More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4086 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_4086  ABC transporter related  100 
 
 
279 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3736  ABC transporter-related protein  77.95 
 
 
311 aa  425  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.652525 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3382  ABC transporter related  73.44 
 
 
308 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1033  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  66.91 
 
 
285 aa  369  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1009  ABC transporter related  69.65 
 
 
297 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2963  ABC transporter related  67.04 
 
 
293 aa  365  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0997  ABC transporter related  69.65 
 
 
297 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0975  ABC transporter related  69.65 
 
 
297 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3280  ABC transporter related  68.48 
 
 
326 aa  363  1e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3366  ABC transporter related  69.26 
 
 
297 aa  363  2e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0874  ABC transporter related  68.5 
 
 
269 aa  362  3e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3182  ABC transporter related  68.48 
 
 
321 aa  361  6e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0840  ABC transporter related  68.48 
 
 
321 aa  361  7.0000000000000005e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0712  ABC transporter-related protein  67.91 
 
 
324 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1116  ABC transporter related  61.78 
 
 
307 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0760  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.39 
 
 
271 aa  306  3e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2164  ABC transporter related  47.47 
 
 
270 aa  258  1e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  49.6 
 
 
260 aa  257  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4566  ABC transporter related  49.2 
 
 
280 aa  255  4e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0867  ABC transporter related  44.27 
 
 
261 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1348  ABC transporter related  44.27 
 
 
261 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893482  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1330  ABC transporter related  43.75 
 
 
261 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4490  ABC transporter, ATPase subunit  43.92 
 
 
265 aa  245  6e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0876356  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26400  putative ATP-binding component of ABC transporter  49.2 
 
 
257 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.749781  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1413  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.31 
 
 
295 aa  236  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2035  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.92 
 
 
263 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3153  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  43.92 
 
 
263 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3192  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.92 
 
 
265 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1898  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  43.92 
 
 
265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303699  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0878  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  43.92 
 
 
265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.382345  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2712  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  43.92 
 
 
265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203934  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0593  ABC transporter-like  45.49 
 
 
262 aa  233  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835078  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2242  ABC transporter ATP-binding protein  48 
 
 
257 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  42.92 
 
 
264 aa  230  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2099  ABC transporter related  43.6 
 
 
261 aa  229  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4240  ABC transporter related  45.6 
 
 
285 aa  228  7e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1166  putative vitamin B12 transport ATP-binding protein BtuD  43.91 
 
 
276 aa  226  4e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.468222  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5561  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.41 
 
 
259 aa  225  6e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5100  ABC transporter related  43.6 
 
 
253 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130853  normal  0.02881 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5102  ABC transporter  42.02 
 
 
259 aa  223  4e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  41.34 
 
 
275 aa  222  7e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  43.64 
 
 
262 aa  221  9e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  40.93 
 
 
251 aa  219  3e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2731  ABC transporter related  47.11 
 
 
255 aa  219  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4828  ABC transporter related  43.43 
 
 
258 aa  217  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169592  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2273  ABC transporter related  44.22 
 
 
254 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788065  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2599  ABC transporter related  43.82 
 
 
254 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628612  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3914  ABC transporter related  45.98 
 
 
274 aa  215  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00146418  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0404  ABC transporter related  43.82 
 
 
283 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  40.56 
 
 
262 aa  212  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3884  ABC transporter related  41.13 
 
 
267 aa  211  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1289  hypothetical protein  40.48 
 
 
259 aa  211  1e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.128877 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3207  ABC transporter related  40 
 
 
253 aa  209  5e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.712241  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  43.64 
 
 
257 aa  208  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.04 
 
 
253 aa  206  2e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4222  ABC transporter related  42.17 
 
 
254 aa  206  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4783  ABC transporter related  43.72 
 
 
263 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0443  ABC transporter related  40.87 
 
 
257 aa  203  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.152213 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5388  ABC transporter related  41.6 
 
 
253 aa  198  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133322  normal  0.359169 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3775  ABC transporter related protein  41.49 
 
 
265 aa  193  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  37.05 
 
 
266 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  42.37 
 
 
384 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  42.19 
 
 
268 aa  193  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 
264 aa  192  5e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04360  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  38.98 
 
 
285 aa  192  7e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21290  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  39.41 
 
 
257 aa  191  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.91 
 
 
265 aa  190  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0560  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  43.03 
 
 
257 aa  189  5.999999999999999e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3914  ABC transporter related  40.76 
 
 
264 aa  188  8e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291945  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  37.35 
 
 
409 aa  188  8e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0602  ABC transporter-related protein  40.3 
 
 
418 aa  188  9e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.660447  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1141  ABC transporter related  40.16 
 
 
303 aa  187  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1178  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.14 
 
 
262 aa  187  2e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.240461  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1138  ABC transporter component  40.76 
 
 
266 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.92157  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  36.5 
 
 
490 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  35.94 
 
 
455 aa  186  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23980  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  38.49 
 
 
339 aa  186  4e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.862389 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3725  ABC transporter related protein  37.35 
 
 
249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2322  ABC transporter related protein  40.68 
 
 
261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  35.86 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1301  ABC transporter-related protein  38.96 
 
 
261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2584  ABC transporter related  38.71 
 
 
273 aa  182  5.0000000000000004e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1610  ABC transporter related protein  42.8 
 
 
315 aa  182  6e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0728276  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  39.82 
 
 
266 aa  181  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  40.83 
 
 
268 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3258  iron ABC transporter, ATP-binding protein  39.57 
 
 
263 aa  178  8e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.047532  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  35 
 
 
424 aa  178  9e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  36.8 
 
 
264 aa  177  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  38 
 
 
269 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3096  ABC transporter  40.91 
 
 
263 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5816  ABC transporter related  35.8 
 
 
259 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0864104 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  40.41 
 
 
268 aa  176  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  36.9 
 
 
269 aa  176  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1212  ABC transporter related  40.33 
 
 
253 aa  176  4e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2982  ABC transporter related  36.4 
 
 
254 aa  175  7e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200508  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1653  ABC transporter related protein  43.42 
 
 
254 aa  175  9e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3451  ABC transporter related protein  37.85 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0148611  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0163  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  37.25 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00149  hypothetical protein  37.85 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00123723  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0161  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  37.85 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>