68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3673 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3673  AbgT putative transporter  100 
 
 		 518 aa  1040    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3120  AbgT putative transporter  91.89 
 
 		 520 aa  961    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3449  transporter  87.02 
 
 		 512 aa  895    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3423  transporter  67.86 
 
 		 515 aa  701    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.898769 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0389  hypothetical protein  61.37 
 
 		 519 aa  625  1e-178  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004283  putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter  60.2 
 
 		 519 aa  615  1e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0739  putative ion transporter  60.76 
 
 		 519 aa  615  1e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01141  hypothetical protein  60 
 
 		 519 aa  613  9.999999999999999e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0160  transporter, putative  59.41 
 
 		 519 aa  598  1e-169  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0146  AbgT putative transporter  58.81 
 
 		 519 aa  591  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0151  AbgT putative transporter  58.81 
 
 		 519 aa  591  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0146  AbgT putative transporter  58.61 
 
 		 519 aa  586  1e-166  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0147  AbgT putative transporter  57.82 
 
 		 519 aa  585  1e-166  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1944  AbgT putative transporter  55.8 
 
 		 519 aa  558  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432903  decreased coverage  0.00626673 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0167  AbgT putative transporter  44.62 
 
 		 520 aa  478  1e-133  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.583779  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0678  AbgT family protein  46.71 
 
 		 518 aa  459  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0748  AbgT putative transporter  46.51 
 
 		 518 aa  457  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0064  AbgT putative transporter  46.75 
 
 		 518 aa  427  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000877421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0028  AbgT putative transporter  44.57 
 
 		 512 aa  409  1e-113  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.790153  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0537  AbgT putative transporter  45.63 
 
 		 529 aa  399  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.121882  normal  0.78057 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2328  efflux pump component MtrF  43.96 
 
 		 516 aa  394  1e-108  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.25696  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1352  AbgT putative transporter  42.63 
 
 		 519 aa  395  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000127247  normal  0.0238452 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0800  putative efflux pump component MtrF  39.24 
 
 		 509 aa  390  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3654  AbgT putative transporter  42.05 
 
 		 537 aa  383  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3559  putative efflux pump component MtrF  42 
 
 		 535 aa  382  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4058  AbgT putative transporter  42.42 
 
 		 539 aa  376  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000746135  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4042  AbgT putative transporter  43.74 
 
 		 535 aa  378  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1388  putative ion transporter  42.31 
 
 		 530 aa  375  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.158074  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4208  AbgT putative transporter  42.86 
 
 		 540 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4381  AbgT putative transporter  42.86 
 
 		 540 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3926  AbgT putative transporter  42.62 
 
 		 535 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4057  AbgT putative transporter  41.46 
 
 		 539 aa  374  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.106368  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0134  AbgT putative transporter  42.77 
 
 		 538 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.722786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0156  AbgT putative transporter  42.67 
 
 		 538 aa  370  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.632237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002729  multidrug efflux pump component MtrF  41.1 
 
 		 528 aa  369  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.189489  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3833  AbgT putative transporter  42.13 
 
 		 535 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4247  AbgT putative transporter  42.86 
 
 		 540 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0404  hypothetical protein  42.75 
 
 		 534 aa  371  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000189157  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0094  AbgT putative transporter  43.22 
 
 		 511 aa  369  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2198  AbgT putative transporter  43.25 
 
 		 534 aa  359  8e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3988  AbgT putative transporter  42.72 
 
 		 532 aa  354  2e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.025023  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03248  hypothetical protein  43.05 
 
 		 522 aa  353  2.9999999999999997e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00653  putative p-aminobenzoyl-glutamate transport protein (AbgT family)  42.96 
 
 		 525 aa  352  5.9999999999999994e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0018  AbgT putative transporter  38.32 
 
 		 511 aa  342  8e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5237  AbgT putative transporter  35.63 
 
 		 514 aa  335  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2550  AbgT putative transporter  35.4 
 
 		 512 aa  333  5e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2500  AbgT putative transporter  35.4 
 
 		 512 aa  333  5e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.393167  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0518  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  37.7 
 
 		 507 aa  330  3e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0400  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  38.71 
 
 		 505 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.703061  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0029  AbgT putative transporter  37.55 
 
 		 506 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13432  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2289  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  36.69 
 
 		 508 aa  319  7e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1548  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  36.69 
 
 		 508 aa  319  7e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01313  predicted cryptic aminobenzoyl-glutamate transporter  36.55 
 
 		 508 aa  318  1e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1983  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  36.69 
 
 		 510 aa  319  1e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.328307 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1452  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  36.55 
 
 		 508 aa  318  1e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1786  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  36.69 
 
 		 510 aa  318  1e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01323  hypothetical protein  36.55 
 
 		 508 aa  318  1e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2308  AbgT transporter family  36.49 
 
 		 508 aa  318  2e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950001  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21460  putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter  37.68 
 
 		 585 aa  317  3e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4202  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  34.07 
 
 		 508 aa  310  2.9999999999999997e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.609868  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1508  AbgT putative transporter  35 
 
 		 523 aa  299  8e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2611  AbgT putative transporter  34.75 
 
 		 552 aa  259  1e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1579  aminobenzoyl-glutamate transport protein  35.67 
 
 		 305 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1577  putative efflux pump component MtrF  36.77 
 
 		 263 aa  139  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2249  short chain fatty acid transporter  25.22 
 
 		 440 aa  50.4  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1137  short chain fatty acid transporter  39.22 
 
 		 462 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.534367 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1708  short chain fatty acid transporter  40.38 
 
 		 446 aa  44.7  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1923  short-chain fatty acids transporter  27.39 
 
 		 455 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>