103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4127 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4127  peptidase C39 bacteriocin processing  100 
 
 		 235 aa  477  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000936066 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2967  peptidase C39, bacteriocin processing  69.19 
 
 		 227 aa  315  3e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39250  putative double-glycine peptidase  55.45 
 
 		 226 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.050482  normal  0.369017 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2765  peptidase C39 bacteriocin processing  51.2 
 
 		 226 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2834  peptidase C39, bacteriocin processing  48.34 
 
 		 226 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2926  peptidase C39 bacteriocin processing  46.26 
 
 		 226 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2595  peptidase C39, bacteriocin processing  46.67 
 
 		 226 aa  202  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2855  hypothetical protein  47.39 
 
 		 226 aa  201  6e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2091  peptidase C39 bacteriocin processing  44.19 
 
 		 234 aa  194  7e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0732241 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0933  C39 family peptidase  40.1 
 
 		 236 aa  158  9e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212685  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1024  putative peptidase  38.46 
 
 		 237 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0531887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2446  peptidase C39 bacteriocin processing  46.45 
 
 		 235 aa  156  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2960  peptidase C39 bacteriocin processing  37.95 
 
 		 237 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0402092  normal  0.773236 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3435  peptidase C39 bacteriocin processing  42 
 
 		 238 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.254055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3089  peptidase C39 bacteriocin processing  42 
 
 		 238 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2584  peptidase C39, bacteriocin processing  39.44 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2316  peptidase C39, bacteriocin processing  42.77 
 
 		 223 aa  142  6e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.543976  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1155  peptidase C39, bacteriocin processing  40.99 
 
 		 203 aa  139  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0321  peptidase C39 bacteriocin processing  38.22 
 
 		 227 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.337286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0336  peptidase C39 bacteriocin processing  38.22 
 
 		 227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.752621 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2175  peptidase C39, bacteriocin processing  37.95 
 
 		 237 aa  138  7.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.811326  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5392  peptidase C39, bacteriocin processing  39.87 
 
 		 209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0260975  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5873  peptidase (C39-family, bacteriocin processing)  40.51 
 
 		 232 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3210  C39 family peptidase  36.9 
 
 		 231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1020  peptidase C39 bacteriocin processing  33.62 
 
 		 235 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0445  putative signal peptide protein  35.08 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.248925 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3462  peptidase C39, bacteriocin processing  42.14 
 
 		 261 aa  125  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0738  peptidase C39, bacteriocin processing  35.45 
 
 		 234 aa  120  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.772162  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1801  peptidase C39, bacteriocin processing  36.08 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41780  hypothetical protein  33.17 
 
 		 253 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2536  peptidase C39, bacteriocin processing  35.85 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.160882  hitchhiker  0.00642935 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3545  hypothetical protein  35.33 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2422  peptidase C39 bacteriocin processing  33.77 
 
 		 251 aa  97.8  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0785  peptidase C39 bacteriocin processing  40.34 
 
 		 427 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.031231 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03496  hypothetical protein  37.5 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3887  peptidase C39, bacteriocin processing  36.43 
 
 		 244 aa  89  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000193962  decreased coverage  0.00447347 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  30.6 
 
 		 1040 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  34.33 
 
 		 1018 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3038  peptidase C39 bacteriocin processing  27.74 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.227483  normal  0.191518 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0075  ABC transporter-like protein protein  30.22 
 
 		 722 aa  57.4  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  28.17 
 
 		 1018 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0558  ABC transporter related  25.7 
 
 		 725 aa  53.9  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0904  ABC transporter related  31.03 
 
 		 1717 aa  53.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.971104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1371  peptidase family protein  27.59 
 
 		 197 aa  53.5  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  29.55 
 
 		 743 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0055  peptidase family protein  27.32 
 
 		 198 aa  53.1  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  25.52 
 
 		 1018 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  29.03 
 
 		 721 aa  52  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  26.9 
 
 		 726 aa  52.4  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0068  peptidase family protein  26.76 
 
 		 199 aa  51.6  0.000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  25.7 
 
 		 1038 aa  51.6  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  28.12 
 
 		 1038 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2946  ABC transporter related  32.03 
 
 		 732 aa  50.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.912238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3807  ABC transporter related  29.01 
 
 		 726 aa  50.1  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  27.61 
 
 		 906 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  27.61 
 
 		 906 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1112  ABC transporter related  27.87 
 
 		 737 aa  49.3  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0625  bacteriocin-processing peptidase  29.46 
 
 		 736 aa  48.9  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275381  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  28.36 
 
 		 727 aa  48.9  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2167  ABC transporter related  28.66 
 
 		 696 aa  48.9  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0837291  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  29.6 
 
 		 721 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1129  ABC transporter, transmembrane region  31.39 
 
 		 748 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00231099  normal  0.125208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  27.13 
 
 		 1011 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1133  bacteriocin-processing peptidase  28.28 
 
 		 714 aa  47.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.156219  normal  0.573302 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  25.28 
 
 		 721 aa  46.6  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  26.87 
 
 		 908 aa  46.2  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2150  peptidase C39, bacteriocin processing  27.54 
 
 		 186 aa  46.6  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  normal  0.0669823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0622  bacteriocin-processing peptidase  26.88 
 
 		 722 aa  46.2  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44571  normal  0.575885 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0946  putative toxin transporter  28.93 
 
 		 719 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3741  ABC transporter related  25 
 
 		 720 aa  45.4  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0543649  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0112  ABC transporter related  32.23 
 
 		 727 aa  45.4  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0339  ABC transporter-like protein  27.13 
 
 		 695 aa  45.1  0.0009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  24.36 
 
 		 759 aa  45.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4795  ABC transporter related  24.8 
 
 		 741 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4874  ABC transporter related  31.72 
 
 		 714 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.850711  normal  0.288804 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  28.47 
 
 		 738 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0658  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  24.46 
 
 		 760 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357384  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03510  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  27.64 
 
 		 724 aa  44.3  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0592  ABC Transporter  26.4 
 
 		 656 aa  44.3  0.002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.187972  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.47 
 
 		 1019 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5329  ABC transporter related  31.75 
 
 		 735 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.580332 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  25.34 
 
 		 739 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2398  bacteriocin-processing peptidase  29.01 
 
 		 716 aa  43.5  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0391365  hitchhiker  0.0000309205 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1818  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.82 
 
 		 707 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.263264  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1734  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.82 
 
 		 707 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  25.37 
 
 		 908 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1000  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.82 
 
 		 707 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0293  peptidase  29.82 
 
 		 707 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1138  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.82 
 
 		 707 aa  42.7  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121272  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0274  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.82 
 
 		 707 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0259681  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1322  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.82 
 
 		 707 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0655788  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3040  ABC transporter related  27.1 
 
 		 734 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2230  hypothetical protein  25.79 
 
 		 715 aa  42.7  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1164  ABC transporter related  23.49 
 
 		 716 aa  42.7  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589518  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3454  ABC transporter related  29.57 
 
 		 706 aa  42.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  25.37 
 
 		 1013 aa  42.7  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4701  ABC transporter related protein  28.57 
 
 		 728 aa  42.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0115772  normal  0.281049 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6118  ABC transporter related  25.19 
 
 		 731 aa  42.4  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0558  colicin V secretion ABC transporter ATP-binding protein  27.56 
 
 		 707 aa  42.4  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0873  ATPase  27.78 
 
 		 724 aa  42.4  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.536702 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>