More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3725 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0796  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.42 
 
 		 620 aa  718    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3169  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.45 
 
 		 620 aa  741    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3838  methyl-accepting chemotaxis protein  61.77 
 
 		 620 aa  697    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3725  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 620 aa  1243    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.403145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0764  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.77 
 
 		 620 aa  704    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.42 
 
 		 620 aa  729    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.35347 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2609  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.77 
 
 		 621 aa  751    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.74 
 
 		 620 aa  732    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0691  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.42 
 
 		 620 aa  729    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3551  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.42 
 
 		 620 aa  729    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183884 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1091  chemotaxis sensory transducer  59.84 
 
 		 620 aa  730    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0174472  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.94 
 
 		 620 aa  709    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.733563  normal  0.773778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0792  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.61 
 
 		 620 aa  707    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.912748  normal  0.850506 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3502  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  74.35 
 
 		 620 aa  920    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.666992  normal  0.2901 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0847  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.29 
 
 		 620 aa  637    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.566037  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2954  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.13 
 
 		 620 aa  823    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000679912  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4372  methyl-accepting chemotaxis protein  44.53 
 
 		 619 aa  455  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0685  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.38 
 
 		 620 aa  434  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000502  methyl-accepting chemotaxis protein  32.64 
 
 		 589 aa  263  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.567249  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.82 
 
 		 541 aa  261  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.81 
 
 		 552 aa  258  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.43301 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0606  methyl-accepting chemotaxis protein  31.61 
 
 		 587 aa  258  3e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4196  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.63 
 
 		 552 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14959  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0219  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.52 
 
 		 773 aa  252  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.952357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  42.28 
 
 		 713 aa  247  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  42.94 
 
 		 712 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.32 
 
 		 637 aa  245  1.9999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  42.01 
 
 		 712 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.88 
 
 		 716 aa  244  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.97 
 
 		 543 aa  243  5e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.17 
 
 		 541 aa  244  5e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05387  histidine kinase  31.41 
 
 		 589 aa  243  6e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2607  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.4 
 
 		 541 aa  242  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00122932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.39 
 
 		 540 aa  237  6e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.95 
 
 		 541 aa  237  6e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.77 
 
 		 640 aa  236  7e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000971  methyl-accepting chemotaxis protein  39.71 
 
 		 553 aa  236  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370017  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3269  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.72 
 
 		 605 aa  236  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000515244  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07022  histidine kinase  40.57 
 
 		 553 aa  235  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.3 
 
 		 541 aa  235  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.53 
 
 		 564 aa  234  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.5 
 
 		 544 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.67 
 
 		 542 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.81 
 
 		 637 aa  233  8.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2952  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.44 
 
 		 541 aa  233  9e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000751538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2356  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36 
 
 		 619 aa  229  8e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0809243  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0081  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.13 
 
 		 544 aa  229  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  40.86 
 
 		 629 aa  228  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1324  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  42.25 
 
 		 523 aa  228  3e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0085  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.25 
 
 		 638 aa  228  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0647334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1007  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.04 
 
 		 573 aa  227  4e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.02936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  41.14 
 
 		 640 aa  226  7e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0252  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  40.91 
 
 		 623 aa  226  8e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.866394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.98 
 
 		 714 aa  226  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0164438 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3557  methyl-accepting chemotaxis transducer  39.59 
 
 		 714 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.2 
 
 		 639 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523103  normal  0.0331864 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.59 
 
 		 714 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  36.76 
 
 		 633 aa  225  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.67 
 
 		 636 aa  225  2e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3582  methyl-accepting chemotaxis protein  38.03 
 
 		 541 aa  224  3e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3770  chemotaxis sensory transducer  42.25 
 
 		 715 aa  224  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.13 
 
 		 674 aa  224  4e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.98 
 
 		 541 aa  224  4e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00762848  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.67 
 
 		 638 aa  224  4e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.77 
 
 		 626 aa  224  4.9999999999999996e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29760  putative chemotaxis transducer  41.06 
 
 		 714 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001073  N-acetylglucosamine regulated methyl-accepting chemotaxis protein  41.64 
 
 		 628 aa  223  6e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2546  putative chemotaxis transducer  40.78 
 
 		 714 aa  223  9e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.5 
 
 		 548 aa  223  9e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01731  Methyl-accepting chemotaxis protein  40.38 
 
 		 539 aa  223  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3856  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.5 
 
 		 640 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.825575 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.69 
 
 		 411 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2315  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  31.39 
 
 		 653 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.967368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0908  methyl-accepting chemotaxis protein  42.68 
 
 		 633 aa  222  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000172893  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.27 
 
 		 568 aa  221  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0712  chemotaxis sensory transducer  33.6 
 
 		 541 aa  221  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000566108  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.27 
 
 		 638 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1228  methyl-accepting chemotaxis transducer  41.83 
 
 		 688 aa  220  6e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2074  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.5 
 
 		 714 aa  220  7e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2970  chemotaxis sensory transducer  40.7 
 
 		 712 aa  220  7e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001822  methyl-accepting chemotaxis protein  38.59 
 
 		 557 aa  220  7e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000124429  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.95 
 
 		 547 aa  220  7e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.04 
 
 		 638 aa  220  7e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.455391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  41.64 
 
 		 626 aa  219  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0106  methyl-accepting chemotaxis protein  39.84 
 
 		 546 aa  219  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.827543  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2511  methyl-accepting chemotaxis protein  39.78 
 
 		 653 aa  219  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295069  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2284  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.27 
 
 		 653 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297466 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0732  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.89 
 
 		 555 aa  219  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0173  methyl-accepting chemotaxis protein  38.59 
 
 		 639 aa  219  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2562  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.6 
 
 		 671 aa  218  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046581 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00119  methyl-accepting chemotaxis protein  36.41 
 
 		 626 aa  218  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0580  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.24 
 
 		 679 aa  218  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67010  putative chemotaxis transducer  42.47 
 
 		 647 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3098  methyl-accepting chemotaxis protein  37.21 
 
 		 642 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398555  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.18 
 
 		 630 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2966  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37.06 
 
 		 642 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.113943 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.18 
 
 		 630 aa  217  4e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  38.18 
 
 		 630 aa  218  4e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.18 
 
 		 630 aa  217  5e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3114  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  38.57 
 
 		 541 aa  217  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.860602  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>