More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3341 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010468  EcolC_0979  DNA mismatch repair protein MutS  66.51 
 
 
853 aa  1125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.462533 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  86.6 
 
 
859 aa  1545  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  4.08163e-09 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3030  DNA mismatch repair protein MutS  66.9 
 
 
860 aa  1130  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2871  DNA mismatch repair protein MutS  66.51 
 
 
853 aa  1125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  65.06 
 
 
853 aa  1145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  57.58 
 
 
871 aa  981  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3292  DNA mismatch repair protein MutS  65.89 
 
 
851 aa  1147  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  77.39 
 
 
856 aa  1370  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  57.34 
 
 
855 aa  978  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  54.35 
 
 
883 aa  950  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  5.82755e-10 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  55.79 
 
 
857 aa  949  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.121513 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  65.38 
 
 
851 aa  1145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  80.3 
 
 
859 aa  1446  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3424  DNA mismatch repair protein MutS  65.89 
 
 
851 aa  1147  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1179  DNA mismatch repair protein MutS  55.57 
 
 
880 aa  946  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.809456 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  40.21 
 
 
867 aa  664  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0956  DNA mismatch repair protein MutS  65.77 
 
 
851 aa  1146  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  57.46 
 
 
859 aa  979  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1186  DNA mismatch repair protein MutS  51.82 
 
 
884 aa  807  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2274  DNA mismatch repair protein MutS  47.89 
 
 
911 aa  754  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.103313 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  42.22 
 
 
932 aa  660  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  77.39 
 
 
856 aa  1372  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  43.12 
 
 
881 aa  655  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  42.4 
 
 
872 aa  657  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  65.7 
 
 
862 aa  1161  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2173  DNA mismatch repair protein MutS  52.4 
 
 
939 aa  842  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.01775  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1359  DNA mismatch repair protein MutS  48.96 
 
 
870 aa  758  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219365  normal  0.0149931 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2052  DNA mismatch repair protein MutS  47.01 
 
 
890 aa  712  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.292542  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  57.42 
 
 
874 aa  1031  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  64.91 
 
 
856 aa  1156  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  75.73 
 
 
854 aa  1325  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  41.12 
 
 
872 aa  652  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  42.68 
 
 
870 aa  662  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  77.03 
 
 
861 aa  1373  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  46.19 
 
 
868 aa  737  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  1.77149e-05  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4552  DNA mismatch repair protein MutS  47.17 
 
 
871 aa  725  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1657  DNA mismatch repair protein MutS  56.06 
 
 
868 aa  898  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  77.04 
 
 
856 aa  1367  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  65.92 
 
 
853 aa  1140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  79.81 
 
 
855 aa  1419  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1446  DNA mismatch repair protein MutS  52.4 
 
 
939 aa  842  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350724  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2612  DNA mismatch repair protein MutS  52.4 
 
 
939 aa  843  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2559  DNA mismatch repair protein MutS  52.05 
 
 
891 aa  837  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  77.16 
 
 
856 aa  1368  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  41.36 
 
 
870 aa  666  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3145  DNA mismatch repair protein MutS  52.4 
 
 
939 aa  842  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2842  DNA mismatch repair protein MutS  49.71 
 
 
870 aa  749  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147304  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2088  DNA mismatch repair protein MutS  51.99 
 
 
885 aa  816  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2860  DNA mismatch repair protein MutS  66.74 
 
 
853 aa  1134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  43.63 
 
 
891 aa  707  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3589  DNA mismatch repair protein MutS  47.83 
 
 
885 aa  728  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  57.86 
 
 
855 aa  983  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1076  DNA mismatch repair protein MutS  48.01 
 
 
884 aa  754  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1282  DNA mismatch repair protein MutS  59.11 
 
 
862 aa  944  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  42.87 
 
 
896 aa  687  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  40.85 
 
 
873 aa  645  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  44.13 
 
 
850 aa  668  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1760  DNA mismatch repair protein MutS  45.85 
 
 
870 aa  672  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  77.51 
 
 
856 aa  1373  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  unclonable  8.30859e-12 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2284  DNA mismatch repair protein MutS  49.38 
 
 
897 aa  810  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.339354  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1089  DNA mismatch repair protein MutS  53.12 
 
 
882 aa  852  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  66.59 
 
 
854 aa  1158  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1619  DNA mismatch repair protein MutS  50.4 
 
 
897 aa  809  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.510747 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  42.47 
 
 
898 aa  642  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  65.8 
 
 
853 aa  1149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  48.92 
 
 
881 aa  801  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  65.93 
 
 
854 aa  1145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  44.46 
 
 
897 aa  655  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  44.04 
 
 
869 aa  657  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  65.81 
 
 
854 aa  1145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  65.96 
 
 
852 aa  1140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02548  hypothetical protein  66.51 
 
 
853 aa  1125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766489  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3986  DNA mismatch repair protein MutS  66.63 
 
 
853 aa  1129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.724345  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  66.27 
 
 
855 aa  1151  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0993  DNA mismatch repair protein MutS  53.35 
 
 
882 aa  855  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0273389  normal  0.417331 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2520  DNA mismatch repair protein MutS  51.13 
 
 
894 aa  800  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00821283  hitchhiker  3.91787e-07 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3143  DNA mismatch repair protein MutS  66.51 
 
 
853 aa  1126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1399  DNA mismatch repair protein MutS  51.41 
 
 
892 aa  804  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  4.34224e-05 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1146  DNA mismatch repair protein MutS  52.91 
 
 
858 aa  882  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1998  DNA mismatch repair protein MutS  51.93 
 
 
885 aa  834  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  3.68418e-06 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1181  DNA mismatch repair protein MutS  45.7 
 
 
886 aa  688  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.690734 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1238  DNA mismatch repair protein MutS  52.91 
 
 
858 aa  855  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2107  DNA mismatch repair protein MutS  51.99 
 
 
885 aa  816  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.069343 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 
858 aa  1764  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  4.11572e-08 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01536  DNA mismatch repair protein MutS  54.05 
 
 
851 aa  889  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  41.98 
 
 
869 aa  692  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  3.95311e-05 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1437  DNA mismatch repair protein MutS  45.85 
 
 
870 aa  672  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.787998  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3218  DNA mismatch repair protein MutS  66.63 
 
 
855 aa  1144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.864156  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3030  DNA mismatch repair protein MutS  66.63 
 
 
855 aa  1145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03081  DNA mismatch repair protein(MutS)  62.8 
 
 
863 aa  1082  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3059  DNA mismatch repair protein MutS  66.51 
 
 
855 aa  1144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.725135 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  66.63 
 
 
855 aa  1145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3114  DNA mismatch repair protein MutS  66.63 
 
 
855 aa  1145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0090493 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1166  DNA mismatch repair protein MutS  54.32 
 
 
863 aa  899  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  42.2 
 
 
875 aa  682  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  41.46 
 
 
871 aa  648  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4050  DNA mismatch repair protein MutS  55.84 
 
 
857 aa  955  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.593835  hitchhiker  6.09956e-10 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  76.8 
 
 
862 aa  1355  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  40.8 
 
 
882 aa  635  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  76.92 
 
 
856 aa  1351  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>