97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4254 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3573  decaheme cytochrome c  57.62 
 
 		 716 aa  785    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3588  decaheme cytochrome c  68.77 
 
 		 745 aa  1042    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4254  decaheme cytochrome c  100 
 
 		 729 aa  1520    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.353597  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1526  decaheme cytochrome c  41.17 
 
 		 738 aa  531  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.324001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2524  decaheme cytochrome c  37.55 
 
 		 725 aa  463  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000418395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  36.42 
 
 		 727 aa  459  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  37.08 
 
 		 722 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2577  decaheme cytochrome c  37.35 
 
 		 731 aa  450  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00883016  decreased coverage  0.00925289 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2509  decaheme cytochrome c  37.53 
 
 		 731 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000184393  hitchhiker  0.000632353 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1590  decaheme cytochrome c  37.05 
 
 		 730 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000452412  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1579  decaheme cytochrome c  36.78 
 
 		 730 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874065  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1613  decaheme cytochrome c  36.91 
 
 		 730 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3124  decaheme cytochrome c  36.9 
 
 		 741 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00184772  hitchhiker  0.000042193 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1209  decaheme cytochrome c  36.3 
 
 		 729 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00658895  normal  0.327868 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2675  decaheme cytochrome c  36.84 
 
 		 724 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000733685  normal  0.0455406 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  36.46 
 
 		 719 aa  437  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1779  decaheme cytochrome c  37.05 
 
 		 735 aa  438  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2697  decaheme cytochrome c  36.75 
 
 		 745 aa  433  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0633196  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2636  decaheme cytochrome c  35.19 
 
 		 724 aa  426  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2522  decaheme cytochrome c  35.25 
 
 		 720 aa  414  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  29.97 
 
 		 822 aa  144  7e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3200  hypothetical protein  25.15 
 
 		 820 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  24.17 
 
 		 639 aa  125  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2292  hypothetical protein  25.13 
 
 		 782 aa  124  8e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  23.68 
 
 		 639 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  23.94 
 
 		 639 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  0.0000444921 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  24.16 
 
 		 639 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2764  hypothetical protein  27.63 
 
 		 843 aa  119  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.185672  hitchhiker  0.000000808171 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  23.38 
 
 		 639 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1479  hypothetical protein  30.1 
 
 		 833 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0424195  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  23.47 
 
 		 639 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000158979  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  23.16 
 
 		 639 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  23.38 
 
 		 639 aa  112  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2578  decaheme cytochrome c  24.44 
 
 		 650 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00427395  decreased coverage  0.00803379 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  23.38 
 
 		 639 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  24.71 
 
 		 650 aa  109  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4083  hypothetical protein  25.25 
 
 		 826 aa  108  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0344261  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  25.13 
 
 		 650 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000205402  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  25.13 
 
 		 650 aa  106  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1208  decaheme cytochrome c  25.16 
 
 		 656 aa  106  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.474569  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0875  hypothetical protein  24.28 
 
 		 893 aa  106  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0421546 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  25.23 
 
 		 650 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000235795  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  22.87 
 
 		 646 aa  104  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1187  hypothetical protein  22 
 
 		 778 aa  104  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  24.51 
 
 		 650 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  0.000000731399 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3251  hypothetical protein  22.71 
 
 		 788 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3108  hypothetical protein  22.55 
 
 		 788 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3098  hypothetical protein  22.82 
 
 		 789 aa  101  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1478  decaheme cytochrome c  26.07 
 
 		 663 aa  101  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000254716  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1731  multiheme cytochrome  27.52 
 
 		 898 aa  100  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3286  hypothetical protein  23.33 
 
 		 714 aa  100  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.909593  hitchhiker  0.000000468411 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1257  hypothetical protein  28.24 
 
 		 762 aa  100  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1268  hypothetical protein  22.64 
 
 		 789 aa  97.1  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.487663  hitchhiker  0.00130496 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1778  decaheme cytochrome c  22.32 
 
 		 671 aa  95.9  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1345  multiheme cytochrome  23.81 
 
 		 742 aa  95.5  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3371  hypothetical protein  22.22 
 
 		 895 aa  94.4  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2523  hypothetical protein  22.47 
 
 		 757 aa  94.4  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2216  hypothetical protein  27.09 
 
 		 898 aa  91.3  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.352223  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  24.31 
 
 		 885 aa  89.7  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1658  hypothetical protein  26.84 
 
 		 898 aa  89.7  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131846  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  22.93 
 
 		 639 aa  89  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3125  decaheme cytochrome c  22.56 
 
 		 667 aa  88.6  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00001045  hitchhiker  0.00000606277 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0910  hypothetical protein  24.72 
 
 		 731 aa  88.2  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.688824 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2510  decaheme cytochrome c  22.61 
 
 		 655 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178218  hitchhiker  0.000666167 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2603  hypothetical protein  23.78 
 
 		 742 aa  82.4  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430741  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2637  decaheme cytochrome c  23.42 
 
 		 653 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1244  hypothetical protein  23.85 
 
 		 742 aa  79.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0505071  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4048  hypothetical protein  22.91 
 
 		 764 aa  79  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  23.15 
 
 		 640 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0918  decaheme cytochrome c  22.59 
 
 		 764 aa  78.2  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.613412  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2299  hypothetical protein  23.1 
 
 		 809 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1421  hypothetical protein  23.17 
 
 		 657 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6275  decaheme c-type cytochrome, OmcA/MtrC family  26.69 
 
 		 741 aa  71.2  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0913  decaheme cytochrome c  23.06 
 
 		 770 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546873  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0963  hypothetical protein  22.49 
 
 		 816 aa  63.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.830117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1473  decaheme cytochrome c  22.86 
 
 		 761 aa  63.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000262006  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2525  decaheme cytochrome c  22.57 
 
 		 656 aa  62.8  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3466  hypothetical protein  22.67 
 
 		 785 aa  62.4  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.724503 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0998  decaheme cytochrome c  21.51 
 
 		 766 aa  62  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1478  decaheme cytochrome c  22.73 
 
 		 761 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.174618  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2613  decaheme cytochrome c  22.56 
 
 		 762 aa  58.9  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000355284  hitchhiker  0.00000740819 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1713  hypothetical protein  26.38 
 
 		 945 aa  58.2  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.436521  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2990  hypothetical protein  28.57 
 
 		 680 aa  58.2  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1509  decaheme cytochrome c  22.65 
 
 		 764 aa  58.2  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.130709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2228  decaheme cytochrome c  22.48 
 
 		 755 aa  58.2  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.236086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2874  decaheme cytochrome c  22.9 
 
 		 764 aa  57.4  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0594793  hitchhiker  0.00000891097 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3263  hypothetical protein  28.22 
 
 		 655 aa  53.9  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1380  decaheme cytochrome c  22.22 
 
 		 765 aa  53.5  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2787  decaheme cytochrome c  22.31 
 
 		 762 aa  53.5  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2680  decaheme cytochrome c  22.65 
 
 		 762 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463028  unclonable  0.0000643351 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  21.43 
 
 		 936 aa  53.1  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2698  decaheme cytochrome c  22.34 
 
 		 671 aa  52  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0681671  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1409  hypothetical protein  21.74 
 
 		 696 aa  48.9  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2580  hypothetical protein  26.67 
 
 		 677 aa  48.5  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4517  hypothetical protein  25.25 
 
 		 642 aa  45.8  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.247929 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2379  hypothetical protein  38.33 
 
 		 1111 aa  45.4  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.49944  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0450  hypothetical protein  35.42 
 
 		 687 aa  43.9  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>