105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3595 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3595  Beta-lactamase  100 
 
 		 272 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3414  Beta-lactamase  68.38 
 
 		 272 aa  394  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.062557 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1214  putative mobile metallo-beta-lactamase  48.64 
 
 		 248 aa  240  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.621321  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1178  Beta-lactamase  38.73 
 
 		 238 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.188267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0822  Beta-lactamase  40.53 
 
 		 269 aa  176  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252294  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0887  Beta-lactamase  37.45 
 
 		 261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.528185  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3154  Beta-lactamase  37.75 
 
 		 237 aa  169  5e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3485  Beta-lactamase  31.9 
 
 		 248 aa  128  8.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0354  Beta-lactamase  29.67 
 
 		 258 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2056  Beta-lactamase  28.99 
 
 		 246 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.53906 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6144  Beta-lactamase  30.32 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.768175 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3460  beta-lactamase II  30.96 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3218  beta-lactamase II  30.96 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.109297  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3473  beta-lactamase II  29.29 
 
 		 256 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00878467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3245  beta-lactamase II  30.54 
 
 		 256 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0138707  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3500  beta-lactamase II  30.54 
 
 		 256 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0380  Beta-lactamase  29.25 
 
 		 260 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.572749  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1371  Beta-lactamase  28.97 
 
 		 244 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265267  normal  0.207163 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3152  Beta-lactamase  31.41 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0137675  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3261  Beta-lactamase  30.32 
 
 		 249 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.611903  normal  0.804971 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3447  beta-lactamase II  32.11 
 
 		 257 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3452  beta-lactamase II  31.84 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000101739  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0371  Beta-lactamase  29.38 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.941543  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3155  beta-lactamase II  37.96 
 
 		 171 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0949519  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1802  beta-lactamase 2  35.21 
 
 		 158 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  21.65 
 
 		 319 aa  62.4  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  26.85 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  24.3 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  22.9 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  22.57 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  23.36 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  23.36 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  23.36 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  21.49 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  21.65 
 
 		 319 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  21.49 
 
 		 318 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  21.65 
 
 		 319 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  23.36 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  33.33 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  24.43 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  23.04 
 
 		 318 aa  55.5  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  23.36 
 
 		 319 aa  55.5  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  22.9 
 
 		 319 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  22.9 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  23.5 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  23.36 
 
 		 339 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  23.5 
 
 		 318 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  22.9 
 
 		 339 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1889  beta-lactamase domain protein  27.43 
 
 		 286 aa  53.9  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 321 aa  53.5  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  25.69 
 
 		 321 aa  52.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0467  metallo-beta-lactamase family protein  25.7 
 
 		 262 aa  52.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  21.61 
 
 		 335 aa  51.6  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  21.61 
 
 		 335 aa  51.6  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  21.96 
 
 		 319 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  26.03 
 
 		 318 aa  50.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  21.4 
 
 		 317 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 319 aa  49.7  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  26.03 
 
 		 318 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  22.88 
 
 		 318 aa  49.3  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  26.03 
 
 		 318 aa  49.3  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  26.03 
 
 		 318 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  26.03 
 
 		 318 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  26.03 
 
 		 318 aa  49.3  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  26.03 
 
 		 318 aa  49.3  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  26.03 
 
 		 318 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  22.33 
 
 		 317 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  25.48 
 
 		 312 aa  48.9  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  24.54 
 
 		 319 aa  48.1  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00690  hypothetical protein  25.47 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.696824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  23.12 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  23.76 
 
 		 208 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  22.33 
 
 		 316 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  26.32 
 
 		 316 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1415  beta-lactamase-like protein  25.15 
 
 		 288 aa  46.6  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0489899 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0057  hypothetical protein  25 
 
 		 295 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  24.38 
 
 		 342 aa  46.2  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  23.85 
 
 		 321 aa  46.2  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  25.44 
 
 		 305 aa  45.8  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0926  hydroxyacylglutathione hydrolase  23.81 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  21.89 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4110  Hydroxyacylglutathione hydrolase  24.73 
 
 		 226 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119244  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1646  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 292 aa  44.3  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2114  hydroxyacylglutathione hydrolase  22.35 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000176506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2408  beta-lactamase domain-containing protein  30.4 
 
 		 558 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  33.73 
 
 		 323 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3100  beta-lactamase domain-containing protein  23.15 
 
 		 287 aa  43.9  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  21.76 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1853  beta-lactamase domain-containing protein  29.73 
 
 		 356 aa  43.9  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  23.65 
 
 		 310 aa  43.9  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1084  beta-lactamase domain protein  24.12 
 
 		 302 aa  43.9  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  21.43 
 
 		 312 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5541  beta-lactamase domain protein  21.21 
 
 		 264 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1616  beta-lactamase domain-containing protein  34.44 
 
 		 559 aa  43.5  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0224319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  23.16 
 
 		 210 aa  43.5  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.704345 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00149  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14570)  23.11 
 
 		 307 aa  43.1  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1988  beta-lactamase domain-containing protein  28.09 
 
 		 557 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.91694 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3840  beta-lactamase domain-containing protein  20.49 
 
 		 294 aa  43.1  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  25.58 
 
 		 332 aa  43.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1624  beta-lactamase domain protein  22.5 
 
 		 494 aa  42.4  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.783658  normal  0.0292664 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>