More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3741 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  79.04 
 
 
433 aa  673  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  100 
 
 
444 aa  904  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  75.87 
 
 
437 aa  656  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  69.18 
 
 
434 aa  588  1e-167  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  70.02 
 
 
407 aa  582  1e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  49.53 
 
 
433 aa  405  1e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  43.17 
 
 
440 aa  336  5e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  42.23 
 
 
431 aa  332  1e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  45.6 
 
 
430 aa  329  6e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  44.58 
 
 
455 aa  328  9e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  42.34 
 
 
426 aa  313  3e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  41.81 
 
 
445 aa  303  4e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  42.28 
 
 
423 aa  300  2e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  40.65 
 
 
438 aa  294  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  43.44 
 
 
433 aa  292  7e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  39.4 
 
 
426 aa  284  3e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  40.48 
 
 
459 aa  279  8e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  40.73 
 
 
426 aa  272  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  38.04 
 
 
470 aa  272  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  38.16 
 
 
432 aa  267  3e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  39.19 
 
 
430 aa  257  3e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  40.33 
 
 
405 aa  256  4e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  36.85 
 
 
431 aa  254  2e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  36.95 
 
 
441 aa  250  4e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  38.29 
 
 
423 aa  243  5e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  39.53 
 
 
412 aa  238  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  39.53 
 
 
411 aa  233  4e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  36.79 
 
 
444 aa  233  5e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  39.43 
 
 
408 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  39.43 
 
 
408 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  39.43 
 
 
408 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  40.37 
 
 
419 aa  227  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  34.98 
 
 
426 aa  223  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  37.09 
 
 
402 aa  221  1e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  37.19 
 
 
421 aa  221  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  36.43 
 
 
417 aa  220  5e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  36.43 
 
 
417 aa  220  5e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  36.43 
 
 
417 aa  220  5e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  38.35 
 
 
402 aa  219  9e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  35.81 
 
 
422 aa  218  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  36.68 
 
 
424 aa  218  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  34.15 
 
 
407 aa  214  3e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  37.97 
 
 
404 aa  213  5e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  34.86 
 
 
428 aa  213  8e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  37.53 
 
 
403 aa  208  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  34.75 
 
 
414 aa  206  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  35.43 
 
 
429 aa  205  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  34.29 
 
 
421 aa  201  3e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  37.6 
 
 
428 aa  198  1e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  33.9 
 
 
407 aa  197  2e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  32.7 
 
 
416 aa  193  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  35.54 
 
 
401 aa  192  9e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  35.57 
 
 
396 aa  192  1e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  33.33 
 
 
400 aa  191  3e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  35.09 
 
 
421 aa  190  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  34.59 
 
 
415 aa  189  6e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  33.66 
 
 
413 aa  189  9e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  34.04 
 
 
413 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  34.19 
 
 
436 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  34.04 
 
 
413 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  33.67 
 
 
390 aa  186  6e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  34.59 
 
 
444 aa  185  2e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  33.66 
 
 
443 aa  185  2e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  35.44 
 
 
407 aa  182  8e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  33.41 
 
 
409 aa  181  3e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  32.79 
 
 
420 aa  180  5e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  34.25 
 
 
426 aa  178  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  31.03 
 
 
425 aa  176  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  32.3 
 
 
413 aa  174  2e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  32.06 
 
 
423 aa  172  7e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  31.15 
 
 
445 aa  172  9e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  31.3 
 
 
405 aa  172  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  31.17 
 
 
413 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  32.24 
 
 
417 aa  171  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  32.8 
 
 
461 aa  170  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  31.41 
 
 
419 aa  170  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  31.59 
 
 
408 aa  169  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  34.76 
 
 
432 aa  168  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  30.21 
 
 
414 aa  169  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  32.78 
 
 
406 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  29.89 
 
 
451 aa  169  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  32.2 
 
 
448 aa  168  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  30.94 
 
 
419 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  32.18 
 
 
391 aa  167  5e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  31.73 
 
 
412 aa  165  1e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  31.31 
 
 
418 aa  164  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  33.68 
 
 
405 aa  164  4e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  33.51 
 
 
410 aa  162  1e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2932  amidohydrolase  32.07 
 
 
431 aa  159  9e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  29.95 
 
 
411 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  31.3 
 
 
391 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  32.02 
 
 
413 aa  157  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  32.45 
 
 
407 aa  157  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  29.95 
 
 
411 aa  157  5e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  30.75 
 
 
408 aa  157  5e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  29.66 
 
 
432 aa  156  5e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  31.6 
 
 
411 aa  156  9e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  29.26 
 
 
412 aa  155  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1060  amidohydrolase  32.14 
 
 
438 aa  154  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000132044 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  31.02 
 
 
425 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.709022 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>