32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3446 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3446  YfaZ family protein  100 
 
 		 179 aa  358  2e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.055004 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3297  YfaZ family protein  79.33 
 
 		 179 aa  296  1e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.842985  decreased coverage  0.0000000230689 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2962  YfaZ family protein  59.78 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2740  YfaZ family protein  70.19 
 
 		 177 aa  237  9e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000342783  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2770  YfaZ family protein  56.9 
 
 		 179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000254967  normal  0.114256 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2872  YfaZ family protein  56.9 
 
 		 179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00022374  hitchhiker  0.00192784 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2702  YfaZ family protein  56.32 
 
 		 179 aa  222  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000258539  hitchhiker  0.0000794475 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1303  YfaZ family protein  56.32 
 
 		 179 aa  223  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1568  hypothetical protein  56.9 
 
 		 179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1410  YfaZ family protein  54.6 
 
 		 179 aa  218  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.71685  normal  0.181504 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1371  YfaZ family protein  54.6 
 
 		 179 aa  218  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.376788  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1387  YfaZ family protein  54.6 
 
 		 179 aa  218  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2972  YfaZ family protein  54.6 
 
 		 179 aa  218  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.285706  normal  0.104145 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0027  YfaZ family protein  23.83 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2638  putative inner membrane protein  28.57 
 
 		 224 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2430  putative inner membrane protein  28.57 
 
 		 224 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2534  hypothetical protein  28.57 
 
 		 224 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2479  hypothetical protein  28.57 
 
 		 224 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2334  YfaZ family protein  21.97 
 
 		 190 aa  48.5  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.6281  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2505  YfaZ family protein  27.54 
 
 		 189 aa  48.1  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.634002  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2522  YfaZ superfamily  27.98 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.760699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3392  YfaZ family protein  27.78 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1319  hypothetical protein  28.67 
 
 		 180 aa  45.1  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2854  YfaZ family protein  28.67 
 
 		 180 aa  45.1  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2775  putative outer membrane protein  28.67 
 
 		 180 aa  45.1  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2689  YfaZ family protein  27.01 
 
 		 186 aa  44.7  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.673529  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0422  alkanesulfonate monooxygenase  26.36 
 
 		 382 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0354  alkanesulfonate monooxygenase  26.36 
 
 		 382 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2809  YfaZ family protein  27.98 
 
 		 180 aa  42  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1737  alkanesulfonate monooxygenase  24.81 
 
 		 382 aa  41.2  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.44148  normal  0.0887334 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1050  YfaZ family protein  32.58 
 
 		 182 aa  41.2  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.354298  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0581  hypothetical protein  30.61 
 
 		 190 aa  41.2  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000000184382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>