More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3496 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0388  transposase IS111A/IS1328/IS1533  100 
 
 
318 aa  649    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2289  transposase IS111A/IS1328/IS1533  100 
 
 
318 aa  649    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.795414  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3496  transposase IS111A/IS1328/IS1533  100 
 
 
318 aa  649    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.118492 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0840  transposase IS116/IS110/IS902  86.67 
 
 
318 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553808  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0862  transposase IS116/IS110/IS902  86.67 
 
 
318 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.595658  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1845  transposase IS116/IS110/IS902  86.67 
 
 
318 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.116231  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1950  transposase IS116/IS110/IS902  86.67 
 
 
318 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0873071  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2653  transposase IS116/IS110/IS902  86.67 
 
 
318 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.356975  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3756  transposase IS116/IS110/IS902  86.67 
 
 
318 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.723193  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1134  transposase IS116/IS110/IS902  76.6 
 
 
323 aa  494  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2742  ISCps7, transposase  69.97 
 
 
317 aa  460  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.102652  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1384  transposase IS116/IS110/IS902  89.1 
 
 
213 aa  391  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.967641  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0045  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  43.28 
 
 
318 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0046  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  43.28 
 
 
318 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0094  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  43.28 
 
 
318 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.05206  hitchhiker  0.00363531 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0132  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  43.28 
 
 
318 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0760311  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0488  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  43.28 
 
 
318 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0670  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  43.28 
 
 
318 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.375238 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0723  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  43.28 
 
 
318 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0120706  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0958  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  43.28 
 
 
318 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1143  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  43.28 
 
 
318 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1718  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  43.28 
 
 
318 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00396754  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2073  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  43.28 
 
 
318 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000159022  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2810  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  43.28 
 
 
318 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2975  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  43.28 
 
 
318 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3429  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  43.28 
 
 
318 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2116  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.58 
 
 
314 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3427  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.58 
 
 
314 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.934881 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1602  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.58 
 
 
314 aa  231  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4047  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.58 
 
 
314 aa  231  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3686  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.42 
 
 
309 aa  228  9e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1548  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.42 
 
 
309 aa  228  9e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0352  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.09 
 
 
309 aa  225  7e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.09 
 
 
309 aa  225  7e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.462333  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8696  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.79 
 
 
315 aa  220  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.331955  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4794  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.79 
 
 
315 aa  220  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5832  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.79 
 
 
315 aa  220  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236486  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1179  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.79 
 
 
315 aa  220  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7866  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.79 
 
 
315 aa  220  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848631  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0519  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.82 
 
 
320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0858  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.82 
 
 
320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1056  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.82 
 
 
320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3543  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.82 
 
 
320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.909049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3848  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.82 
 
 
320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206363  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4601  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.82 
 
 
320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2517  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.77 
 
 
322 aa  218  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0566277  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1149  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.26 
 
 
320 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.852696  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1423  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.26 
 
 
320 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0743274  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1739  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.26 
 
 
320 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.106448  normal  0.0290423 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2894  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.26 
 
 
320 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.940801  normal  0.95279 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2923  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.26 
 
 
320 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.568531  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2982  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.26 
 
 
320 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.311525  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0821  transposase IS110 family protein  39.34 
 
 
315 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.450951  normal  0.498428 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0668  transposase IS110 family protein  39.34 
 
 
315 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.732525  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3420  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.3 
 
 
322 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.415822  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2316  transposase IS110 family protein  39.34 
 
 
315 aa  212  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367866  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0133  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.22 
 
 
315 aa  211  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2664  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.22 
 
 
315 aa  211  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219726  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2708  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.22 
 
 
315 aa  211  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2339  transposase IS110 family protein  39.02 
 
 
315 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398166  normal  0.354991 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02575  hypothetical protein  75.59 
 
 
147 aa  210  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4670  transposase IS110 family protein  38.69 
 
 
315 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.820848  normal  0.467325 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0043  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.9 
 
 
321 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.706965  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1202  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.9 
 
 
321 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0645698  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2433  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.9 
 
 
321 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.945374 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5809  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.14 
 
 
321 aa  203  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911931  hitchhiker  0.000316639 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4857  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.9 
 
 
321 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131589  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1817  transposase IS116/IS110/IS902  35.9 
 
 
321 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2208  transposase IS116/IS110/IS902  35.9 
 
 
321 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146372  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.9 
 
 
321 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4049  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.9 
 
 
321 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3440  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.82 
 
 
321 aa  202  8e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.830328 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3523  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.82 
 
 
321 aa  202  8e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4107  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.82 
 
 
321 aa  202  8e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190664  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2238  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.82 
 
 
321 aa  202  8e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1046  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  36.96 
 
 
316 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113216  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1261  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  36.96 
 
 
316 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.812718 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1426  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  36.96 
 
 
316 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0372411  normal  0.895779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2597  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  36.96 
 
 
316 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3883  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  36.96 
 
 
316 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4991  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  36.96 
 
 
316 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0067  IS110 family transposase  38.19 
 
 
323 aa  200  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0110214 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0012  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.31 
 
 
316 aa  198  9e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0856  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.19 
 
 
318 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0654  transposase IS116/IS110/IS902  33.86 
 
 
328 aa  189  5e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3340  transposase IS116/IS110/IS902  33.86 
 
 
328 aa  189  5e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.451558  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2558  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  34.19 
 
 
320 aa  187  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0925  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  34.52 
 
 
320 aa  186  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.94053  normal  0.84974 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3309  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  34.19 
 
 
320 aa  185  7e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3966  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.08 
 
 
312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.573271  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2924  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.08 
 
 
312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.690618 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2164  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.08 
 
 
312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0243723 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4355  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.08 
 
 
312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.778833  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2936  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.08 
 
 
312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2915  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  34.19 
 
 
320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1084  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.08 
 
 
312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0840793  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1600  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.08 
 
 
312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4200  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.01 
 
 
316 aa  183  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0987071  normal  0.815394 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1511  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  35.16 
 
 
320 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0532296 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3125  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  33.87 
 
 
320 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000618983  unclonable  0.000014067 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>