More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4009 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4009  transport system permease protein  100 
 
 		 338 aa  659    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3332  transport system permease protein  81.95 
 
 		 338 aa  511  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3674  hemin ABC transporter, permease protein  73.37 
 
 		 338 aa  449  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1016  transport system permease protein  74.11 
 
 		 338 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0947  transport system permease protein  73.81 
 
 		 338 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0785  transport system permease protein  72.89 
 
 		 340 aa  450  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3343  transport system permease protein  73.81 
 
 		 338 aa  447  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0961  transport system permease protein  73.8 
 
 		 343 aa  449  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1049  transport system permease protein  74.4 
 
 		 338 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.542405 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3240  transport system permease protein  73.08 
 
 		 338 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  56.31 
 
 		 343 aa  338  9.999999999999999e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001351  hemin ABC transporter permease protein  54.46 
 
 		 345 aa  333  2e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000656529  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05240  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  55.08 
 
 		 345 aa  328  6e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1755  heme transporter protein HuvC, transmembrane permease component  52.4 
 
 		 345 aa  299  5e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00487431  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  47.88 
 
 		 370 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  47.35 
 
 		 371 aa  275  8e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  52.23 
 
 		 358 aa  266  5e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  46.58 
 
 		 356 aa  261  1e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  48.62 
 
 		 366 aa  261  2e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  48.08 
 
 		 354 aa  260  3e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  45.88 
 
 		 354 aa  255  6e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  44.54 
 
 		 368 aa  253  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0167  transport system permease protein  47.44 
 
 		 361 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3020  transport system permease protein  48.04 
 
 		 370 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277606  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2167  transport system permease protein  55.12 
 
 		 341 aa  252  8.000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0116294  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0179  transport system permease protein  44.44 
 
 		 326 aa  251  1e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4799  transport system permease protein  48.36 
 
 		 345 aa  248  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000697014  hitchhiker  0.00165127 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  45.69 
 
 		 367 aa  245  8e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0746  transport system permease protein  48.45 
 
 		 345 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0337726  hitchhiker  0.0000000000140721 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0852  transport system permease protein  48.09 
 
 		 337 aa  242  5e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.822863  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1392  transport system permease protein  50.18 
 
 		 340 aa  241  9e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  48.57 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  48.57 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1443  transport system permease protein  52.36 
 
 		 365 aa  241  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0618013  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  48.57 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  43.35 
 
 		 347 aa  240  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2735  ABC transporter membrane spanning protein (hemin)  44.38 
 
 		 361 aa  238  8e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1968  transport system permease protein  46.18 
 
 		 365 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2441  transport system permease protein  53.74 
 
 		 342 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00106696  normal  0.535476 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4204  transport system permease protein  48.15 
 
 		 358 aa  233  3e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.570844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0994  transport system permease protein  54.01 
 
 		 346 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00447104  hitchhiker  0.000000000000206732 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2166  transport system permease protein  46.98 
 
 		 334 aa  230  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.514643  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2323  ABC-type Fe3+-siderophore transport system permease component  46.82 
 
 		 365 aa  229  6e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0471491  normal  0.889453 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  38.92 
 
 		 330 aa  228  9e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  43.88 
 
 		 355 aa  228  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0572  hemin transport system permease protein hmuU  44.51 
 
 		 360 aa  227  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0899796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  45.45 
 
 		 452 aa  228  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1489  transport system permease protein  41.82 
 
 		 373 aa  227  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  45.04 
 
 		 330 aa  226  3e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2874  transport system permease protein  44.34 
 
 		 360 aa  226  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4686  transport system permease protein  51.9 
 
 		 345 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165164  hitchhiker  0.0000000000187173 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1606  transport system permease protein  43.09 
 
 		 368 aa  226  6e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000330558 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4552  transport system permease protein  51.9 
 
 		 345 aa  225  7e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00635879  hitchhiker  0.000000015041 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09840  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  44.55 
 
 		 390 aa  225  8e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.125008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  38.62 
 
 		 330 aa  224  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  40.35 
 
 		 337 aa  223  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1932  transport system permease protein  45.45 
 
 		 356 aa  223  4e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4688  transport system permease protein  51.9 
 
 		 345 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235815 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  44.29 
 
 		 330 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5428  transport system permease protein  48.84 
 
 		 362 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5434  transport system permease protein  48.84 
 
 		 362 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.197656  normal  0.796306 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2135  transport system permease protein  42.86 
 
 		 357 aa  220  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370402  normal  0.644336 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7223  transport system permease protein  42.26 
 
 		 351 aa  220  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  39.59 
 
 		 367 aa  219  5e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1290  hypothetical protein  39.51 
 
 		 350 aa  219  6e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.385136 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  44.29 
 
 		 318 aa  219  6e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  36.78 
 
 		 336 aa  218  7.999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  34.49 
 
 		 350 aa  218  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4589  transport system permease protein  52.4 
 
 		 350 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0426385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0181  transport system permease protein  43.48 
 
 		 351 aa  218  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.816049  normal  0.0731846 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62290  putative permease of ABC transporter  50.78 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00186765  normal  0.421287 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5423  ABC transporter permease  51.34 
 
 		 345 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139342  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2349  transport system permease protein  46.79 
 
 		 361 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.055128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5377  hemin ABC-transport system permease  45.54 
 
 		 333 aa  216  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0079296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0344  transport system permease protein  49.49 
 
 		 362 aa  216  5e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2763  transport system permease protein  46.83 
 
 		 334 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.902305  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0372  transport system permease protein  47.18 
 
 		 429 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1829  hemin ABC transporter, permease protein  45.87 
 
 		 373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.273852  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0436  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  45.87 
 
 		 373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1119  hemin ABC transporter, permease protein  45.87 
 
 		 373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.141906  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0343  hemin ABC transporter, permease protein  45.87 
 
 		 373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0828  hemin ABC transporter, permease protein  45.87 
 
 		 373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.295306  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3606  transport system permease protein  45.25 
 
 		 367 aa  213  2.9999999999999995e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.438147  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1777  hemin ABC transporter, permease protein  45.87 
 
 		 409 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01537  ABC-type hemin transport system, pemease component  44.68 
 
 		 378 aa  211  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4835  transport system permease protein  48.5 
 
 		 361 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  36.31 
 
 		 356 aa  210  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  45.33 
 
 		 383 aa  210  3e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  39.33 
 
 		 346 aa  210  3e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1761  hemin transport system permease protein HmuU  37.54 
 
 		 326 aa  210  3e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2461  transport system permease protein  45.77 
 
 		 334 aa  209  7e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3342  iron(III) dicitrate transport system permease protein FecD  43.73 
 
 		 345 aa  209  7e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  36.67 
 
 		 336 aa  207  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4193  transport system permease protein  44.75 
 
 		 362 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0724971  normal  0.229753 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1211  transport system permease protein  46.98 
 
 		 329 aa  207  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  44.72 
 
 		 315 aa  206  6e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2410  transport system permease protein  49.04 
 
 		 360 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.442744  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2093  hemin ABC transporter, permease protein  43.99 
 
 		 338 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  37.75 
 
 		 359 aa  204  2e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  38.46 
 
 		 344 aa  203  4e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>