More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4050 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4050  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 122 aa  251  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3872  transcriptional regulator, MerR family protein  68.64 
 
 		 118 aa  170  5e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0088  MerR family transcriptional regulator  59.29 
 
 		 118 aa  140  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4267  MerR family transcriptional regulator  58.41 
 
 		 118 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0082  MerR family transcriptional regulator  59.29 
 
 		 118 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0085  transcriptional regulator, MerR family  59.29 
 
 		 118 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0088  MerR family transcriptional regulator  57.52 
 
 		 118 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0082  MerR family transcriptional regulator  58.41 
 
 		 118 aa  136  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4935  MerR family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 139 aa  128  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327998  normal  0.0174485 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3138  MerR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 117 aa  124  5e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.267666  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1754  MerR family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 153 aa  121  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.164418 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1782  MerR family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 153 aa  121  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7602  putative transcriptional regulator, MerR family  47.32 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.621201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0943  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 138 aa  114  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2220  MerR family transcriptional regulator  49.51 
 
 		 164 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02350  transcriptional regulator, MerR family  45.69 
 
 		 156 aa  114  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0160379  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2208  MerR family transcriptional regulator  49.51 
 
 		 190 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194329  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1864  MerR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 198 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1374  MerR family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 164 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2386  MerR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 255 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0033  MerR family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 164 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.154988  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2258  MerR family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 164 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.214399  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5145  MerR family transcriptional regulator  46.02 
 
 		 153 aa  111  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130507  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1569  MerR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.418349 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1816  transcriptional regulator, MerR family  43.59 
 
 		 164 aa  111  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6235  MerR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 153 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204034  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1868  MerR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 153 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.158881  hitchhiker  0.000791021 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1844  MerR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 153 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.051898  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1429  MerR family transcriptional regulator  48.04 
 
 		 153 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271555  decreased coverage  0.000928648 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2371  MerR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 168 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00484931  normal  0.175809 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2084  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 191 aa  102  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2189  MerR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 130 aa  103  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2478  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.263723 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  41.88 
 
 		 449 aa  99.4  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1484  MerR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 170 aa  93.6  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0528  transcriptional regulator, MerR family  44.66 
 
 		 143 aa  93.6  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.878422 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6425  transcriptional regulator, MerR family  38.94 
 
 		 131 aa  93.6  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3338  transcriptional regulator, MerR family  40.54 
 
 		 124 aa  92.4  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.770495  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2652  transcriptional regulator, MerR family  40.87 
 
 		 123 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3285  transcriptional regulator, MerR family  41.96 
 
 		 128 aa  91.7  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200558  normal  0.212235 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3322  regulatory protein, MerR  43.93 
 
 		 122 aa  90.5  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0636  transcriptional regulator, MerR family  39.29 
 
 		 160 aa  89  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1516  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 201 aa  89  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.699928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0836  MerR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 155 aa  89.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3555  MerR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0311437  normal  0.0197262 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0435  putative transcriptional regulator, MerR family  41.03 
 
 		 165 aa  88.2  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.517587  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1332  transcriptional regulator, MerR family  37.17 
 
 		 128 aa  88.6  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0224558 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23510  predicted transcriptional regulator  36.61 
 
 		 138 aa  87  7e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.719058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0088  aldo/keto reductase  43.27 
 
 		 491 aa  87  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7947  putative transcriptional regulator, MerR family  36.52 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3507  transcriptional regulator, MerR family  39.13 
 
 		 158 aa  83.6  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.278393 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0440  transcriptional regulator, MerR family  38.39 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.394631  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2558  transcriptional regulator, MerR family  35.4 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.327244 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2312  putative transcriptional regulator, MerR family  38.79 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0487  transcriptional regulator, MerR family  40.95 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.452136  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2240  transcriptional regulator  42.45 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5353  transcriptional regulator, MerR family  42.16 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.657769  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001375  putative transcriptional regulator MerR family protein  66.67 
 
 		 61 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108021  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3223  transcriptional regulator, MerR family  41.59 
 
 		 134 aa  80.9  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0351444  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4023  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1799  transcriptional regulator, MerR family  41.51 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.21338  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1547  MerR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 143 aa  80.1  0.000000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0148728  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0738  MerR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0876776  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1319  transcriptional regulator, MerR family  38.94 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.026746 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4449  mercuric resistance operon regulatory protein  41.51 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00937003  normal  0.868186 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1384  regulatory protein, MerR  35.34 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04780  transcriptional regulator, MerR family  35.78 
 
 		 118 aa  76.6  0.00000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000795596  normal  0.576293 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0886  mercuric resistance operon regulatory protein  41.51 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.374839  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0743  MerR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0923  MerR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190958  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18180  predicted transcriptional regulator  39.53 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.575083  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1435  transcriptional regulator, MerR family  35.34 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0777608  normal  0.768186 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1187  transcriptional regulator, MerR family  32.14 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.796306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2649  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2620  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2664  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.674524 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1968  transcriptional regulator, MerR family  34.58 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.631262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0626  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0427  MerR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0450  transcriptional regulator, MerR family  35.34 
 
 		 116 aa  70.9  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.58699  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4563  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1570  transcriptional regulator  34.58 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0438  transcriptional regulator, MerR family  39.66 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3633  transcriptional regulator, MerR family  30.17 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2198  MerR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  36.7 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4570  regulatory protein MerR  35.71 
 
 		 149 aa  67  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.922627  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2868  MerR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 129 aa  67  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000311414  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  35.45 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0079  transcriptional regulator  37.76 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3639  putative transcriptional regulator, MerR family  29.31 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4827  MerR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2770  regulatory protein MerR  29.91 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2511  MerR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.22268  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1810  transcriptional regulator, MerR family  28.57 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.145688  normal  0.140149 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4523  MerR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1560  transcriptional regulator, MerR family  31.3 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000421328  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2270  regulatory protein MerR  28.93 
 
 		 138 aa  60.1  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2231  MerR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 138 aa  60.1  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3563  transcriptional regulator, MerR family  30.84 
 
 		 126 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>