More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3769 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02809  dipeptidyl peptidase IV  46.68 
 
 
729 aa  638    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1104  dipeptidyl peptidase IV  53.71 
 
 
752 aa  857    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3990  dipeptidyl peptidase IV  75.13 
 
 
763 aa  1216    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0814  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  88.41 
 
 
765 aa  1427    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000313146  hitchhiker  0.0000639736 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3843  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  75.1 
 
 
771 aa  1210    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.036555  unclonable  0.0000141613 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2985  peptidase S9B, dipeptidylpeptidase IV-like protein  69.33 
 
 
775 aa  1126    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3968  peptidase S9B, dipeptidylpeptidase IV-like  54.5 
 
 
735 aa  821    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.507879  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0650  dipeptidyl-peptidase IV  75.71 
 
 
763 aa  1222    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00104928  normal  0.120893 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0774  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  76.69 
 
 
750 aa  1243    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00925268  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0732  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  77.34 
 
 
748 aa  1244    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0814063  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3769  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  100 
 
 
768 aa  1586    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000158089  hitchhiker  0.00225371 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3372  dipeptidyl-peptidase IV  75.58 
 
 
763 aa  1221    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0367236  normal  0.0127919 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0532  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  72 
 
 
767 aa  1181    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.784675  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00782  Dipeptidyl peptidase IV  53.98 
 
 
741 aa  818    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0118527  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0649  dipeptidyl-peptidase IV  75.71 
 
 
763 aa  1222    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000821828  hitchhiker  0.00018889 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0785  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  75.75 
 
 
771 aa  1219    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.355862  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3662  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  75.42 
 
 
766 aa  1214    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0549477  hitchhiker  0.000000187493 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3720  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  75.63 
 
 
767 aa  1214    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0109234  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0600  dipeptidyl peptidase IV  73.19 
 
 
768 aa  1132    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0141822  normal  0.0367187 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0677  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  75.32 
 
 
760 aa  1214    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00440025  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3865  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  45.98 
 
 
741 aa  608  9.999999999999999e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3418  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  44.07 
 
 
738 aa  599  1e-170  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2106  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  41.64 
 
 
751 aa  593  1e-168  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1409  dipeptidyl-peptidase IV  40.98 
 
 
754 aa  516  1.0000000000000001e-145  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4258  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  37.53 
 
 
812 aa  431  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.575828  normal  0.163799 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0996  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  34.43 
 
 
771 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6185  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  38.01 
 
 
733 aa  386  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0056  peptidase S9B, dipeptidylpeptidase IV-like  32.09 
 
 
747 aa  377  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1419  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  32.7 
 
 
723 aa  372  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.383937  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4504  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  34.01 
 
 
739 aa  354  4e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04800  dipeptidyl aminopeptidase IV  32.74 
 
 
721 aa  348  3e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.315702  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_24120  predicted protein  34.92 
 
 
568 aa  330  5.0000000000000004e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0505  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  31.88 
 
 
709 aa  330  8e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0754  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  33.11 
 
 
724 aa  326  1e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.125402  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1241  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  33.11 
 
 
721 aa  323  6e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.349009  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1194  Dipeptidyl-peptidase IV  31.21 
 
 
757 aa  318  2e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.929099 
 
 
-
 
NC_002950  PG1361  dipeptidyl aminopeptidase IV, putative  31.8 
 
 
732 aa  318  3e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2431  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  30.3 
 
 
735 aa  313  7.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.474543  normal  0.175702 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1057  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  31.88 
 
 
737 aa  301  3e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0728154  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0503  dipeptidyl aminopeptidase IV  29.85 
 
 
723 aa  301  4e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.472186 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2538  Dipeptidyl-peptidase IV  29.65 
 
 
1006 aa  301  4e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2523  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  31.79 
 
 
740 aa  294  4e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0603054  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2619  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.36 
 
 
735 aa  293  6e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0220862  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2549  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  29.96 
 
 
725 aa  293  1e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1335  peptidase S9, dipeptidylpeptidase  31.5 
 
 
749 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180958  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1085  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  28.91 
 
 
718 aa  277  4e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.968267  normal  0.197428 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3037  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain-containing protein  31.52 
 
