139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3575 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_3575  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  435  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.580348  hitchhiker  0.00969465 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0478  hypothetical protein  49.57 
 
 
229 aa  182  5e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0599  hypothetical protein  44.02 
 
 
230 aa  155  5e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3483  hypothetical protein  40.83 
 
 
230 aa  149  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0547  hypothetical protein  40.42 
 
 
230 aa  148  5e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0429  hypothetical protein  44.34 
 
 
230 aa  148  6e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3533  hypothetical protein  42.55 
 
 
228 aa  147  1e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3762  hypothetical protein  41.7 
 
 
230 aa  146  2e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.852713 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3818  hypothetical protein  41.7 
 
 
230 aa  146  2e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0546  hypothetical protein  40.25 
 
 
230 aa  147  2e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3944  hypothetical protein  41.7 
 
 
230 aa  146  2e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.291724  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0506  hypothetical protein  41.7 
 
 
230 aa  146  2e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255853  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3326  hypothetical protein  39.83 
 
 
230 aa  145  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3159  hypothetical protein  39.17 
 
 
229 aa  145  4e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0547  hypothetical protein  40.85 
 
 
230 aa  144  8e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3732  hypothetical protein  41.83 
 
 
230 aa  141  8e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.817538  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00504  hypothetical protein  39.24 
 
 
273 aa  139  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0660  hypothetical protein  42.93 
 
 
241 aa  138  7e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4354  hypothetical protein  41.31 
 
 
229 aa  135  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0194  hypothetical protein  40.08 
 
 
245 aa  118  6e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.743567 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0294  hypothetical protein  34.22 
 
 
223 aa  110  1e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0595  putative transmembrane protein  34.48 
 
 
234 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812754  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0239  hypothetical protein  37.2 
 
 
256 aa  100  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4680  hypothetical protein  34.43 
 
 
221 aa  99.4  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.467996  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2028  hypothetical protein  33.94 
 
 
234 aa  97.1  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2602  hypothetical protein  36.47 
 
 
255 aa  94.4  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245239  normal  0.167948 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2041  hypothetical protein  36.27 
 
 
231 aa  91.7  9e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0564933  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2652  hypothetical protein  36.45 
 
 
242 aa  89.4  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  4.84219e-09  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1750  hypothetical protein  34.02 
 
 
219 aa  88.6  7e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.034244  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46580  hypothetical protein  30.54 
 
 
252 aa  86.7  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1084  hypothetical protein  31.96 
 
 
272 aa  85.1  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0585166  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3025  hypothetical protein  34.08 
 
 
240 aa  84.3  1e-15  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00392442  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0052  hypothetical protein  39.83 
 
 
257 aa  83.6  2e-15  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0060351  normal  0.567667 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2930  hypothetical protein  35.12 
 
 
240 aa  84  2e-15  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  6.17689e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3012  hypothetical protein  34.63 
 
 
240 aa  83.2  3e-15  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896353  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1111  hypothetical protein  32.26 
 
 
240 aa  82.4  4e-15  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0309164  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2512  hypothetical protein  33.99 
 
 
263 aa  82.4  5e-15  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0104508  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3109  hypothetical protein  34.63 
 
 
240 aa  81.6  7e-15  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052504  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1041  hypothetical protein  32.42 
 
 
239 aa  80.9  1e-14  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0114575  normal  0.584816 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0963  hypothetical protein  35.9 
 
 
239 aa  81.3  1e-14  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151638  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02644  putative periplasmic protein  44.44 
 
 
240 aa  80.9  1e-14  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1183  hypothetical protein  32.73 
 
 
240 aa  80.5  2e-14  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5833  hypothetical protein  32.8 
 
 
298 aa  80.1  2e-14  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1194  hypothetical protein  43.81 
 
 
234 aa  79  5e-14  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  2.61256e-05 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1958  putative signal peptide protein  46.07 
 
 
278 aa  79  5e-14  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1089  hypothetical protein  32.27 
 
 
240 aa  79  6e-14  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210765  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3206  hypothetical protein  32.27 
 
 
240 aa  78.6  7e-14  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1149  hypothetical protein  31.82 
 
 
240 aa  77.8  1e-13  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0395177  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0239  hypothetical protein  29.36 
 
 
266 aa  77.4  1e-13  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220267  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0231  histidine kinase  31.95 
 
 
235 aa  77.4  2e-13  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0721367  normal  0.567279 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0933  hypothetical protein  32.17 
 
 
244 aa  77.4  2e-13  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.281157  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1081  hypothetical protein  32.08 
 
 
240 aa  75.9  4e-13  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  2.0952e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1117  hypothetical protein  44.12 
 
