12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3849 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3849  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  754    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0636697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0086  periplasmic protein  25.42 
 
 		 435 aa  90.9  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1523  hypothetical protein  22.73 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0128  hypothetical protein  24.79 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0088  hypothetical protein  25.36 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.259915  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2790  periplasmic protein  25.13 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0182  hypothetical protein  24.78 
 
 		 385 aa  63.2  0.000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5699  hypothetical protein  23.92 
 
 		 447 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.674769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0418  hypothetical protein  27.55 
 
 		 551 aa  58.5  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051405 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1237  hypothetical protein  26.67 
 
 		 484 aa  57.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.78414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0097  putative periplasmic protein  34.67 
 
 		 311 aa  53.5  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0797  hypothetical protein  37.68 
 
 		 131 aa  46.6  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.000503074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>