342 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  27.04 
 
 		 357 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3445  secretion protein HlyD family protein  27.7 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2687  HlyD family secretion protein  26.69 
 
 		 357 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1503  secretion protein HlyD family protein  26.76 
 
 		 357 aa  78.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.996003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  30.72 
 
 		 349 aa  79  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  30.72 
 
 		 349 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0700  putative lipoprotein  29.02 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  23.73 
 
 		 395 aa  78.2  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  24.85 
 
 		 375 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  26.6 
 
 		 359 aa  76.6  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  24.55 
 
 		 349 aa  75.9  0.0000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  24.16 
 
 		 344 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  25.43 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.57 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1943  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.44 
 
 		 450 aa  74.7  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1611  secretion protein HlyD  25.83 
 
 		 341 aa  75.1  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306933  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0809  secretion protein HlyD family protein  24.91 
 
 		 351 aa  74.7  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  25.38 
 
 		 467 aa  74.3  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0499  secretion protein HlyD family protein  25.23 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0760  secretion protein HlyD family protein  26.04 
 
 		 363 aa  73.9  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1744  secretion protein HlyD family protein  25.7 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348418 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  28.39 
 
 		 357 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0564  secretion protein HlyD family protein  25.99 
 
 		 343 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  25.1 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0748  secretion protein HlyD family protein  31.07 
 
 		 343 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0153902  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  28.37 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  25.26 
 
 		 335 aa  73.2  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69090  hypothetical protein  24.6 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  28.19 
 
 		 329 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0535  secretion protein HlyD family protein  26.35 
 
 		 339 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.482241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  28.03 
 
 		 333 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5975  hypothetical protein  26.13 
 
 		 382 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0351  secretion protein HlyD  23.84 
 
 		 326 aa  72.4  0.000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003056  multidrug resistance efflux pump  23.83 
 
 		 354 aa  72  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0439  Type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  29.17 
 
 		 357 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1013  secretion protein HlyD  24.77 
 
 		 394 aa  72  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0866  multidrug resistance protein A  24.71 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  26.64 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0168  secretion protein HlyD  28.43 
 
 		 356 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188471 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3250  hypothetical protein  24.4 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0211  secretion protein HlyD family protein  28.93 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  25 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2775  type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  28.67 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1038  Type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  28.67 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2632  putative efflux transporter, MFP subunit  28.67 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1949  secretion protein HlyD family protein  26.64 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.262528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  25.09 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6207  secretion protein HlyD family protein  26.99 
 
 		 357 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9216  HlyD family secretion protein  24.73 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0146  auxiliary membrane fusion protein family transporter  23.63 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237701  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3661  HlyD family secretion protein  28.18 
 
 		 389 aa  69.7  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0017  secretion protein HlyD family protein  26.65 
 
 		 332 aa  69.7  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>