More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4260 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4260  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  699    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951955 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0704  hypothetical protein  82.04 
 
 		 363 aa  586  1e-166  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3633  hypothetical protein  75.82 
 
 		 350 aa  546  1e-154  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2332  hypothetical protein  74.03 
 
 		 335 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.946528  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2449  hypothetical protein  74.33 
 
 		 335 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.861715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2332  hypothetical protein  74.33 
 
 		 335 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.97863  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2014  hypothetical protein  74.03 
 
 		 335 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3324  hypothetical protein  74.33 
 
 		 353 aa  535  1e-151  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2105  hypothetical protein  74.63 
 
 		 335 aa  535  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3286  hypothetical protein  74.03 
 
 		 335 aa  529  1e-149  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1873  hypothetical protein  74.03 
 
 		 335 aa  530  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2451  hypothetical protein  73.43 
 
 		 380 aa  526  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3595  hypothetical protein  71.26 
 
 		 335 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.222828  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1912  hypothetical protein  72.1 
 
 		 321 aa  502  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3598  hypothetical protein  52.52 
 
 		 338 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0070  hypothetical protein  49.2 
 
 		 338 aa  330  2e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4815  hypothetical protein  48.66 
 
 		 338 aa  324  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195224  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4481  hypothetical protein  48.97 
 
 		 338 aa  315  5e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4172  hypothetical protein  48.53 
 
 		 338 aa  309  4e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1491  hypothetical protein  34.16 
 
 		 308 aa  134  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000879827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1342  protein of unknown function Met10  29.1 
 
 		 390 aa  116  6e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.425757  hitchhiker  0.0000000474621 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5177  hypothetical protein  29.89 
 
 		 398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5001  hypothetical protein  29.89 
 
 		 398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397476  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5127  hypothetical protein  29.89 
 
 		 398 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.775226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02010  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.72 
 
 		 699 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.347097  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0338  hypothetical protein  29.89 
 
 		 398 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  28 
 
 		 415 aa  114  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4199  SAM-dependent methyltransferase  29.24 
 
 		 399 aa  113  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  29.84 
 
 		 389 aa  112  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4764  hypothetical protein  29.5 
 
 		 398 aa  112  9e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.095661 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03350  SAM-dependent methyltransferase  28.74 
 
 		 397 aa  111  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02689  methyltransferase  30.7 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04640  hypothetical protein  31.34 
 
 		 398 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0412  hypothetical protein  29.89 
 
 		 398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0447  hypothetical protein  30.97 
 
 		 398 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2005  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.11 
 
 		 701 aa  109  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.391349  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1849  methyltransferase small  30.92 
 
 		 398 aa  108  9.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003801  methyltransferase  30.7 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1143  hypothetical protein  35.75 
 
 		 321 aa  108  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2745  putative RNA methylase  30 
 
 		 426 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1686  hypothetical protein  31.5 
 
 		 305 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000452263  normal  0.0252505 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2777  hypothetical protein  32.5 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00142049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2359  hypothetical protein  31 
 
 		 305 aa  107  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2680  hypothetical protein  32.5 
 
 		 305 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00757466  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1918  hypothetical protein  30.37 
 
 		 318 aa  106  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5354  SAM-dependent methyltransferase  28.02 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0694951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1486  hypothetical protein  31.88 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000118993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1701  hypothetical protein  28.89 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000328328  normal  0.027964 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  28.38 
 
 		 393 aa  104  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2701  hypothetical protein  32.14 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000560458  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  30.2 
 
 		 396 aa  104  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  29.86 
 
 		 392 aa  104  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1545  hypothetical protein  32.37 
 
 		 303 aa  103  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013291  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4368  PUA domain-containing protein  27.08 
 
 		 399 aa  102  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1865  hypothetical protein  33.86 
 
 		 389 aa  102  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4665  hypothetical protein  27.47 
 
 		 399 aa  102  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4650  hypothetical protein  27.16 
 
 		 399 aa  102  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3144  hypothetical protein  29.55 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  29.45 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1551  hypothetical protein  32.01 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0147626  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1049  hypothetical protein  31.56 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157301  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3577  SAM-dependent methyltransferase-like protein  34.81 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.586441 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  27.14 
 
 		 400 aa  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2890  hypothetical protein  30.58 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0038147  hitchhiker  0.00000713173 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0619  hypothetical protein  25.81 
 
 		 403 aa  101  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2919  hypothetical protein  30.91 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1136  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.47 
 
 		 702 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.237115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1102  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.47 
 
 		 702 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907291  normal  0.597986 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1170  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.47 
 
 		 702 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.988002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3530  hypothetical protein  33.33 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.524505  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1019  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.47 
 
 		 702 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000163679  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  31.1 
 
 		 394 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1123  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.47 
 
 		 702 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.482785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3932  hypothetical protein  28.27 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2527  hypothetical protein  35.56 
 
 		 320 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  28.34 
 
 		 393 aa  100  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  28.67 
 
 		 393 aa  99.8  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  28.57 
 
 		 391 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  31.12 
 
 		 397 aa  100  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  29.18 
 
 		 418 aa  100  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41962  predicted protein  27.46 
 
 		 493 aa  99.8  6e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0487312 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2337  hypothetical protein  35.56 
 
 		 320 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.623791 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  25.75 
 
 		 391 aa  99.8  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3236  PUA domain-containing protein  26.79 
 
 		 399 aa  99.4  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.553903  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4274  methyltransferase  27.47 
 
 		 399 aa  99.4  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.314948  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4285  methyltransferase  26.85 
 
 		 399 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  26.33 
 
 		 418 aa  99.4  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3930  protein of unknown function Met10  31.08 
 
 		 479 aa  99.4  8e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4666  hypothetical protein  26.85 
 
 		 399 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0587  hypothetical protein  26.85 
 
 		 399 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4653  hypothetical protein  26.85 
 
 		 399 aa  99.4  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  31.13 
 
 		 397 aa  99  9e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  29.23 
 
 		 393 aa  98.6  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4435  hypothetical protein  26.54 
 
 		 399 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4780  hypothetical protein  26.54 
 
 		 399 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1812  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.15 
 
 		 711 aa  98.6  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0884579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  29.35 
 
 		 408 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2385  hypothetical protein  28.68 
 
 		 304 aa  97.8  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000477017  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1761  oxidoreductase  26.38 
 
 		 389 aa  97.8  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2247  hypothetical protein  30.04 
 
 		 396 aa  97.4  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>