86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4102 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4102  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  586  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.576037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1774  hypothetical protein  53.79 
 
 		 297 aa  290  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1446  hypothetical protein  46.67 
 
 		 314 aa  277  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1346  hypothetical protein  49.2 
 
 		 314 aa  261  8e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0781  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.74 
 
 		 295 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0646  hypothetical protein  47.22 
 
 		 288 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00955347  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4266  hypothetical protein  47.75 
 
 		 295 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3109  hypothetical protein  47.46 
 
 		 289 aa  240  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0895719 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1416  hypothetical protein  44.55 
 
 		 304 aa  240  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.239593 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2087  LysR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 283 aa  239  4e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  hitchhiker  0.0000000953173 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1068  hypothetical protein  43.93 
 
 		 311 aa  237  1e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2000  hypothetical protein  49.09 
 
 		 283 aa  237  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389336  decreased coverage  0.00000000377823 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1975  hypothetical protein  48.18 
 
 		 283 aa  236  4e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0979714  hitchhiker  0.00214562 
 
 
-
 
NC_003296  RS01739  hypothetical protein  46.67 
 
 		 303 aa  234  9e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2935  hypothetical protein  46.23 
 
 		 286 aa  225  8e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5364  hypothetical protein  46.55 
 
 		 285 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278081  normal  0.929346 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1656  hypothetical protein  44.56 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0479067  normal  0.122332 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4790  membrane protein  40.97 
 
 		 285 aa  206  5e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.278325  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0746  DMT family permease  43.6 
 
 		 297 aa  206  6e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1850  sensor protein GLPS  44.67 
 
 		 302 aa  205  9e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.829384 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3521  hypothetical protein  46.07 
 
 		 290 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.801415 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001148  permease  42.51 
 
 		 289 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270511  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3816  hypothetical protein  44.6 
 
 		 307 aa  199  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38950  hypothetical protein  48.24 
 
 		 287 aa  192  8e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06636  hypothetical protein  40.91 
 
 		 289 aa  190  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1891  hypothetical protein  40.07 
 
 		 300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2406  hypothetical protein  47.14 
 
 		 290 aa  188  9e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.268881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2254  hypothetical protein  46.07 
 
 		 290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.290541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1051  DMT superfamily efflux pump  41.46 
 
 		 254 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.226473  normal  0.464817 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2916  hypothetical protein  40.48 
 
 		 282 aa  181  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.264108  normal  0.862431 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3318  hypothetical protein  47.18 
 
 		 286 aa  175  7e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46360  hypothetical protein  46.44 
 
 		 285 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.206778  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0600  hypothetical protein  36.36 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.172684 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3356  hypothetical protein  38.52 
 
 		 287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1087  hypothetical protein  48.34 
 
 		 281 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.647653 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0856  hypothetical protein  39.34 
 
 		 288 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0559005  normal  0.228089 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1433  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.46 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6146  hypothetical protein  33.33 
 
 		 302 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1689  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.89 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112167  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02132  permease of the drug/metabolite transporter superfamily protein  38.54 
 
 		 194 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.259073  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6439  hypothetical protein  33.33 
 
 		 275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.719443 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1613  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.01 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.76207  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2262  hypothetical protein  39.41 
 
 		 319 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.099345  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.29 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0441  hypothetical protein  26.59 
 
 		 301 aa  55.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.64 
 
 		 314 aa  52  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4034  hypothetical protein  26.72 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4177  putative transporter  27.08 
 
 		 301 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4483  putative transporter  27.08 
 
 		 301 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03829  predicted permease  27.08 
 
 		 301 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03778  hypothetical protein  27.08 
 
 		 301 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4391  putative transporter  27.08 
 
 		 301 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.568191 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4072  hypothetical protein  27.08 
 
 		 301 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.08 
 
 		 301 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4430  putative transporter  27.08 
 
 		 304 aa  50.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  26.2 
 
 		 303 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0502  hypothetical protein  26.86 
 
 		 301 aa  50.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.643088  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  28.65 
 
 		 303 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5404  putative transporter  26.67 
 
 		 301 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.532448 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  24.56 
 
 		 293 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  24.67 
 
 		 293 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  24.67 
 
 		 292 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.21 
 
 		 293 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  23.77 
 
 		 343 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  23.25 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3820  hypothetical protein  24.7 
 
 		 308 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4527  hypothetical protein  26.72 
 
 		 308 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.4 
 
 		 296 aa  45.8  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  25.49 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  25.86 
 
 		 310 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.42 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0518  hypothetical protein  28.64 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  25.34 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1383  hypothetical protein  25.43 
 
 		 308 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22021  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  25.88 
 
 		 294 aa  44.3  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.4 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36480  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  24.12 
 
 		 316 aa  44.3  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171631  normal  0.909358 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1054  hypothetical protein  23.83 
 
 		 306 aa  43.9  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0972  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.36 
 
 		 306 aa  43.5  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.032769  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  26.7 
 
 		 307 aa  43.5  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1564  hypothetical protein  24.47 
 
 		 295 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3198  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.01 
 
 		 307 aa  43.1  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2820  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.47 
 
 		 295 aa  42.7  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1531  hypothetical protein  24.47 
 
 		 295 aa  42.7  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00178723  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3081  hypothetical protein  31.67 
 
 		 304 aa  42.7  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6431  hypothetical protein  27.67 
 
 		 315 aa  42.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.275967  normal  0.207657 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>