38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3852 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3852  hypothetical protein  100 
 
 		 457 aa  943    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0082  hypothetical protein  35.79 
 
 		 504 aa  243  5e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1193  hypothetical protein  31.54 
 
 		 457 aa  217  4e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.01113  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0179  conserved hypothetical lipoprotein  26.98 
 
 		 448 aa  169  7e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0124  putative lipoprotein  30.02 
 
 		 453 aa  155  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0084  putative lipoprotein  29.27 
 
 		 453 aa  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2794  sporulation domain-containing protein  28.29 
 
 		 671 aa  135  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5472  hypothetical protein  23.41 
 
 		 464 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825955 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0598  putative lipoprotein  24.93 
 
 		 483 aa  83.6  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3949  TPR repeat-containing protein  25.05 
 
 		 487 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000698733  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2066  hypothetical protein  25.23 
 
 		 407 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1811  hypothetical protein  25.53 
 
 		 407 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2516  hypothetical protein  25.16 
 
 		 509 aa  79.7  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.219773 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1890  hypothetical protein  25.06 
 
 		 407 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2263  hypothetical protein  22.4 
 
 		 435 aa  71.6  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.156064  normal  0.937024 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5471  hypothetical protein  22.95 
 
 		 457 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0735646 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3402  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.02 
 
 		 467 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0332171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0885  TPR repeat-containing protein  22.76 
 
 		 467 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000189506  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3600  TPR repeat-containing protein  22.76 
 
 		 467 aa  64.7  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000996774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3477  TPR repeat-containing protein  23.22 
 
 		 467 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0100527  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0899  TPR repeat-containing protein  24.04 
 
 		 466 aa  63.9  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3038  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 		 466 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000055247  normal  0.645895 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0936  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 		 466 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000092283  normal  0.106042 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0825  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 455 aa  61.6  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.692927  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1486  hypothetical protein  20.81 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00338852  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01520  hypothetical protein  24.07 
 
 		 468 aa  61.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1061  TPR domain-containing protein  23.28 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0915  TPR repeat-containing protein  23.72 
 
 		 455 aa  60.1  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0669152  normal  0.0164618 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3014  TPR repeat-containing protein  23.42 
 
 		 467 aa  59.3  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00235052  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0638  TPR domain-containing protein  21.41 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.044891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3242  TPR repeat-containing protein  23.56 
 
 		 456 aa  58.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0125577  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0837  TPR repeat-containing protein  21.82 
 
 		 469 aa  58.2  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.150077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0965  TPR repeat-containing protein  22.87 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00115055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2913  tetratricopeptide TPR_2  24.21 
 
 		 453 aa  56.2  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000006025  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1905  hypothetical protein  26.11 
 
 		 452 aa  56.2  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004002  putative lipoprotein  22.83 
 
 		 465 aa  54.7  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2334  hypothetical protein  19.23 
 
 		 461 aa  53.5  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000000614425  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1296  putative lipoprotein  20.81 
 
 		 465 aa  53.1  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>