91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4133 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4133  deoxyribonuclease I  100 
 
 		 251 aa  529  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0867821 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3971  deoxyribonuclease I  80.88 
 
 		 251 aa  410  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3223  deoxyribonuclease I  80.62 
 
 		 251 aa  392  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000396495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0842  deoxyribonuclease I  69.8 
 
 		 258 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000267909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3160  deoxyribonuclease I  68.57 
 
 		 259 aa  367  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000648022  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0810  deoxyribonuclease I  74.22 
 
 		 258 aa  364  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000171872  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3331  deoxyribonuclease I  69.26 
 
 		 257 aa  362  4e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000877394  normal  0.801712 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3525  deoxyribonuclease I  73.78 
 
 		 258 aa  362  4e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000100295  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0835  Deoxyribonuclease I  73.78 
 
 		 258 aa  361  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000225063  hitchhiker  0.0000104704 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3443  endonuclease I  68.85 
 
 		 257 aa  360  1e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000111641  hitchhiker  0.00909149 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0691  deoxyribonuclease I  68.44 
 
 		 257 aa  359  2e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000438774  normal  0.686603 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0833  endonuclease I  67.76 
 
 		 258 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0576  deoxyribonuclease I  63.68 
 
 		 242 aa  329  2e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000000105466  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0544  deoxyribonuclease I  65.8 
 
 		 254 aa  330  2e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135905  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2973  deoxyribonuclease I  64.78 
 
 		 269 aa  321  6e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.576725  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002464  endonuclease I precursor  62.67 
 
 		 231 aa  296  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03571  endonuclease I  65.57 
 
 		 231 aa  293  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0550  endonuclease I precursor  63.36 
 
 		 237 aa  292  4e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3349  deoxyribonuclease I  55.98 
 
 		 235 aa  278  6e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000315843  decreased coverage  0.00212113 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3087  endonuclease I  57.33 
 
 		 235 aa  277  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00686191  hitchhiker  0.0000298257 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4248  endonuclease I  57.33 
 
 		 235 aa  276  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.260828 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02775  DNA-specific endonuclease I  56.9 
 
 		 235 aa  275  7e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.153052  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02738  hypothetical protein  56.9 
 
 		 235 aa  275  7e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252778  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3288  endonuclease I  56.9 
 
 		 235 aa  275  7e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.961762  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3377  endonuclease I  56.9 
 
 		 235 aa  275  7e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3103  endonuclease I  56.9 
 
 		 235 aa  275  7e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3340  endonuclease I  60.19 
 
 		 235 aa  274  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00611255  normal  0.202483 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3332  endonuclease I  60.19 
 
 		 235 aa  274  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.387366 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3436  endonuclease I  60.19 
 
 		 235 aa  274  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00127424  hitchhiker  0.00168464 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0769  deoxyribonuclease I  56.47 
 
 		 235 aa  274  9e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000516595  unclonable  0.0000000197257 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3267  endonuclease I  60.19 
 
 		 235 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0010351  normal  0.0484419 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3256  endonuclease I  60.19 
 
 		 235 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000148246  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0750  Deoxyribonuclease I  56.47 
 
 		 235 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00967955  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0547  Deoxyribonuclease I  55.27 
 
 		 232 aa  271  6e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000480912  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3709  Deoxyribonuclease I  59.28 
 
 		 232 aa  268  5e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000796266  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3907  Deoxyribonuclease I  59.28 
 
 		 232 aa  268  7e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000139034  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0504  Deoxyribonuclease I  53.91 
 
 		 233 aa  266  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000136601  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0022  extracellular deoxyribonuclease  57.14 
 
 		 231 aa  266  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3345  endonuclease I  59.62 
 
 		 235 aa  263  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0841  deoxyribonuclease I  59.62 
 
 		 235 aa  263  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.0000000000239428  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0839  endonuclease I  59.62 
 
 		 235 aa  263  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4024  deoxyribonuclease I  53.98 
 
