More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3408 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_3408  natural resistance-associated macrophage protein  100 
 
 
397 aa  771    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.913071  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08916  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family protein  51.01 
 
 
403 aa  406  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3567  natural resistance-associated macrophage protein  45.78 
 
 
401 aa  351  1e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01940  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  44.7 
 
 
415 aa  330  3e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.612589 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  44.25 
 
 
412 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  44.11 
 
 
416 aa  318  1e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  43.88 
 
 
406 aa  316  5e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  43.75 
 
 
419 aa  313  3.9999999999999997e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3815  natural resistance-associated macrophage protein  45.01 
 
 
408 aa  301  1e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01595  putative manganese/divalent cation transport protein (NRAMP family)  40.91 
 
 
398 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0733  natural resistance-associated macrophage protein  35.92 
 
 
422 aa  202  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1064  natural resistance-associated macrophage protein  37.79 
 
 
430 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.262705  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  29.65 
 
 
432 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1739  natural resistance-associated macrophage protein  30.9 
 
 
418 aa  149  8e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  30.2 
 
 
415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1273  manganese transporter NRAMP  27.32 
 
 
428 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1157  natural resistance-associated macrophage protein  29.57 
 
 
432 aa  145  9e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  28.93 
 
 
408 aa  144  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1755  natural resistance-associated macrophage protein  29.55 
 
 
404 aa  143  5e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1689  natural resistance-associated macrophage protein  27.85 
 
 
401 aa  140  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.973606  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1583  natural resistance-associated macrophage protein  30.96 
 
 
417 aa  139  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2339  natural resistance-associated macrophage protein  29.21 
 
 
432 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1894  natural resistance-associated macrophage protein  24.88 
 
 
414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0379  natural resistance-associated macrophage protein  29.32 
 
 
441 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0915646 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0735  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  25.74 
 
 
432 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  27.89 
 
 
452 aa  127  3e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3908  natural resistance-associated macrophage protein  27.07 
 
 
423 aa  127  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3378  natural resistance-associated macrophage protein  29.56 
 
 
439 aa  125  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2251  natural resistance-associated macrophage protein  26.82 
 
 
427 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000998148  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2655  manganese transporter NRAMP  27.45 
 
 
415 aa  123  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0955  manganese transport protein  28.08 
 
 
463 aa  123  7e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0075  natural resistance-associated macrophage protein  28.72 
 
 
438 aa  122  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.289103  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4401  Mn2+/Fe2+ transporter  27.25 
 
 
439 aa  122  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.412644  normal  0.493803 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1916  Mn2+/Fe2+ transporter  24.44 
 
 
434 aa  120  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0325807  decreased coverage  0.000000836565 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0796  manganese transport protein MntH  25.69 
 
 
434 aa  119  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00765423  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0465  natural resistance-associated macrophage protein  27.42 
 
 
414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.169893  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4677  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  27.29 
 
 
450 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3570  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  27.22 
 
 
448 aa  114  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.801312  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1154  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  25.93 
 
 
420 aa  113  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110246  hitchhiker  0.00000690908 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0793  natural resistance-associated macrophage protein  27.39 
 
 
421 aa  113  8.000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629468  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0709  manganese transport protein MntH  28.01 
 
 
442 aa  112  9e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947225  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0540  natural resistance-associated macrophage protein  27.39 
 
 
421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709943  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1397  manganese transport protein MntH  27.08 
 
 
429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5808  natural resistance-associated macrophage protein  27.2 
 
 
439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4273  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  27.63 
 
 
444 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.702031 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1556  manganese/divalent cation transport protein  25.59 
 
 
439 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1735  manganese transport protein MntH  28.88 
 
 
431 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0697  natural resistance-associated macrophage protein  26.17 
 
 
430 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1141  manganese transporter NRAMP  24.88 
 
 
425 aa  110  6e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0932  Mn2+/Fe2+ transporter  29.43 
 
 
622 aa  109  7.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4120  manganese transport protein MntH  28.48 
 