 
234 aa  74.7  9e-13  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0290  hypothetical protein  27.91 
 
 
265 aa  74.7  9e-13  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2403  hypothetical protein  35.08 
 
 
220 aa  74.7  1e-12  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1005  hypothetical protein  45.1 
 
 
234 aa  73.2  3e-12  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433057  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2231  hypothetical protein  37.4 
 
 
280 aa  73.2  3e-12  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3711  hypothetical protein  33.88 
 
 
235 aa  71.6  8e-12  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.167645  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1890  hypothetical protein  35.65 
 
 
225 aa  71.6  9e-12  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1317  hypothetical protein  40.15 
 
 
239 aa  71.6  9e-12  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1327  hypothetical protein  40.15 
 
 
239 aa  71.2  1e-11  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2962  hypothetical protein  35 
 
 
265 aa  71.2  1e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3033  hypothetical protein  40.15 
 
 
234 aa  71.2  1e-11  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.501077  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1600  hypothetical protein  32.37 
 
 
241 aa  71.2  1e-11  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.400677  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0717  hypothetical protein  39.52 
 
 
267 aa  70.5  2e-11  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  1.02421e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3502  hypothetical protein  33.18 
 
 
280 aa  70.5  2e-11  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1353  hypothetical protein  30.42 
 
 
239 aa  70.1  3e-11  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4008  hypothetical protein  38.64 
 
 
239 aa  69.3  4e-11  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02514  hypothetical protein  30.05 
 
 
227 aa  68.9  5e-11  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3155  hypothetical protein  37.5 
 
 
245 aa  68.9  5e-11  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.751817  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1944  hypothetical protein  42.24 
 
 
235 aa  68.9  6e-11  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137324  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1664  hypothetical protein  38.46 
 
 
281 aa  68.9  6e-11  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.886499  normal  0.578123 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3315  hypothetical protein  30.33 
 
 
236 aa  68.6  8e-11  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266873  normal  0.0899377 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1336  hypothetical protein  39.25 
 
 
234 aa  68.2  8e-11  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3758  hypothetical protein  34.06 
 
 
241 aa  68.2  1e-10  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0182  hypothetical protein  33.56 
 
 
265 aa  66.2  4e-10  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.56754  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0162  hypothetical protein  30.88 
 
 
243 aa  65.5  5e-10  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.844011 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3079  hypothetical protein  33.56 
 
 
256 aa  65.5  7e-10  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0217  hypothetical protein  36.07 
 
 
274 aa  65.5  7e-10  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207419  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0180  hypothetical protein  34.43 
 
 
243 aa  65.1  8e-10  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223462  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0232  hypothetical protein  33.79 
 
 
241 aa  64.7  9e-10  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0274  hypothetical protein  31.76 
 
 
232 aa  64.7  1e-09  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0805  hypothetical protein  28.66 
 
 
231 aa  63.5  3e-09  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201838  normal  0.0153835 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1482  hypothetical protein  27.91 
 
 
232 aa  63.2  3e-09  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3265  putative transmembrane protein  37.5 
 
 
268 aa  62.8  4e-09  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3587  hypothetical protein  37.5 
 
 
268 aa  62.8  4e-09  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00011907  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0301  hypothetical protein  35.48 
 
 
243 aa  62.4  6e-09  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0581  hypothetical protein  29.84 
 
 
216 aa  59.7  3e-08  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0201076 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3788  hypothetical protein  30.58 
 
 
242 aa  60.1  3e-08  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0260042 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0197  hypothetical protein  36.56 
 
 
271 aa  58.9  5e-08  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.680563 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3199  hypothetical protein  36.05 
 
 
336 aa  59.3  5e-08  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4133  hypothetical protein  36.47 
 
 
332 aa  59.3  5e-08  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.346993 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0216  signal peptide protein  35.48 
 
 
271 aa  58.5  7e-08  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  4.80093e-06 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3379  putative transmembrane protein  33.33 
 
 
269 aa  58.2  9e-08  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1325  hypothetical protein  36.47 
 
 
323 aa  58.2  1e-07  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2615  hypothetical protein  34.85 
 
 
281 aa  58.2  1e-07  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.360147  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1831  hypothetical protein  35.8 
 
 
331 aa  56.6  3e-07  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.281717 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2540  hypothetical protein  28.05 
 
 
227 aa  55.8  4e-07  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.386612  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1590  hypothetical protein  30.56 
 
 
242 aa  56.2  4e-07  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.557379  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0466  hypothetical protein  36.92 
 
 
238 aa  55.1  9e-07  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  9.41633e-08  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>