82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3848 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3848  OsmC family protein  100 
 
 		 181 aa  371  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.323457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07015  hypothetical protein  85.96 
 
 		 181 aa  318  3e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5957  OsmC family protein  29.89 
 
 		 190 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5247  OsmC family protein  29.44 
 
 		 187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  34.27 
 
 		 182 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  34.27 
 
 		 182 aa  111  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  33.91 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  31.61 
 
 		 189 aa  104  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4264  hypothetical protein  29.89 
 
 		 184 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  29.89 
 
 		 202 aa  98.6  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  30.77 
 
 		 189 aa  99  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4895  OsmC-like protein  27.75 
 
 		 184 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3268  OsmC family protein  27.75 
 
 		 184 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4432  OsmC family protein  28.32 
 
 		 184 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3421  OsmC family protein  28.32 
 
 		 184 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  31.25 
 
 		 193 aa  95.9  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6912  OsmC family protein  27.75 
 
 		 184 aa  95.5  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1978  OsmC family protein  28.32 
 
 		 186 aa  94  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2254  OsmC-like protein  31.25 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4241  OsmC family protein  27.68 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6241  OsmC family protein  27.72 
 
 		 182 aa  81.3  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6854  OsmC family protein  26.59 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  29.05 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1026  OsmC family protein  24.86 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4791  OsmC family protein  28.18 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  25.79 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0586  OsmC family protein  24.14 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal  0.0133234 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2212  OsmC family protein  32.23 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  29.51 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0969  OsmC family protein  30.89 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.298439 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1865  OsmC family protein  26.01 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0039  OsmC-like protein  30.61 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2100  OsmC family protein  32.14 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3793  OsmC family protein  33.62 
 
 		 185 aa  64.3  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.242728 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0304  hypothetical protein  30.51 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  32.43 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3485  OsmC family protein  35.29 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2836  OsmC family protein  29.2 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  33.72 
 
 		 176 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  29.51 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2175  OsmC-like protein  27.54 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.416909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3867  OsmC family protein  31.03 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0319528 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0623  hypothetical protein  26.61 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0005983  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  23.08 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2612  OsmC family protein  30.48 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1148  OsmC family protein  32.65 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2892  OsmC family protein  34.02 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.851644  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7644  hypothetical protein  34.02 
 
 		 170 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.601343  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0693  OsmC-like protein  32.22 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2189  OsmC family protein  31.63 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0335227  normal  0.683604 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4851  OsmC-like protein  26.96 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0377  OsmC family protein  28.97 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5418  hypothetical protein  30.77 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  26.67 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1310  OsmC family protein  26.09 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0225  OsmC-like protein  32.63 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.439807  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  27.56 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0031  OsmC-like protein  32.99 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  24.79 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2206  OsmC family protein  32.22 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.742376 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  25.38 
 
 		 171 aa  53.9  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0407  OsmC family protein  28.97 
 
 		 169 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0496053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0112  OsmC-like protein  30.93 
 
 		 169 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.636366  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1151  OsmC family protein  28.57 
 
 		 183 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.824502  normal  0.359642 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0330  OsmC family protein  28.04 
 
 		 169 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.514624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  25 
 
 		 148 aa  53.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1127  OsmC family protein  27.84 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938023 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4668  OsmC family protein  27.19 
 
 		 183 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1477  OsmC family protein  32 
 
 		 137 aa  53.1  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1670  OsmC family protein  26.05 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0539264  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1639  OsmC family protein  25.42 
 
 		 167 aa  52.4  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.945103  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13840  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  26.27 
 
 		 145 aa  52.4  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0867  OsmC family protein  27.78 
 
 		 169 aa  52  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376239  hitchhiker  0.00350915 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1072  OsmC family protein  24.79 
 
 		 135 aa  50.4  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.107078  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0781  OsmC family protein  29.59 
 
 		 169 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2855  OsmC family protein  27.45 
 
 		 169 aa  48.9  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000502537  normal  0.0640135 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3231  OsmC family protein  26.02 
 
 		 163 aa  48.9  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3865  OsmC family protein  25 
 
 		 175 aa  48.5  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.745195  normal  0.175914 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0206  OsmC family protein  25.49 
 
 		 174 aa  47  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.338673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1348  OsmC family protein  22.46 
 
 		 151 aa  46.2  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2031  OsmC family protein  24.53 
 
 		 138 aa  45.1  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.650355  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0897  OsmC family protein  24.74 
 
 		 145 aa  44.7  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669017  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>