 
685 aa  262  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8451  peptidase, S9B (dipeptidyl peptidase IV) subfamily  30.77 
 
 
689 aa  260  8e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.695642  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3909  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.04 
 
 
732 aa  258  3e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5657  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.48 
 
 
693 aa  256  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.56481  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0755  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.36 
 
 
719 aa  255  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5287  Dipeptidyl-peptidase IV  29.44 
 
 
683 aa  255  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645423 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3655  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  28.5 
 
 
726 aa  254  5.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0640869 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23950  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  30.99 
 
 
711 aa  253  7e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0111668  normal  0.0730472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1253  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain-containing protein  28.45 
 
 
714 aa  247  6e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4028  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  29.39 
 
 
732 aa  246  9e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210313  normal  0.469025 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0485  putative peptidase  29.82 
 
 
711 aa  243  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06438  hypothetical dipeptidyl aminopeptidase (Eurofung)  26.92 
 
 
773 aa  228  2e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1129  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.87 
 
 
692 aa  228  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02946  Dipeptidyl aminopeptidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7SI80]  29.77 
 
 
906 aa  215  2.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2692  Dipeptidyl-peptidase IV  27.56 
 
 
772 aa  213  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00660849  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3764  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.54 
 
 
710 aa  209  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.350173 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01410  dipeptidyl-peptidase and tripeptidyl-peptidase, putative  27.69 
 
 
883 aa  201  5e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3912  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.08 
 
 
701 aa  200  9e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.529174  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0346  peptidase S9B, dipeptidylpeptidase IV-like  26.8 
 
 
764 aa  198  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.435892 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4146  dipeptidyl-peptidase IV  26.32 
 
 
714 aa  194  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0135173 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84390  dipeptidyl aminopeptidase B  27.56 
 
 
852 aa  192  1e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.309155  normal  0.832688 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01445  peptidase  28.81 
 
 
779 aa  192  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1436  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.75 
 
 
776 aa  189  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.558738  normal  0.0231661 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0576  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.5 
 
 
828 aa  189  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.115519  normal  0.710419 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04186  dipeptidyl peptidase IV  28.91 
 
 
770 aa  188  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.804182  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.79 
 
 
831 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0807  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.35 
 
 
827 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000293911  hitchhiker  0.00280594 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1376  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  26.38 
 
 
814 aa  182  1e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.79 
 
 
829 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3195  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  28.16 
 
 
828 aa  179  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0642  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.23 
 
 
826 aa  179  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.224163  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3757  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.09 
 
 
826 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000738695  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3700  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.09 
 
 
826 aa  178  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000363184  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3883  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.09 
 
 
826 aa  177  5e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0168383  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.39 
 
 
688 aa  177  5e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.581049  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4159  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.23 
 
 
827 aa  177  7e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.924562 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0015  dipeptidyl-peptidase  27.49 
 
 
795 aa  175  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1154  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.1 
 
 
747 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3014  dipeptidyl peptidase IV, putative  29.07 
 
 
824 aa  174  5e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.003026  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1624  dipeptidyl-peptidase IV  40.81 
 
 
228 aa  174  7.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0013  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.11 
 
 
795 aa  173  1e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.439144  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0568  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.25 
 
 
823 aa  171  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000257692  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0328  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.02 
 
 
800 aa  171  6e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0614  dipeptidyl peptidase IV, putative  28.02 
 
 
826 aa  171  7e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3167  putative peptidase  28.14 
 
 
819 aa  169  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3933  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.07 
 
 
789 aa  169  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3325  Dipeptidyl-peptidase IV  27.48 
 
 
710 aa  169  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0347193  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0608  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.59 
 
 
826 aa  167  5e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00270807  normal  0.195157 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3422  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.37 
 
 
826 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.286167 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0607  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.37 
 
 
826 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00770988 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02195  Dipeptidyl peptidase IV  26.09 
 
 
831 aa  161  5e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2525  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.3 
 
 
850 aa  160  8e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3030  Dipeptidyl-peptidase IV  28.17 
 
 
783 aa  159  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01460  peptidase  25.56 
 
 
756 aa  157  7e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>