More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3735 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 628 aa  1278    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  81.21 
 
 		 617 aa  1043    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  61.81 
 
 		 616 aa  793    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1162  tonB-dependent vitamin B12 receptor  36.29 
 
 		 622 aa  378  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  32.22 
 
 		 619 aa  298  3e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  31.17 
 
 		 614 aa  298  3e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  32.8 
 
 		 1023 aa  284  3.0000000000000004e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  32.46 
 
 		 616 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  32.5 
 
 		 627 aa  278  2e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  32.91 
 
 		 616 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  30.79 
 
 		 611 aa  266  7e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  30.99 
 
 		 628 aa  265  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.89 
 
 		 623 aa  265  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  30.62 
 
 		 611 aa  260  5.0000000000000005e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  30.87 
 
 		 602 aa  256  8e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.82 
 
 		 631 aa  256  9e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00261  phosphatidylglycerophosphatase  28.59 
 
 		 617 aa  247  4e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.71 
 
 		 615 aa  241  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  30.76 
 
 		 619 aa  238  3e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  29.32 
 
 		 614 aa  237  6e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.32 
 
 		 614 aa  237  6e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.11 
 
 		 614 aa  236  7e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.11 
 
 		 614 aa  236  8e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0273  TonB-dependent receptor  30.9 
 
 		 602 aa  236  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0292443  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.48 
 
 		 614 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4073  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.37 
 
 		 630 aa  234  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000943492  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0142  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.37 
 
 		 630 aa  234  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000593825  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.5 
 
 		 614 aa  234  3e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.89 
 
 		 614 aa  234  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  29.29 
 
 		 618 aa  234  4.0000000000000004e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.8 
 
 		 614 aa  234  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 638 aa  233  8.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.8 
 
 		 614 aa  233  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.8 
 
 		 614 aa  233  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1651  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 648 aa  232  2e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613844 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.64 
 
 		 614 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0461  TonB-dependent vitamin B12 receptor  29.38 
 
 		 613 aa  231  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.19 
 
 		 631 aa  230  6e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1447  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 632 aa  229  1e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 627 aa  228  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  30.25 
 
 		 628 aa  228  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 613 aa  227  5.0000000000000005e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.42 
 
 		 615 aa  223  7e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07860  TonB-dependent vitamin B12 receptor  28.65 
 
 		 630 aa  221  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239557  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2789  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 698 aa  219  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.973502 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3757  TonB-dependent receptor plug  30.03 
 
 		 612 aa  219  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.1 
 
 		 631 aa  219  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 624 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.41 
 
 		 631 aa  218  4e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  28.72 
 
 		 631 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  28.94 
 
 		 617 aa  209  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2667  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 627 aa  206  8e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0986558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  28 
 
 		 645 aa  204  3e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 641 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2209  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 624 aa  204  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0560  TonB-dependent receptor, plug  29 
 
 		 623 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0578  TonB-dependent receptor plug  28.18 
 
 		 627 aa  200  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2400  outer membrane receptor protein  28.41 
 
 		 621 aa  199  9e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.901841 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  29 
 
 		 613 aa  191  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 634 aa  184  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  27.32 
 
 		 620 aa  182  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 624 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1639  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  27.61 
 
 		 685 aa  180  9e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2327  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  27.61 
 
 		 685 aa  180  9e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.52571  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2959  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  27.61 
 
 		 685 aa  180  9e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  25.7 
 
 		 597 aa  179  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0685  vitamin B12 receptor BtuB, putative  27.61 
 
 		 685 aa  179  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174842  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 697 aa  178  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1035  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  27.27 
 
 		 685 aa  177  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127064  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1028  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  27.27 
 
 		 685 aa  176  9e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1187  outer membrane receptor for transport of vitamin B  27.27 
 
 		 821 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.096047  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 621 aa  176  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 626 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03647  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 640 aa  172  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288042  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  25.95 
 
 		 615 aa  172  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  27.68 
 
 		 634 aa  172  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 626 aa  172  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  25.87 
 
 		 614 aa  172  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 593 aa  170  9e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0834  vitamin B12 receptor BtuB, putative  24.92 
 
 		 680 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.162621  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3502  putative outer membrane cobalamin receptor, TonB dependent  24.75 
 
 		 623 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.86203  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0995  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 629 aa  160  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.864049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 642 aa  160  7e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  26.48 
 
 		 634 aa  158  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  27.63 
 
 		 623 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  25.87 
 
 		 646 aa  157  7e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 613 aa  156  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  25.91 
 
 		 638 aa  155  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0521  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 617 aa  154  4e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 681 aa  153  8e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  25.94 
 
 		 673 aa  153  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  27.71 
 
 		 633 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1065  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 611 aa  145  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.362217 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2213  TonB-dependent receptor plug  26.5 
 
 		 621 aa  144  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2402  putative TonB dependent vitamin B12 outer membrane receptor  26.23 
 
 		 611 aa  144  7e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  26.75 
 
 		 671 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  42.37 
 
 		 637 aa  141  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0721  Outer membrane cobalamin receptor protein-like  24.81 
 
 		 640 aa  140  4.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 647 aa  140  6e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 690 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>