More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4030 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 732 aa  1485    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  37.87 
 
 		 767 aa  443  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  36.23 
 
 		 695 aa  388  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  34.96 
 
 		 713 aa  348  1e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4145  TonB-dependent receptor  33.71 
 
 		 737 aa  346  1e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072691  normal  0.786094 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  33.48 
 
 		 702 aa  342  1e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  35.1 
 
 		 700 aa  337  5e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  34.13 
 
 		 703 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0178  TonB-dependent receptor  30.73 
 
 		 841 aa  315  1.9999999999999998e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 733 aa  298  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3466  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 718 aa  295  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1066  TonB-dependent receptor  30.32 
 
 		 844 aa  280  6e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308413  normal  0.134897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4085  TonB-dependent receptor  30.49 
 
 		 685 aa  267  5e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.141893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2033  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 818 aa  264  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.795127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 		 713 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  29.58 
 
 		 715 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 729 aa  234  6e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 764 aa  229  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 762 aa  219  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 783 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 695 aa  201  3e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 720 aa  201  6e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 720 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 704 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 732 aa  194  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 851 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 730 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 853 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 758 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2605  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.56 
 
 		 685 aa  183  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  26.28 
 
 		 759 aa  183  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 798 aa  180  8e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 731 aa  179  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 790 aa  177  9e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 758 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 747 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 751 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0037  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 757 aa  174  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22969  hitchhiker  0.0000467623 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 794 aa  172  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 771 aa  172  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0667  putative TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 793 aa  172  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1828  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 712 aa  171  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000226653  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 737 aa  171  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 723 aa  171  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 726 aa  171  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  25.68 
 
 		 755 aa  171  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 780 aa  171  6e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 763 aa  170  7e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 792 aa  170  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 761 aa  170  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 774 aa  170  9e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 741 aa  169  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 743 aa  169  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1735  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 713 aa  169  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00374581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 724 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 790 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 774 aa  168  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2500  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 757 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0249349  hitchhiker  0.00279942 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0414  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 783 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 783 aa  166  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 		 730 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 743 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55050  TonB-dependent receptor  23.45 
 
 		 684 aa  165  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.04288e-20 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2380  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 748 aa  165  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.357323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 690 aa  164  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 766 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 808 aa  164  6e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 765 aa  164  7e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2440  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 688 aa  164  7e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0489256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 731 aa  163  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 775 aa  163  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 797 aa  162  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 743 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 710 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  23.99 
 
 		 729 aa  161  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 797 aa  162  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 777 aa  161  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 788 aa  161  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 761 aa  161  4e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0190  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 710 aa  161  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 761 aa  160  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1977  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 769 aa  159  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 734 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 778 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 764 aa  158  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 755 aa  158  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 690 aa  157  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 780 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1862  TonB-dependent receptor plug  27.02 
 
 		 799 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 783 aa  157  8e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2752  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 736 aa  157  9e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000933457  normal  0.355865 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1451  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 730 aa  156  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.322984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 784 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 		 784 aa  156  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  24.51 
 
 		 751 aa  155  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  23.39 
 
 		 687 aa  155  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 759 aa  155  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2764  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 776 aa  155  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.700663 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1059  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 777 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000502668  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 734 aa  154  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>