 		 231 aa  254  7e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000163525  decreased coverage  0.000370071 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1350  deoxyribonuclease I  50.44 
 
 		 232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02310  Deoxyribonuclease I  48.87 
 
 		 268 aa  232  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40130  deoxyribonuclease I  52.83 
 
 		 231 aa  230  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0550387  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1915  deoxyribonuclease I  50.88 
 
 		 229 aa  230  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.468697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28570  DNA-specific endonuclease I  49.56 
 
 		 237 aa  225  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000174219 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2493  DNA-specific endonuclease I  49.56 
 
 		 237 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3521  deoxyribonuclease I  50.92 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643247  normal  0.271071 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3242  deoxyribonuclease I  50 
 
 		 230 aa  221  6e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.187326  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2364  endonuclease I  50 
 
 		 233 aa  221  8e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170845  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2451  deoxyribonuclease I  50 
 
 		 230 aa  221  8e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2148  deoxyribonuclease I  50 
 
 		 233 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000104352  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4374  deoxyribonuclease I  51.22 
 
 		 288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000699204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0624  deoxyribonuclease I  50.97 
 
 		 241 aa  212  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00856225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2569  deoxyribonuclease I  47.32 
 
 		 321 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0107726  normal  0.160045 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2383  deoxyribonuclease I  47.32 
 
 		 321 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.178356  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3375  deoxyribonuclease I  47.32 
 
 		 321 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3757  deoxyribonuclease I  44.35 
 
 		 323 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.163237  normal  0.488138 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2065  deoxyribonuclease I  45.93 
 
 		 243 aa  202  4e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.014094  normal  0.0314213 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1309  deoxyribonuclease I  48.15 
 
 		 229 aa  191  7e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.122078  normal  0.128017 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2835  deoxyribonuclease I  47.69 
 
 		 229 aa  190  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667244 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0256  extracellular deoxyribonuclease  41.92 
 
 		 223 aa  161  1e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4577  deoxyribonuclease I  38.33 
 
 		 243 aa  158  8e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  3.5492500000000006e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0601  deoxyribonuclease I  38.71 
 
 		 250 aa  158  9e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4415  deoxyribonuclease I  37.92 
 
 		 243 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  8.69182e-28  decreased coverage  0.000909905 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4599  deoxyribonuclease I  37.92 
 
 		 243 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.26401e-21  normal  0.918023 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2580  deoxyribonuclease I  38.34 
 
 		 256 aa  152  4e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.316828 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1458  Deoxyribonuclease I  36.73 
 
 		 249 aa  139  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.118773  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5532  Endonuclease I  32.34 
 
 		 232 aa  92  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0708603 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2748  endonuclease I  35.82 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4761  Endonuclease I  33.06 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0283458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4067  endonuclease I  27.23 
 
 		 219 aa  62  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0378834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001088  endonuclease I  25.44 
 
 		 538 aa  56.6  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04827  ribonuclease  26.04 
 
 		 539 aa  54.3  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1948  endonuclease I  28.37 
 
 		 285 aa  53.1  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1505  Endonuclease I  32 
 
 		 311 aa  53.1  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  32.56 
 
 		 1310 aa  53.1  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  27.11 
 
 		 614 aa  50.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  29.41 
 
 		 617 aa  49.3  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2661  Endonuclease I  31.2 
 
 		 308 aa  48.5  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3049  endonuclease I  27.34 
 
 		 275 aa  47  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00672798  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  28.36 
 
 		 1346 aa  46.6  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1907  ribonuclease  27.34 
 
 		 275 aa  47  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3323  ribonuclease  27.34 
 
 		 275 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.934207  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3370  ribonuclease  27.34 
 
 		 275 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3124  ribonuclease  27.34 
 
 		 275 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0290634  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26920  endonuclease I  26.87 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1896  Endonuclease I  26.72 
 
 		 272 aa  43.1  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3289  endonuclease I  28.24 
 
 		 542 aa  43.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363328  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1033  endonuclease I  28.91 
 
 		 1503 aa  42.7  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.8795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>