45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3671 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3671  phosphoesterase PA-phosphatase related  100 
 
 		 213 aa  435  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3447  phosphoesterase, PA-phosphatase related  62.38 
 
 		 218 aa  278  4e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3118  phosphoesterase PA-phosphatase related  49.26 
 
 		 235 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2901  phosphoesterase, PA-phosphatase related  55.74 
 
 		 224 aa  209  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0866647  normal  0.913295 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1221  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.73 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3030  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.42 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.452629  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0981  hypothetical protein  26.27 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0637  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.82 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0951  hypothetical protein  25 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2558  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.11 
 
 		 255 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0088777  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0607  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.9 
 
 		 179 aa  52  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00776566  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1669  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.34 
 
 		 202 aa  51.6  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000273408  normal  0.218841 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4225  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.07 
 
 		 226 aa  52  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0735  PAP2 family protein  34.18 
 
 		 255 aa  50.8  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4017  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.73 
 
 		 290 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  0.169945 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0891  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  29.6 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.467652  normal  0.655955 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2672  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  24.65 
 
 		 191 aa  50.8  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3901  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.07 
 
 		 232 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_004310  BR0740  PAP2 family protein  35.21 
 
 		 255 aa  50.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2554  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.65 
 
 		 280 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0968  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.04 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.133557  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4469  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0466  phosphoesterase, PA-phosphatase related  25.37 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1773  PAP2 superfamily protein  24.27 
 
 		 445 aa  46.2  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2545  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.55 
 
 		 242 aa  45.8  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1888  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  30.85 
 
 		 192 aa  45.8  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.871384  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.86 
 
 		 178 aa  45.8  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4360  lipid A 1-phosphatase protein  32.98 
 
 		 268 aa  46.2  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1791  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.27 
 
 		 225 aa  45.8  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.824897  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1441  PAP2 family protein  31.13 
 
 		 175 aa  45.4  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.24965  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0381  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.05 
 
 		 220 aa  45.1  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0547  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.07 
 
 		 261 aa  44.3  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0347407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1969  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.26 
 
 		 253 aa  44.3  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175709  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1412  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.77 
 
 		 263 aa  44.7  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.98368  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0936  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.23 
 
 		 286 aa  43.5  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2844  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.4 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.651448  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1340  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.93 
 
 		 249 aa  43.5  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.130328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3179  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.12 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2185  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.08 
 
 		 257 aa  43.1  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.303622  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2932  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.83 
 
 		 203 aa  42.7  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  0.0854276 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3788  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.22 
 
 		 169 aa  42.7  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1770  glycosyltransferase  29.67 
 
 		 812 aa  42.4  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2201  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.13 
 
 		 208 aa  41.6  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5449  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.19 
 
 		 284 aa  41.6  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.961923  normal  0.71434 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3219  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  30.11 
 
 		 230 aa  41.6  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>