More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4183 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_4183  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  100 
 
 
235 aa  488  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0785  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  71.86 
 
 
231 aa  360  1e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000197487 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3722  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  60.43 
 
 
240 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3905  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  60 
 
 
240 aa  299  2e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3779  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  60 
 
 
240 aa  298  7e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0554  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  59.46 
 
 
235 aa  297  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.200527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0546  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  58.7 
 
 
240 aa  293  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3292  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  58.01 
 
 
240 aa  290  1e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3552  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  58.93 
 
 
233 aa  286  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3444  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  58.77 
 
 
240 aa  286  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0585  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  58.33 
 
 
240 aa  286  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0586  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  57.89 
 
 
240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0869814 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0587  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, putative  58.33 
 
 
240 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3322  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  58.15 
 
 
244 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.344899  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3215  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  55.84 
 
 
240 aa  277  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000443759  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3037  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  55.22 
 
 
240 aa  246  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.307286  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0915  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  43.83 
 
 
236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.119218  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.96 
 
 
241 aa  171  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.957647  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1781  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.77 
 
 
228 aa  160  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00547  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  38.03 
 
 
229 aa  151  8e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.606311  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1405  glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.08 
 
 
243 aa  122  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000995679  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1397  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.44 
 
 
227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2131  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  33.89 
 
 
238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2228  hypothetical protein  32.03 
 
 
239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2200  hypothetical protein  32.47 
 
 
239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3887  glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.65 
 
 
241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.477333  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1393  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.62 
 
 
242 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0258  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.6 
 
 
242 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5454  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  30.99 
 
 
241 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5070  glycerophosphodiester phosphodiesterase (glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)  30.08 
 
 
241 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.422276  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2333  glycerophosphodiester phosphodiesterase, cytosolic  30.71 
 
 
241 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000111179  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0424  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.81 
 
 
245 aa  106  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0420  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.39 
 
 
247 aa  106  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5466  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  29.66 
 
 
241 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5222  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  29.66 
 
 
241 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5622  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  29.66 
 
 
241 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04965  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.53 
 
 
225 aa  105  8e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5054  glycerophosphodiester phosphodiesterase (glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)  29.66 
 
 
241 aa  104  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5496  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  29.24 
 
 
241 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5167  glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.24 
 
 
241 aa  102  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2904  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.46 
 
 
258 aa  102  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000060141 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1189  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.21 
 
 
250 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249302  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5552  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  29.24 
 
 
241 aa  101  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5503  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  29.24 
 
 
241 aa  101  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1652  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.09 
 
 
247 aa  101  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300286  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3080  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.2 
 
 
250 aa  101  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.943179  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1160  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.49 
 
 
237 aa  101  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0069  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.54 
 
 
235 aa  99.8  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.571737  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3305  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.04 
 
 
247 aa  99.8  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.233023  normal  0.109896 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1999  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.07 
 
 
276 aa  99.4  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0957  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  30.49 
 
 
247 aa  99  6e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000853  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.78 
 
 
239 aa  97.8  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3412  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.57 
 
 
258 aa  97.1  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0262  glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.96 
 
 
224 aa  97.4  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.479263  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1096  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.36 
 
 
250 aa  96.3  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223987  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4762  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.47 
 
 
247 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.240118 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3727  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.9 
 
 
247 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1581  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.84 
 
 
236 aa  95.5  7e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.565806  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0266  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.47 
 
 
247 aa  95.1  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0662  glycerophosphodiester phosphodiesterase  27 
 
 
304 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0956645  normal  0.017312 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06395  lycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.35 
 
 
250 aa  94.7  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1117  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.21 
 
 
231 aa  94.4  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.14837  normal  0.407637 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03298  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.04 
 
 
247 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.96147  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03251  hypothetical protein  30.04 
 
 
247 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.957517  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15710  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25 
 
 
326 aa  94  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.813483  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0230  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.78 
 
 
276 aa  94  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0112  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.67 
 
 
260 aa  94.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0267  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.04 
 
 
247 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0866161  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06765  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.45 
 
 
236 aa  93.2  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0606  glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.3 
 
 
239 aa  93.2  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2092  glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.03 
 
 
250 aa  93.2  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.275875  normal  0.276307 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3875  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.04 
 
 
247 aa  92.8  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.32 
 
 
287 aa  92.8  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0579361  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2668  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.32 
 
 
287 aa  92.8  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.476095  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4010  glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.45 
 
 
242 aa  92.8  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2623  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.55 
 
 
293 aa  92.4  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2622  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.92 
 
 
291 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000747655 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2312  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  27.46 
 
 
244 aa  92  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1509  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.85 
 
 
242 aa  92  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0337  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.61 
 
 
245 aa  92  8e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0220885  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3646  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.61 
 
 
247 aa  91.7  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2655  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.49 
 
 
237 aa  91.3  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000224371  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2374  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.62 
 
 
268 aa  90.9  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00970599  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2446  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.92 
 
 
287 aa  91.3  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000022465  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0307  glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.2 
 
 
319 aa  91.3  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0868  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  24.91 
 
 
297 aa  91.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.672761  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3926  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.61 
 
 
247 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2689  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.2 
 
 
292 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.693483  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0608  glycerophosphodiester phosphodiesterase  26.5 
 
 
257 aa  90.1  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000146198 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2733  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.51 
 
 
287 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011648  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2415  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.97 
 
 
287 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.450596  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2051  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.61 
 
 
245 aa  89.4  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0606758  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0129  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.47 
 
 
249 aa  89.4  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0121  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.61 
 
 
249 aa  89  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2863  glycerophosphodiester phosphodiesterase  26.86 
 
 
242 aa  89  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1140  glycerophosphodiester phosphodiesterase  27.13 
 
 
273 aa  89  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00521525  normal  0.104008 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3924  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.9 
 
 
246 aa  88.6  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3744  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.9 
 
 
246 aa  88.6  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455371  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3755  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.9 
 
 
246 aa  88.6  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0547  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase GlpQ, putative  27 
 
 
349 aa  87.8  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>