More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3375 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1306  TonB-dependent receptor plug  75.24 
 
 		 820 aa  1315    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000196501  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1347  TonB-dependent receptor  81.8 
 
 		 820 aa  1401    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475888  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1482  TonB-dependent receptor, putative  77.25 
 
 		 815 aa  1330    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1237  TonB-dependent receptor, plug  74.82 
 
 		 814 aa  1308    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.115199  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3375  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 824 aa  1692    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.31809  normal  0.581234 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3044  TonB-dependent receptor plug  72.15 
 
 		 821 aa  1269    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000527887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2690  TonB-dependent receptor, plug  75.49 
 
 		 812 aa  1314    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.228232 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1445  TonB-dependent receptor, plug  72.36 
 
 		 825 aa  1240    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000476077  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2930  TonB-dependent receptor plug  79.98 
 
 		 810 aa  1393    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3803  TonB-dependent receptor, plug  51.28 
 
 		 807 aa  796    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2768  TonB-dependent receptor  76.14 
 
 		 823 aa  1315    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000855789  normal  0.291776 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2846  TonB-dependent receptor  75.78 
 
 		 823 aa  1307    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000571125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1315  TonB-dependent receptor plug  72.15 
 
 		 821 aa  1269    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000529097  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2440  TonB-dependent receptor, plug  73.07 
 
 		 825 aa  1267    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000351973  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1342  TonB-dependent receptor plug  75.72 
 
 		 820 aa  1318    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00424571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3242  TonB-dependent receptor  84.34 
 
 		 811 aa  1442    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000414671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2944  TonB-dependent receptor  76.75 
 
 		 823 aa  1326    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000178601  normal  0.742035 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  26.32 
 
 		 740 aa  184  7e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  25.99 
 
 		 748 aa  180  9e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  25.99 
 
 		 748 aa  180  9e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  25.12 
 
 		 723 aa  180  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 714 aa  177  6e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  25.21 
 
 		 737 aa  177  8e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  24.55 
 
 		 720 aa  177  9e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  24.55 
 
 		 720 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  25.73 
 
 		 749 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  24.94 
 
 		 720 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  24.35 
 
 		 720 aa  173  9e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  25.41 
 
 		 742 aa  169  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  24.53 
 
 		 738 aa  167  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  25.44 
 
 		 742 aa  167  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  24.15 
 
 		 699 aa  153  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0391  TonB-dependent siderophore receptor  24.81 
 
 		 712 aa  150  8e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.196206  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  22.71 
 
 		 707 aa  145  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  24.32 
 
 		 711 aa  140  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  23.79 
 
 		 776 aa  139  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  23.07 
 
 		 713 aa  134  9e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  23.97 
 
 		 702 aa  134  9e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  23.97 
 
 		 702 aa  134  9e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  23.28 
 
 		 722 aa  132  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  32.76 
 
 		 724 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  32.76 
 
 		 724 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  24.71 
 
 		 797 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  24.91 
 
 		 710 aa  128  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 715 aa  127  7e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  23.9 
 
 		 708 aa  127  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  30.24 
 
 		 712 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  23.71 
 
 		 724 aa  122  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4236  TonB-dependent siderophore receptor  22.45 
 
 		 710 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000695536  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  34.67 
 
 		 713 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  34.63 
 
 		 701 aa  117  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1142  TonB-dependent siderophore receptor  33.62 
 
 		 711 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.634377  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  23.55 
 
 		 709 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  36.04 
 
 		 770 aa  114  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  34.47 
 
 		 710 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  36.04 
 
 		 710 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  23.87 
 
 		 703 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4127  TonB-dependent siderophore receptor  23.37 
 
 		 702 aa  112  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00050238  normal  0.542591 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1814  putative putative ferrichrome-iron receptor  23.09 
 
 		 693 aa  112  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  35.2 
 
 		 701 aa  110  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  35.2 
 
 		 701 aa  110  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  35.2 
 
 		 701 aa  110  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  24.09 
 
 		 703 aa  109  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4307  TonB-dependent siderophore receptor  22.97 
 
 		 706 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000234699  hitchhiker  0.000000000225287 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  35.05 
 
 		 710 aa  109  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  22.92 
 
 		 817 aa  108  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  32.52 
 
 		 722 aa  108  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4743  TonB-dependent receptor, putative  22.71 
 
 		 690 aa  108  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  33.5 
 
 		 701 aa  107  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  33.5 
 
 		 701 aa  107  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4363  TonB-dependent siderophore receptor  22.6 
 
 		 706 aa  107  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000323777  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  32.31 
 
 		 701 aa  107  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0594  TonB-dependent siderophore receptor  34.34 
 
 		 708 aa  106  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  31.3 
 
 		 701 aa  106  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3560  TonB-dependent siderophore receptor  36.84 
 
 		 710 aa  105  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3953  TonB-dependent siderophore receptor  23.26 
 
 		 701 aa  105  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000731032  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4042  TonB-dependent siderophore receptor  23.18 
 
 		 697 aa  105  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.296308  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  35.27 
 
 		 719 aa  105  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3640  TonB-dependent siderophore receptor  22.79 
 
 		 767 aa  104  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0918046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  38.5 
 
 		 799 aa  104  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1527  TonB-dependent siderophore receptor  30.65 
 
 		 714 aa  104  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.698269  normal  0.163231 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  30.2 
 
 		 757 aa  103  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4362  TonB-dependent siderophore receptor  22.73 
 
 		 706 aa  103  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000023504  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  31.4 
 
 		 795 aa  103  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  33.63 
 
 		 709 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0947  TonB-dependent siderophore receptor  32 
 
 		 683 aa  102  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0779656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  35.12 
 
 		 757 aa  102  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0946  TonB-dependent siderophore receptor  34.63 
 
 		 706 aa  102  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06299  hypothetical protein  29.84 
 
 		 715 aa  100  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  32.03 
 
 		 796 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0917  TonB-dependent siderophore receptor  31.94 
 
 		 696 aa  99.8  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.572242 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  34.21 
 
 		 707 aa  99.4  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  35.96 
 
 		 810 aa  99.4  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4917  TonB-dependent siderophore receptor  38.92 
 
 		 778 aa  99.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.705684  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003567  ferrichrome-iron receptor  22.92 
 
 		 740 aa  99  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  31.76 
 
 		 796 aa  98.6  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  31.76 
 
 		 796 aa  98.2  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1381  TonB-dependent siderophore receptor  36.97 
 
 		 742 aa  98.6  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00176773  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  32.84 
 
 		 815 aa  98.2  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1439  TonB-dependent receptor protein  22.38 
 
 		 688 aa  98.2  6e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>