131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3974 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_3974  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  207  5e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3679  hypothetical protein  90.2 
 
 
102 aa  187  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3068  hypothetical protein  87.25 
 
 
102 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000570749  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3308  hypothetical protein  87.25 
 
 
106 aa  180  6e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274755  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3215  hypothetical protein  75 
 
 
100 aa  153  6e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0041435  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2725  hypothetical protein  74.51 
 
 
102 aa  152  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3505  cell division protein ZapA  74 
 
 
100 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000440374  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3623  protein of unknown function DUF710  73 
 
 
100 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36377  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3335  cell division protein ZapA  74 
 
 
100 aa  149  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0618  cell division protein ZapA  74 
 
 
100 aa  149  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000185465  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0613  hypothetical protein  73 
 
 
100 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.02493  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3681  hypothetical protein  73 
 
 
100 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3805  hypothetical protein  73 
 
 
100 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00222638  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0775  hypothetical protein  73 
 
 
100 aa  148  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0829  hypothetical protein  70.59 
 
 
102 aa  149  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3155  hypothetical protein  71.43 
 
 
99 aa  144  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02742  cytokinetic ring-localizing protein  41.67 
 
 
109 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000149347  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0782  protein of unknown function DUF710  41.67 
 
 
109 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  5.86222e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4203  Z-ring-associated protein  41.67 
 
 
109 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000359174  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02705  hypothetical protein  41.67 
 
 
109 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000185889  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3069  Z-ring-associated protein  41.67 
 
 
109 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.6674200000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3238  Z-ring-associated protein  41.67 
 
 
109 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000274743  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0799  Z-ring-associated protein  41.67 
 
 
109 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000567069  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3044  Z-ring-associated protein  41.67 
 
 
109 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000044208  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3331  Z-ring-associated protein  41.67 
 
 
109 aa  85.5  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000646117  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3219  Z-ring-associated protein  40.62 
 
 
109 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000367602  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3293  Z-ring-associated protein  40.62 
 
 
109 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000277153  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3296  Z-ring-associated protein  40.62 
 
 
109 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0000920152  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0446  Z-ring-associated protein  39.58 
 
 
109 aa  83.2  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00725856  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3473  Z-ring-associated protein  39.58 
 
 
109 aa  83.2  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3329  Z-ring-associated protein  39.58 
 
 
109 aa  82.8  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000688409  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3592  Z-ring-associated protein  39.58 
 
 
109 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.33654  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0543  Z-ring-associated protein  39.58 
 
 
109 aa  82.8  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0858  Z-ring-associated protein  38.24 
 
 
109 aa  81.6  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  2.48615e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3825  Z-ring-associated protein  38.24 
 
 
109 aa  81.6  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000023514  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0861  Z-ring-associated protein  38.24 
 
 
109 aa  81.6  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000455122  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3921  Z-ring-associated protein  39.58 
 
 
109 aa  80.5  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000155243  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0684  cell division protein ZapA  36.08 
 
 
99 aa  69.3  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000000536576  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0022  cell division protein ZapA  40.59 
 
 
105 aa  68.6  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2054  hypothetical protein  38.3 
 
 
102 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911462  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0604  hypothetical protein  31.4 
 
 
99 aa  65.5  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2540  putative cell division protein ZapA  34.04 
 
 
113 aa  65.1  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2038  hypothetical protein  35.96 
 
 
107 aa  63.5  0.0000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.251237  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0127  hypothetical protein  35.96 
 
 
107 aa  63.5  0.0000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106139  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1268  hypothetical protein  41.49 
 
 
102 aa  63.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2576  hypothetical protein  35.11 
 
 
103 aa  62.8  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.105055  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002482  Z-ring-associated protein ZapA  32.98 
 
 
102 aa  58.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000122961  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1130  hypothetical protein  32.65 
 
 
99 aa  58.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03552  hypothetical protein  34.04 
 
 
102 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3506  protein of unknown function DUF710  35.11 
 
 
100 aa  58.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47360  hypothetical protein  36.23 
 
 
104 aa  58.2  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2539  cell division protein ZapA  38.57 
 
 
94 aa  56.6  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0439557 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2723  cell division protein ZapA  34.44 
 
 
100 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1185  hypothetical protein  32.63 
 
 
104 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147089  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2329  hypothetical protein  32.63 
 
 
104 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0493535  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2957  hypothetical protein  32.63 
 
 
104 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1026  hypothetical protein  32.63 
 
 
104 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00507925  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1033  hypothetical protein  32.63 
 
 
104 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.244457  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1641  hypothetical protein  32.63 
 
 
104 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.641819  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5202  hypothetical protein  32.88 
 
 
106 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5110  hypothetical protein  32.88 
 
 
106 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.30685  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5263  hypothetical protein  32.88 
 
 
106 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5028  hypothetical protein  32.88 
 
 
106 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.767641  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0832  hypothetical protein  31.58 
 
 
104 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1017  protein of unknown function DUF710  31.65 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4310  hypothetical protein  34.29 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.850592 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2768  protein of unknown function DUF710  28.09 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0837  hypothetical protein  30.53 
 
 
104 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.464752  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1825  protein of unknown function DUF710  29.35 
 
 
100 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12217  hitchhiker  0.000000212758 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4464  hypothetical protein  36.36 
 
 
136 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0124  cell division protein ZapA  32.98 
 
 
106 aa  51.6  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.946997  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2215  hypothetical protein  34.78 
 
 
104 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.60775  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0089  hypothetical protein  31.46 
 
 
104 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1010  protein of unknown function DUF710  35 
 
 
114 aa  51.2  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1094  cell division protein ZapA  35 
 
 
114 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3470  hypothetical protein  31.88 
 
 
146 aa  51.2  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0249302  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0077  hypothetical protein  31.46 
 
 
104 aa  50.8  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0322  cell division protein ZapA  31.51 
 
 
101 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222691  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3516  cell division protein ZapA  34.29 
 
 
97 aa  50.4  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000386953  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0897  protein of unknown function DUF710  34.85 
 
 
101 aa  50.4  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1182  hypothetical protein  28.17 
 
 
96 aa  50.4  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2311  cell division protein ZapA  32.26 
 
 
108 aa  50.4  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0993  protein of unknown function DUF710  34.78 
 
 
104 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649993  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3505  cell division protein ZapA  34.78 
 
 
104 aa  50.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214372  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3434  hypothetical protein  32.1 
 
 
98 aa  50.1  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6921  cell division protein ZapA  35.21 
 
 
127 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2669  protein of unknown function DUF710  35.21 
 
 
105 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104034  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2788  hypothetical protein  30.65 
 
 
133 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.899312  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2772  hypothetical protein  35 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4027  cell division protein ZapA  34.43 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2211  protein of unknown function DUF710  33.8 
 
 
105 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.784079 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5437  cell division protein ZapA  30 
 
 
105 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0561705 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5788  hypothetical protein  33.33 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1846  hypothetical protein  33.33 
 
 
104 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2506  hypothetical protein  33.33 
 
 
104 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317879  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2457  hypothetical protein  33.33 
 
 
104 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.651634  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2462  hypothetical protein  33.33 
 
 
104 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252992  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2374  hypothetical protein  33.33 
 
 
104 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1535  cell division protein ZapA  30.16 
 
 
147 aa  47  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17697  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0626  hypothetical protein  25.26 
 
 
104 aa  47  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.517512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>