More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4103 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  100 
 
 
402 aa  828    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  53.33 
 
 
412 aa  409  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  49.24 
 
 
415 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  51.38 
 
 
406 aa  396  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  48.52 
 
 
408 aa  391  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  51.63 
 
 
406 aa  392  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  53.94 
 
 
405 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  52.62 
 
 
407 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  50.37 
 
 
405 aa  387  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  52.85 
 
 
406 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  50.99 
 
 
409 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  50.89 
 
 
409 aa  379  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  48.28 
 
 
410 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  49.01 
 
 
410 aa  374  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0049  OsmC family protein  50.63 
 
 
406 aa  366  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  51.36 
 
 
410 aa  366  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  45.97 
 
 
413 aa  363  3e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  51.62 
 
 
407 aa  362  8e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1840  hypothetical protein  50.87 
 
 
405 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.949047 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  49.75 
 
 
423 aa  354  1e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3394  hypothetical protein  63.31 
 
 
251 aa  330  2e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.689408  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  44.13 
 
 
397 aa  307  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6635  OsmC family protein  43.17 
 
 
411 aa  300  3e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  hitchhiker  0.00000360166 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0226  hypothetical protein  60.89 
 
 
257 aa  291  1e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0227  hypothetical protein  61.29 
 
 
257 aa  291  2e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6150  OsmC family protein  47.63 
 
 
408 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773624  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6443  OsmC family protein  47.63 
 
 
408 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0979  OsmC family protein  43.32 
 
 
418 aa  282  9e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0403  OsmC family protein  52.02 
 
 
259 aa  225  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3055  OsmC-like family protein  49.8 
 
 
255 aa  223  6e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  45.42 
 
 
258 aa  222  9e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1127  putative redox protein  43.78 
 
 
256 aa  217  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3247  putative redox protein  43.6 
 
 
250 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.184697  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1911  hydrolase of the alpha/beta superfamily protein  42.8 
 
 
259 aa  207  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0630248  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1200  putative redox protein  43.78 
 
 
256 aa  203  5e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020196 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2961  OsmC-like family protein  41.6 
 
 
250 aa  195  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  41.15 
 
 
256 aa  187  3e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  38.46 
 
 
259 aa  182  7e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1067  hypothetical protein  56.25 
 
 
145 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0889291  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4769  OsmC family protein  48.82 
 
 
153 aa  132  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00807264  hitchhiker  0.00049584 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2717  OsmC-like protein  43.31 
 
 
135 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712413 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4175  hypothetical protein  43.44 
 
 
135 aa  110  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48750  hypothetical protein  40.46 
 
 
135 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000274485 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  45.76 
 
 
132 aa  109  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  45.76 
 
 
132 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1440  OsmC family protein  40.62 
 
 
142 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1950  OsmC family protein  42.86 
 
 
132 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  42.37 
 
 
130 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  42.37 
 
 
130 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  42.37 
 
 
130 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3491  OsmC family protein  37.3 
 
 
131 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  41.53 
 
 
130 aa  99.8  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  41.53 
 
 
130 aa  99.4  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  41.53 
 
 
130 aa  99  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  41.53 
 
 
130 aa  99  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  41.67 
 
 
136 aa  97.8  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1856  OsmC family protein  39.34 
 
 
129 aa  97.1  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.610023  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0982  OsmC family protein  40.62 
 
 
127 aa  93.6  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  29.08 
 
 
259 aa  92  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  39.53 
 
 
127 aa  91.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1438  OsmC family protein  39.84 
 
 
137 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1082  OsmC-like family protein  37.68 
 
 
141 aa  86.7  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0521945  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0974  OsmC family protein  34.38 
 
 
128 aa  86.7  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.637714  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  29.58 
 
 
261 aa  85.1  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2658  OsmC family protein  40.6 
 
 
133 aa  83.2  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.498397 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  29.2 
 
 
237 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2142  OsmC family protein  40.48 
 
 
129 aa  80.5  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  33.33 
 
 
138 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0181271 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4937  OsmC family protein  36.67 
 
 
133 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.659641 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  29.63 
 
 
253 aa  75.9  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0929  putative hydrolase  29.67 
 
 
252 aa  76.3  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  36.36 
 
 
131 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0732  OsmC family protein  34.09 
 
 
137 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3616  osmotically inducible protein  35.29 
 
 
129 aa  75.5  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000818818  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2484  OsmC family protein  34.13 
 
 
133 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.092178 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2297  OsmC-like protein  37.82 
 
 
133 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.922047  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0376  hypothetical protein  33.85 
 
 
134 aa  72  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3689  OsmC family protein  34.45 
 
 
133 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.952273 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0232  OsmC family protein  34.62 
 
 
134 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5525  OsmC family protein  36.13 
 
 
133 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  31.78 
 
 
260 aa  72  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3725  OsmC family protein  34.45 
 
 
133 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.196532 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3799  OsmC family protein  34.45 
 
 
133 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.732158  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4564  OsmC-like protein  34.45 
 
 
133 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0251  OsmC family protein  33.08 
 
 
134 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.798103  normal  0.164531 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  35.66 
 
 
258 aa  68.6  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0518  OsmC-like protein superfamily protein  30.86 
 
 
153 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1595  OsmC family protein  32.81 
 
 
134 aa  67  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  37.4 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2193  OsmC family protein  33.63 
 
 
129 aa  66.2  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.208378  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3965  OsmC family protein  36.11 
 
 
132 aa  66.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2279  OsmC family protein  32.81 
 
 
155 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0377998  normal  0.182149 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2032  hypothetical protein  24.52 
 
 
294 aa  66.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287773  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1270  hypothetical protein  28.68 
 
 
144 aa  65.5  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00225413  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5556  OsmC-like protein  31.9 
 
 
130 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000078778  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2518  hypothetical protein  36.13 
 
 
133 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0608844  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0240  hypothetical protein  36.13 
 
 
133 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0949  hydrolase  36.13 
 
 
133 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1423  hypothetical protein  36.13 
 
 
133 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2657  putative hydrolase  36.13 
 
 
133 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>