 
448 aa  109  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.987586  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1165  manganese transport protein MntH  26.09 
 
 
450 aa  109  8.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000527226  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1584  manganese transport protein  27.71 
 
 
453 aa  109  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.984179  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1187  manganese transport protein MntH  26.09 
 
 
450 aa  109  8.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000302407  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3722  manganese transport protein MntH  28.8 
 
 
438 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143868  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1618  Mn2+/Fe2+ transporter  25.86 
 
 
442 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038814 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4561  manganese transport protein MntH  28.8 
 
 
438 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3597  Mn2+/Fe2+ transporter  30.55 
 
 
451 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10942  manganese transport protein MntH  25.25 
 
 
429 aa  108  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1874  manganese transport protein MntH  28.88 
 
 
431 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.558588  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3802  manganese transport protein MntH  28.8 
 
 
438 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1988  manganese transport protein MntH  28.88 
 
 
431 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.40777  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1960  manganese transport protein MntH  28.09 
 
 
431 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.763494  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3889  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  30.55 
 
 
444 aa  108  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0090  natural resistance-associated macrophage protein  25.68 
 
 
425 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0692094 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1050  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  25.33 
 
 
441 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0230  manganese transport protein MntH  26.62 
 
 
426 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925481  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0308  metal ion transporter, nramp family protein  26.75 
 
 
448 aa  108  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1687  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  26.87 
 
 
448 aa  107  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.26343 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04897  manganese transport protein MntH  26.32 
 
 
423 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3586  Mn2+/Fe2+ transporter  26.1 
 
 
463 aa  107  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5787  Mn2+/Fe2+ transporter  29.58 
 
 
456 aa  107  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.521551  hitchhiker  0.00775993 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02301  manganese transport protein MntH  27.27 
 
 
412 aa  107  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1266  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  27.27 
 
 
412 aa  107  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.796866  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3623  manganese transport protein MntH  27.27 
 
 
412 aa  107  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180789  normal  0.74128 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2529  manganese transport protein MntH  27.27 
 
 
412 aa  107  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2760  manganese transport protein MntH  27.27 
 
 
412 aa  107  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2682  manganese transport protein MntH  27.27 
 
 
412 aa  107  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0112645  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02262  hypothetical protein  27.27 
 
 
412 aa  107  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2543  manganese transport protein MntH  27.27 
 
 
412 aa  107  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.630875  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1278  manganese transport protein MntH  27.27 
 
 
412 aa  107  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.913398  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3470  manganese transport protein MntH  28.16 
 
 
431 aa  107  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00427839  hitchhiker  0.000000000922874 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1463  manganese transport protein MntH  30.93 
 
 
432 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0201328  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1425  manganese/iron transporter  25.48 
 
 
449 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6575  manganese/iron transporter  24.47 
 
 
432 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3045  natural resistance-associated macrophage protein  25.54 
 
 
420 aa  104  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.830988  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2642  manganese transport protein MntH  27.87 
 
 
413 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1735  manganese transport protein MntH  27.43 
 
 
456 aa  104  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.499918  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4658  manganese transport protein MntH  29.71 
 
 
447 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3704  manganese transport protein MntH  28.48 
 
 
438 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.33277 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1583  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  25.93 
 
 
439 aa  104  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2759  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  25.91 
 
 
430 aa  104  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2958  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  26.42 
 
 
448 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2600  manganese transport protein MntH  27.59 
 
 
392 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2551  manganese transport protein MntH  27.59 
 
 
392 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.628016  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2666  manganese transport protein MntH  27.59 
 
 
392 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3647  natural resistance-associated macrophage protein  27.74 
 
 
418 aa  103  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.438351  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1441  manganese transport protein MntH  27.54 
 
 
456 aa  103  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266058  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2191  natural resistance-associated macrophage protein  28.04 
 
 
442 aa  103  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1183  natural resistance-associated macrophage protein  24.76 
 
 
420 aa  103  8e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>